More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0282 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  100 
 
 
363 aa  752    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  36.3 
 
 
309 aa  199  6e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  36.3 
 
 
309 aa  199  6e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  36.86 
 
 
305 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  36.46 
 
 
305 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2763  beta-lactamase  36.86 
 
 
305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2520  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  36.18 
 
 
305 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155828  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  36.18 
 
 
305 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  36.39 
 
 
305 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2485  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  36.18 
 
 
305 aa  192  9e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0277031  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2556  beta-lactamase  35.15 
 
 
305 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443651  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  35.15 
 
 
305 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5729  beta-lactamase  36.27 
 
 
389 aa  184  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  34.92 
 
 
323 aa  175  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3052  beta-lactamase  34.23 
 
 
313 aa  170  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  34.53 
 
 
340 aa  169  8e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3687  beta-lactamase  32.25 
 
 
342 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.057596  normal  0.380458 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1811  beta-lactamase  35.5 
 
 
356 aa  168  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4964  beta-lactamase  34.84 
 
 
335 aa  166  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.663595  normal  0.0104106 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2775  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  35.37 
 
 
315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.522634  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2815  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  34.35 
 
 
315 aa  164  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.22186  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3388  beta-lactamase  33.33 
 
 
342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  34.35 
 
 
315 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2194  beta-lactamase  35.25 
 
 
314 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179906 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1250  Beta-lactamase  33.89 
 
 
338 aa  162  6e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3085  hypothetical protein  34.01 
 
 
315 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2842  hypothetical protein  34.69 
 
 
315 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.653108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3056  hypothetical protein  34.69 
 
 
315 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0766054  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  30.5 
 
 
524 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2638  beta-lactamase  30.16 
 
 
387 aa  160  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2835  beta-lactamase  32.89 
 
 
315 aa  159  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00277998  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3087  hypothetical protein  33.67 
 
 
315 aa  159  9e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  30.28 
 
 
598 aa  157  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1128  beta-lactamase  31.44 
 
 
337 aa  155  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.170129  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  30.61 
 
 
530 aa  150  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2259  beta-lactamase  28.57 
 
 
337 aa  149  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.777809  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1083  beta-lactamase  31.75 
 
 
328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  29.21 
 
 
366 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  33.69 
 
 
530 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2235  hypothetical protein  27.67 
 
 
346 aa  139  7e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1949  beta-lactamase  31.08 
 
 
486 aa  138  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1198  beta-lactamase  31.32 
 
 
333 aa  138  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.98564  normal  0.588017 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0910  beta-lactamase  27.33 
 
 
353 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5027  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  29.72 
 
 
476 aa  136  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  decreased coverage  0.0061347 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  27.24 
 
 
380 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  27.24 
 
 
380 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  32.2 
 
 
505 aa  133  6e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  29.02 
 
 
640 aa  131  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5602  beta-lactamase  31.42 
 
 
475 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  27.97 
 
 
328 aa  127  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1926  beta-lactamase  30.69 
 
 
387 aa  126  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.449475  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5881  beta-lactamase  30.4 
 
 
475 aa  126  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4213  beta-lactamase  29.82 
 
 
504 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.780595  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  30.86 
 
 
390 aa  123  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0635  beta-lactamase  26.9 
 
 
327 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1284  beta-lactamase  29.93 
 
 
462 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0017  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  30.13 
 
 
468 aa  119  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  27.18 
 
 
384 aa  119  7e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  29.32 
 
 
389 aa  119  7e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  31 
 
 
395 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  28.93 
 
 
417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  30.42 
 
 
384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  26.82 
 
 
503 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0995  putative hydrolase transmembrane protein  30.48 
 
 
491 aa  113  5e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.730938  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  25.55 
 
 
397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  28.99 
 
 
412 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  29.6 
 
 
401 aa  110  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3665  beta-lactamase  26.67 
 
 
374 aa  110  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0974173 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1129  beta-lactamase  26.89 
 
 
372 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0832  beta-lactamase  29.01 
 
 
378 aa  109  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451427  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5369  beta-lactamase  29.17 
 
 
432 aa  109  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.545883 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  28.78 
 
 
368 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1495  putative hydrolase transmembrane protein  27.6 
 
 
456 aa  107  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.713415  normal  0.585878 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  29.29 
 
 
371 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1179  beta-lactamase  30.37 
 
 
449 aa  107  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03585  hypothetical protein  28.52 
 
 
383 aa  105  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45249  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  28.26 
 
 
473 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  28.26 
 
 
473 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  27.6 
 
 
360 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  30.82 
 
 
413 aa  105  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  28.26 
 
 
473 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  29.06 
 
 
382 aa  104  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2343  beta-lactamase  27.12 
 
 
309 aa  103  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  27.54 
 
 
467 aa  102  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4792  beta-lactamase  27.54 
 
 
467 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3326  beta-lactamase  26.14 
 
 
481 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0484154 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0319  putative beta-lactamase  25.45 
 
 
455 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.833917  normal  0.501894 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37730  beta-lactamase class C protein  28.42 
 
 
371 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  26.46 
 
 
396 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4462  beta-lactamase  28.37 
 
 
362 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210437  hitchhiker  0.0088578 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  27.54 
 
 
466 aa  99.8  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3104  putative Beta-lactamase  28.53 
 
 
463 aa  99.8  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0822  beta-lactamase  26.03 
 
 
483 aa  99.8  7e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.242788 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28 
 
 
425 aa  99.4  9e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4047  Beta-lactamase  26.82 
 
 
368 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0190  beta-lactamase  26.77 
 
 
476 aa  99  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0889  beta-lactamase  25.67 
 
 
378 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1289  Beta-lactamase  27.43 
 
 
359 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2109  beta-lactamase  29.89 
 
 
453 aa  97.8  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.175028 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0928  beta-lactamase  26.39 
 
 
359 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>