More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4179 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4179  NLP/P60 protein  100 
 
 		 168 aa  350  5e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0481386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1158  NLP/P60 protein  54.01 
 
 		 181 aa  169  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1426  NLP/P60 protein  36.88 
 
 		 165 aa  122  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0721  NLP/P60 family protein  35.53 
 
 		 202 aa  105  3e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.638789 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1954  NLP/P60 protein  39.37 
 
 		 384 aa  104  7e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3653  NLP/P60 protein  37.11 
 
 		 232 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013969  normal  0.207873 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2100  NLP/P60 protein  41.46 
 
 		 302 aa  101  5e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  39.74 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3275  NLP/P60 protein  35.43 
 
 		 181 aa  99.8  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.459641  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0897  NLP/P60 family protein  40.58 
 
 		 231 aa  99.4  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.624146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2523  NLP/P60 protein  41.18 
 
 		 189 aa  98.2  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000113171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0791  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)-like  36.46 
 
 		 221 aa  97.8  6e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0670  NLP/P60 protein  40 
 
 		 207 aa  97.8  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.160252 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1344  NLP/P60 protein  36.69 
 
 		 207 aa  96.7  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  36.69 
 
 		 208 aa  96.3  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  36.09 
 
 		 207 aa  95.1  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  32.68 
 
 		 216 aa  94.4  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0057  lipoprotein  30.3 
 
 		 174 aa  94.4  6e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.438446  hitchhiker  0.00939156 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  35 
 
 		 188 aa  93.6  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  41.1 
 
 		 208 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  41.1 
 
 		 208 aa  90.9  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  41.1 
 
 		 207 aa  90.9  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0091  NLP/P60  32.92 
 
 		 170 aa  90.1  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2940  NLP/P60 protein  34.93 
 
 		 217 aa  88.6  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.284799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  42.22 
 
 		 208 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  32.73 
 
 		 333 aa  88.2  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2408  NLP/P60 family lipoprotein  32.97 
 
 		 407 aa  87.8  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166866  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2476  NLP/P60 protein  32.64 
 
 		 214 aa  87.8  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.188506  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  39.2 
 
 		 257 aa  87.8  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1397  NLP/P60 family lipoprotein  32.97 
 
 		 407 aa  87.8  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.929375  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1160  NLP/P60 family lipoprotein  32.97 
 
 		 407 aa  87.8  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.812731  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  42.28 
 
 		 217 aa  87.4  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1887  NLP/P60 family lipoprotein  32.97 
 
 		 407 aa  87.8  7e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.850579  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0009  NLP/P60 family lipoprotein  32.97 
 
 		 407 aa  87.8  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30529  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2283  NlpC/P60 family lipoprotein  32.97 
 
 		 404 aa  87.8  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2244  NlpC/P60 family lipoprotein  32.97 
 
 		 404 aa  87.8  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  39.84 
 
 		 255 aa  86.7  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1890  NLP/P60 protein  32.79 
 
 		 363 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00780805  hitchhiker  0.0000000811276 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2166  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 194 aa  85.9  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343346  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6213  NLP/P60  32.79 
 
 		 363 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1866  NLP/P60 protein  32.79 
 
 		 363 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  36.96 
 
 		 192 aa  85.5  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1407  NLP/P60 protein  32.42 
 
 		 369 aa  85.5  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.374528 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1734  NLP/P60 protein  34.38 
 
 		 154 aa  85.1  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  36.96 
 
 		 192 aa  85.1  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2186  NLP/P60 family lipoprotein  32.6 
 
 		 407 aa  85.1  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2584  NLP/P60 protein  37.93 
 
 		 205 aa  84.7  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.416294  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04820  hypothetical protein  35.71 
 
 		 186 aa  84.7  6e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2393  putative transmembrane lipoprotein  39.32 
 
 		 404 aa  84.3  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951834  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  33.55 
 
 		 150 aa  84  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1794  NLP/P60 protein  39.32 
 
 		 418 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435053  hitchhiker  0.00883906 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4966  NLP/P60 protein  32.1 
 
 		 169 aa  83.6  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2446  NLP/P60 protein  35 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0919  NLP/P60 protein  33.88 
 
 		 382 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0475791  normal  0.21921 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  39.53 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  32.75 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5167  NLP/P60 family lipoprotein  31.35 
 
 		 364 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  39.53 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0781  NLP/P60 protein  35.77 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0199  NLP/P60 protein  34.72 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  35.46 
 
 		 274 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1804  NLP/P60 protein  30.77 
 
 		 354 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30760  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  52.17 
 
 		 261 aa  81.6  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.787895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1776  NLP/P60 protein  30.77 
 
 		 353 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2420  NLP/P60 protein  35.94 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  36.07 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  39.53 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  39.2 
 
 		 224 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2784  putative outer membrane lipoprotein  37.72 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2707  putative outer membrane lipoprotein  37.72 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  35.94 
 
 		 424 aa  81.3  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2028  NLP/P60 protein  31.98 
 
 		 233 aa  81.3  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1501  putative outer membrane lipoprotein  37.72 
 
 		 172 aa  80.9  0.000000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  38.66 
 
 		 269 aa  80.9  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  38.66 
 
 		 269 aa  80.9  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  38.4 
 
 		 218 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  38.4 
 
 		 224 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  38.4 
 
 		 218 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  38.4 
 
 		 218 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  38.4 
 
 		 218 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  30.11 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  30.11 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  30.11 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  30.11 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  38.4 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  38.4 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  30.11 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  38.4 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2022  NLP/P60 family protein  41.59 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  38.4 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  30.11 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  38.4 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  38.4 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  30.11 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  30.11 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  38.4 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  38.4 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  34.53 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  32.52 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  39.2 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>