More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3510 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3510  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  100 
 
 		 370 aa  762    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3691  peptidase M48, Ste24p  27.14 
 
 		 359 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2756  peptidase M48, Ste24p  28.93 
 
 		 354 aa  97.1  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114844  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0462  M48 family peptidase  31.42 
 
 		 357 aa  96.7  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169095  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3237  peptidase M48 Ste24p  28.04 
 
 		 378 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6656  putative metalloendopeptidase  27.22 
 
 		 383 aa  94.7  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1147  peptidase M48 Ste24p  39.19 
 
 		 363 aa  90.9  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0642  peptidase M48, Ste24p  32.75 
 
 		 347 aa  89.4  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2014  peptidase M48 Ste24p  27.84 
 
 		 378 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.700955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2290  peptidase M48 Ste24p  27.49 
 
 		 378 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.323007 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  29.33 
 
 		 264 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3399  peptidase M48 Ste24p  26.75 
 
 		 362 aa  84  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0581  peptidase M48 Ste24p  25.48 
 
 		 361 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.380263 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1976  peptidase M48 Ste24p  28.62 
 
 		 373 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88766  normal  0.175052 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2801  peptidase M48, Ste24p  28.05 
 
 		 341 aa  80.5  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.57827 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  28.79 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0537  peptidase M48 Ste24p  25.24 
 
 		 364 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  26.29 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1120  peptidase M48 Ste24p  26.57 
 
 		 354 aa  77  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597091  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03032  peptidase  24.41 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  26.98 
 
 		 268 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0514  peptidase M48 Ste24p  24.14 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0802067  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0990  peptidase M48 Ste24p  32.14 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218091  normal  0.424626 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0644  putative transmembrane protein  24.89 
 
 		 358 aa  72  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0188  peptidase M48 Ste24p  27.22 
 
 		 632 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0456  peptidase M48 Ste24p  27.04 
 
 		 395 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3470  peptidase M48 Ste24p  25.37 
 
 		 343 aa  71.6  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  29.85 
 
 		 502 aa  71.2  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0183  peptidase M48 Ste24p  27.22 
 
 		 632 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.457604 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5225  peptidase M48 Ste24p  25.47 
 
 		 358 aa  70.5  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.32225 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  32.18 
 
 		 436 aa  70.9  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  26.64 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4269  hypothetical protein  32.57 
 
 		 513 aa  70.5  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1953  peptidase M48, Ste24p  25.96 
 
 		 367 aa  70.1  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0119619  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0813  peptidase M48 Ste24p  32.14 
 
 		 365 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0096  peptidase M48, Ste24p  28.64 
 
 		 348 aa  69.7  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.220235  normal  0.168407 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0844  peptidase M48 Ste24p  27.34 
 
 		 470 aa  69.3  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000290245  normal  0.0785618 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4143  peptidase M48, Ste24p  24.03 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.724866  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  24.63 
 
 		 492 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2077  putative Zn-dependent protease  27.39 
 
 		 336 aa  68.6  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  25.33 
 
 		 494 aa  68.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0964  peptidase M48, Ste24p  28.5 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  28.04 
 
 		 489 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  29.34 
 
 		 489 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3721  peptidase M48, Ste24p  31.33 
 
 		 377 aa  67.4  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0533853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1448  peptidase M48 Ste24p  28.34 
 
 		 469 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.749654  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1260  hypothetical protein  31.55 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.617614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  29.34 
 
 		 489 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1555  peptidase M48, Ste24p  26.13 
 
 		 481 aa  67.4  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  25.53 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0829  peptidase M48 Ste24p  26.34 
 
 		 351 aa  67  0.0000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3110  peptidase M48 Ste24p  31.46 
 
 		 503 aa  66.6  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1099  peptidase M48, Ste24p  26.56 
 
 		 365 aa  66.6  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000343868  hitchhiker  0.000201004 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3686  peptidase M48 Ste24p  26.96 
 
 		 383 aa  66.2  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2182  peptidase M48, Ste24p  29.73 
 
 		 349 aa  66.2  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  27.53 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166595  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2378  peptidase M48 Ste24p  27.88 
 
 		 640 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3004  peptidase M48 Ste24p  32.34 
 
 		 374 aa  66.2  0.0000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.558677  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3812  peptidase M48 Ste24p  32.02 
 
 		 513 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  29.17 
 
 		 493 aa  65.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1000  peptidase M48, Ste24p  27.86 
 
 		 269 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0388  peptidase M48 Ste24p  32.48 
 
 		 349 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0132188  normal  0.117009 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3622  peptidase M48 Ste24p  27.24 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4141  peptidase M48 Ste24p  30.9 
 
 		 482 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0703431  normal  0.108462 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2122  TPR repeat-containing protein  26.37 
 
 		 483 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318434  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2222  peptidase M48 Ste24p  32.94 
 
 		 445 aa  64.7  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  27.05 
 
 		 605 aa  64.7  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0962  peptidase M48, Ste24p  27.5 
 
 		 269 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00197465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  25.4 
 
 		 489 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0093  putative signal peptide protein  28.73 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.485946  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  27.36 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0246  peptidase M48, Ste24p  32.73 
 
 		 442 aa  64.3  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  28.05 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2381  peptidase M48, Ste24p  29.47 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0402  peptidase M48, Ste24p  28.42 
 
 		 529 aa  63.5  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0670  peptidase M48, Ste24p  27.32 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00234542  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2400  peptidase M48, Ste24p  28.93 
 
 		 550 aa  63.5  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0992443  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3919  peptidase M48, Ste24p  30.05 
 
 		 549 aa  63.5  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749041  hitchhiker  0.000945115 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  27.07 
 
 		 480 aa  63.5  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0277  peptidase M48, Ste24p  30.37 
 
 		 497 aa  63.5  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4490  peptidase M48 Ste24p  28.73 
 
 		 494 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3262  peptidase M48, Ste24p  28.11 
 
 		 480 aa  63.5  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.742551  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  24.29 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3534  peptidase M48, Ste24p  26.99 
 
 		 383 aa  63.2  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4669  peptidase M48, Ste24p  31.38 
 
 		 514 aa  63.2  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  29.94 
 
 		 479 aa  62  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0872  M48 family peptidase  26.11 
 
 		 348 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  25.23 
 
 		 263 aa  62.4  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  27.71 
 
 		 282 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3664  peptidase M48 Ste24p  26.11 
 
 		 348 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3535  M48 family peptidase  26.11 
 
 		 348 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4104  peptidase M48 Ste24p  28.57 
 
 		 316 aa  62.4  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000775761 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1048  peptidase M48 Ste24p  27.75 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265758  hitchhiker  0.000000297579 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3529  peptidase M48 Ste24p  27.75 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000517295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3160  peptidase M48 Ste24p  29.67 
 
 		 514 aa  62  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.404677 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3404  peptidase M48 Ste24p  27.75 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000146898  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3308  peptidase M48 Ste24p  27.75 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000556254  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0127  M48 family peptidase  32.14 
 
 		 471 aa  61.6  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5912  peptidase M48 Ste24p  27.55 
 
 		 493 aa  62  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0135228  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0326  peptidase M48 Ste24p  32.89 
 
 		 353 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.988889  normal  0.269331 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>