90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3039 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3039  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 112 aa  234  4e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.124018 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4192  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.24 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  hitchhiker  0.00969198 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1368  hypothetical protein  38.1 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.505892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1863  cupin 2 domain-containing protein  41.98 
 
 		 100 aa  67.4  0.00000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.524548 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11503  putative pectin degradation protein  42.86 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.380023  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7186  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.93 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.58 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0865  cupin 2 domain-containing protein  37.63 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1396  cupin 2 domain-containing protein  40.74 
 
 		 102 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3670  cupin 2 domain-containing protein  37.21 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183912  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0847  cupin 2 domain-containing protein  35.11 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1504  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.58 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2840  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.71 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.862394  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2268  cupin 2 domain-containing protein  34.88 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3287  cupin 2 domain-containing protein  38.37 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.927122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0731  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 112 aa  62  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00910188  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3105  cupin 2 domain-containing protein  43.75 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1794  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  38.14 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.78 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1005  cupin 2 domain-containing protein  28.41 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000921  putative pectin degradation protein  36.36 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3553  cupin 2 domain-containing protein  38.89 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6741  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.06 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.302286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2041  cupin 2 domain-containing protein  31.19 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267736 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3323  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.52 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00344723  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.06 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3283  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.88 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.219448 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2189  cupin 2 domain-containing protein  40.79 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.525757  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2699  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.94 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145082  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0780  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1457  hypothetical protein  37.36 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.69 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.38 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3290  cupin 2 domain-containing protein  29.07 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4592  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.16 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.56 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1026  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.44 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.208422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0483  cupin 2 domain-containing protein  33.02 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.23 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8499800000000002e-33 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1659  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.74 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0837  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168826 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0571  pectin degradation protein kdgF  34.15 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4742  cupin 2 domain-containing protein  32.14 
 
 		 111 aa  50.8  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000930389 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3893  pectin degradation protein  35.64 
 
 		 113 aa  50.8  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1168  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.22 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2453  cupin domain-containing protein  34.15 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2655  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  35.9 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.104374  hitchhiker  0.00638268 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1710  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.99 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2589  pectin degradation protein KdgF  34.15 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933509  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0257  cupin 2 domain-containing protein  36.23 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0889  hypothetical protein  34.15 
 
 		 169 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.91 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0833  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.19 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.34 
 
 		 166 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2538  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.56 
 
 		 107 aa  47  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0103935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3773  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.59 
 
 		 421 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.239832  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2777  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.08 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0722963  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2471  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.08 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.285762  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4530  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.812738  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1696  cupin domain-containing protein  32.88 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0317  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.14 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.743706  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1805  cupin 2 domain-containing protein  32.88 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.241802  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 189 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2641  pectin degradation protein  33.33 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.229328 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1966  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.88 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.290809  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0274  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  32.81 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  31.33 
 
 		 152 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0483  hypothetical protein  35.14 
 
 		 100 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.654168  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1985  hypothetical protein  28.12 
 
 		 111 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000280772  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3518  cupin 2 domain-containing protein  34.55 
 
 		 140 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2135  cupin 2 domain-containing protein  35.14 
 
 		 100 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.769565  normal  0.829686 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 191 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2019  cupin region  30.67 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.935126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2685  hypothetical protein  28.09 
 
 		 152 aa  41.2  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal  0.254874 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0302  L-ectoine synthase  29.59 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0802  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.18 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  36.21 
 
 		 191 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1623  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.49 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0320  cupin 2 domain-containing protein  28.41 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.864661  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0495  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  34.29 
 
 		 460 aa  40.8  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1973  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.89 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.246266  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0850  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  33.77 
 
 		 477 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0538  cupin 2, barrel  29.58 
 
 		 111 aa  40.4  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.426321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0994  hypothetical protein  30.67 
 
 		 117 aa  40.4  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2352  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.44 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1911  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.89 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0258222  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0542  cupin 2, barrel  29.35 
 
 		 122 aa  40  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3617  hypothetical protein  38.6 
 
 		 278 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2303  hypothetical protein  35.44 
 
 		 109 aa  40  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000111298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>