More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4339 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4339  ribonuclease, Rne/Rng family  100 
 
 		 411 aa  832    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260891  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  50.61 
 
 		 559 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  49.39 
 
 		 564 aa  403  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  50.12 
 
 		 562 aa  399  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  45.3 
 
 		 494 aa  370  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  47.23 
 
 		 497 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  44.98 
 
 		 492 aa  340  4e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  44.26 
 
 		 496 aa  336  5e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  44.26 
 
 		 496 aa  335  7e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  43.72 
 
 		 503 aa  333  4e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  43.33 
 
 		 497 aa  331  1e-89  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2121  ribonuclease  45.87 
 
 		 474 aa  331  1e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000296404  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  43.33 
 
 		 497 aa  330  2e-89  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  43.09 
 
 		 503 aa  329  6e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2461  ribonuclease, Rne/Rng family  45.37 
 
 		 990 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  0.18702 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  43.69 
 
 		 908 aa  327  3e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  41.3 
 
 		 492 aa  326  4.0000000000000003e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1218  ribonuclease  43.53 
 
 		 1194 aa  326  5e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.993223 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  43.5 
 
 		 531 aa  325  9e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  45.05 
 
 		 702 aa  325  1e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  41.76 
 
 		 543 aa  323  3e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1453  ribonuclease  44.15 
 
 		 416 aa  323  5e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0187  ribonuclease G  41.5 
 
 		 487 aa  322  6e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5262  ribonuclease  43.41 
 
 		 1427 aa  320  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266118  normal  0.176556 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12490  ribonuclease, Rne/Rng family  44.83 
 
 		 1093 aa  320  3e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  42.75 
 
 		 483 aa  320  3.9999999999999996e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1609  ribonuclease  42.27 
 
 		 530 aa  320  3.9999999999999996e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1546  ribonuclease, Rne/Rng family  43.8 
 
 		 1041 aa  318  1e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.31372  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7272  Ribonuclease E  44.36 
 
 		 922 aa  317  3e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.159287 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12690  Ribonuclease E/G  44.47 
 
 		 485 aa  317  3e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211815  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1614  ribonuclease E and G  38.83 
 
 		 476 aa  316  5e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0133634  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11390  ribonuclease, Rne/Rng family  42.96 
 
 		 1265 aa  316  6e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.320924  hitchhiker  0.00951871 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  41.25 
 
 		 496 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3381  ribonuclease, Rne/Rng family  42.2 
 
 		 1007 aa  315  9.999999999999999e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  41.25 
 
 		 496 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  42.51 
 
 		 489 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  46.36 
 
 		 571 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0098  ribonuclease  41.11 
 
 		 517 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18280  ribonuclease, Rne/Rng family  42.45 
 
 		 952 aa  312  4.999999999999999e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0683615  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11530  RNAse G  42.93 
 
 		 959 aa  312  6.999999999999999e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0250639  normal  0.313443 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0842  RNAse G  44.23 
 
 		 492 aa  311  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0915958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0860  RNAse G  44.23 
 
 		 485 aa  311  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  42.27 
 
 		 489 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  42.27 
 
 		 489 aa  310  4e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1186  ribonuclease, Rne/Rng family  41.75 
 
 		 974 aa  309  5e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3192  ribonuclease G  43.26 
 
 		 500 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000845474  hitchhiker  1.74098e-16 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0541  ribonuclease, Rne/Rng family  40.38 
 
 		 515 aa  308  1.0000000000000001e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.353694 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2284  ribonuclease, Rne/Rng family  43.28 
 
 		 1117 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.436718  hitchhiker  0.00140455 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2082  ribonuclease  42.11 
 
 		 491 aa  307  3e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4159  ribonuclease E and G  44.71 
 
 		 485 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2900  ribonuclease, Rne/Rng family  42.24 
 
 		 495 aa  305  7e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4468  ribonuclease G  44.71 
 
 		 485 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.533978  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1587  ribonuclease, Rne/Rng family  41.93 
 
 		 1048 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0101858  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1506  ribonuclease  43.84 
 
 		 490 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00268  ribonuclease G  41.4 
 
 		 488 aa  304  2.0000000000000002e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2236  ribonuclease G  43.17 
 
 		 487 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03681  ribonuclease G  41.99 
 
 		 489 aa  303  3.0000000000000004e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3196  ribonuclease G  42.69 
 
 		 517 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2838  ribonuclease G  41.61 
 
 		 489 aa  303  4.0000000000000003e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.201847  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5091  cytoplasmic axial filament protein  42.31 
 
 		 485 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58100  cytoplasmic axial filament protein  43.03 
 
 		 485 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2724  ribonuclease  42.21 
 
 		 493 aa  302  5.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.590844  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002387  cytoplasmic axial filament protein CafA and Ribonuclease G  42.23 
 
 		 489 aa  302  6.000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2690  ribonuclease, Rne/Rng family  41.53 
 
 		 508 aa  302  9e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.251844  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2437  RNAse G  43.72 
 
 		 483 aa  302  9e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1719  ribonuclease, Rne/Rng family  41.61 
 
 		 495 aa  301  9e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3458  ribonuclease, Rne/Rng family  43.32 
 
 		 1244 aa  301  1e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4278  ribonuclease  43.03 
 
 		 485 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0898505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0944  ribonuclease  43.03 
 
 		 485 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1914  ribonuclease G  41.61 
 
 		 495 aa  301  2e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.105978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7273  ribonuclease, Rne/Rng family  42.44 
 
 		 1334 aa  301  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.584689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0977  ribonuclease  42.79 
 
 		 485 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0937  ribonuclease, Rne/Rng family  43.03 
 
 		 485 aa  299  7e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0487  ribonuclease G  42.23 
 
 		 489 aa  299  7e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0311265  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1941  ribonuclease  42.89 
 
 		 484 aa  298  9e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0724052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2266  ribonuclease, Rne/Rng family  42.27 
 
 		 1043 aa  298  9e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.454961  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1618  ribonuclease, Rne/Rng family  41.23 
 
 		 944 aa  298  1e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127332  normal  0.810349 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1472  ribonuclease, Rne/Rng family  41.13 
 
 		 1040 aa  296  4e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.800895  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3861  ribonuclease  41.15 
 
 		 1058 aa  296  4e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688294 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4556  ribonuclease G  40 
 
 		 485 aa  296  5e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2271  ribonuclease G  43.37 
 
 		 493 aa  295  9e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2393  ribonuclease  40.62 
 
 		 1113 aa  295  9e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380654  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3482  ribonuclease  41.15 
 
 		 1024 aa  295  1e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01887  ribonuclease G  41.53 
 
 		 499 aa  295  1e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0770  ribonuclease, Rne/Rng family  39.55 
 
 		 457 aa  295  1e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175551  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0469  ribonuclease, Rne/Rng family  44 
 
 		 503 aa  295  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.108374  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0471  ribonuclease G  42.34 
 
 		 502 aa  294  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03106  ribonuclease G  40.62 
 
 		 489 aa  293  3e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00482179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0460  ribonuclease, Rne/Rng family  40.62 
 
 		 489 aa  293  3e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.305617  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0469  ribonuclease G  41.65 
 
 		 489 aa  293  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0841799  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0402  ribonuclease G  41.65 
 
 		 489 aa  293  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.124199  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3729  ribonuclease G  40.62 
 
 		 489 aa  293  3e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0310546  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1194  ribonuclease G  41.65 
 
 		 489 aa  293  3e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00491576  hitchhiker  0.001915 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4563  ribonuclease G  40.62 
 
 		 489 aa  293  3e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00461139  normal  0.973198 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0460  ribonuclease G  40.62 
 
 		 489 aa  293  3e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0238321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0483  ribonuclease G  41.75 
 
 		 488 aa  293  3e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.605278 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3542  ribonuclease G  40.62 
 
 		 489 aa  293  3e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3436  ribonuclease G  40.62 
 
 		 489 aa  293  3e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0339083  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3278  ribonuclease G  40.62 
 
 		 489 aa  293  3e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0640043  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1502  ribonuclease, Rne/Rng family  40.59 
 
 		 1080 aa  293  4e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.69502  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>