More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1286 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1286  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
1187 aa  2382    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2769  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.59 
 
 
773 aa  223  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.21 
 
 
902 aa  210  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  35.7 
 
 
1177 aa  207  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0118  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.21 
 
 
1927 aa  203  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125924 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.9 
 
 
882 aa  202  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  30.75 
 
 
544 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.6 
 
 
1313 aa  198  5.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1765  histidine kinase  34.05 
 
 
462 aa  196  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000595997  normal  0.0193451 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.91 
 
 
1075 aa  196  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.3 
 
 
1410 aa  193  2e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0500  histidine kinase  28.64 
 
 
940 aa  193  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.24 
 
 
803 aa  192  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.8 
 
 
674 aa  192  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.75 
 
 
1768 aa  191  5e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 
929 aa  191  5e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.35 
 
 
1765 aa  191  5.999999999999999e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.58 
 
 
1166 aa  190  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1265  sensor histidine kinase/response regulator  34.41 
 
 
445 aa  189  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.127041  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  30.36 
 
 
1763 aa  189  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1052  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.73 
 
 
1699 aa  189  3e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  34.42 
 
 
661 aa  189  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0318  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.6 
 
 
1223 aa  189  4e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.455432  normal  0.438074 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.22 
 
 
791 aa  188  4e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  29.34 
 
 
1765 aa  188  5e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.46 
 
 
816 aa  188  5e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.42 
 
 
1691 aa  188  5e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3335  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.7 
 
 
1122 aa  188  5e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3502  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.18 
 
 
1236 aa  187  9e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.65 
 
 
1203 aa  187  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.88 
 
 
763 aa  187  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.58 
 
 
932 aa  187  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.33 
 
 
1193 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1087  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.31 
 
 
1121 aa  186  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.740067  hitchhiker  0.00000751372 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.5 
 
 
1234 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.33 
 
 
1193 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.62 
 
 
1230 aa  186  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.09 
 
 
639 aa  186  3e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.43 
 
 
780 aa  186  3e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.74 
 
 
1271 aa  185  4.0000000000000006e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.88 
 
 
989 aa  185  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  31.44 
 
 
1331 aa  184  6e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.52 
 
 
1582 aa  184  6e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3129  sensory box histidine kinase/response regulator  32.35 
 
 
1236 aa  184  6e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  33.59 
 
 
923 aa  184  7e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1497  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.43 
 
 
880 aa  184  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.27 
 
 
1767 aa  184  7e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.96 
 
 
717 aa  184  8.000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.15 
 
 
1767 aa  184  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.27 
 
 
1767 aa  184  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0501  histidine kinase  27.04 
 
 
955 aa  184  9.000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3798  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.52 
 
 
864 aa  183  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.89 
 
 
969 aa  183  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3232  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.43 
 
 
1118 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.8 
 
 
870 aa  182  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.75 
 
 
1398 aa  182  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.87 
 
 
1363 aa  182  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.77 
 
 
896 aa  182  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  32.24 
 
 
631 aa  182  4e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.65 
 
 
977 aa  182  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.24 
 
 
989 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0667  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.11 
 
 
1343 aa  181  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.73 
 
 
1397 aa  181  7e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2502  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.62 
 
 
957 aa  181  7e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000217317 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0370  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.97 
 
 
1070 aa  181  7e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3852  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.71 
 
 
879 aa  181  8e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0452097  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.83 
 
 
1238 aa  181  9e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.3 
 
 
1771 aa  180  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1199  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.85 
 
 
962 aa  181  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.83 
 
 
1238 aa  180  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.83 
 
 
1238 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.96 
 
 
911 aa  179  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.64 
 
 
947 aa  179  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0577  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.25 
 
 
1005 aa  179  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0920445  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3110  putative integral membrane sensor protein  32.35 
 
 
1141 aa  180  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0940316 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  32.84 
 
 
1188 aa  179  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.19 
 
 
981 aa  179  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.811836  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0538  ATP-binding region, ATPase-like protein  33.42 
 
 
1233 aa  179  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0620  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.7 
 
 
645 aa  179  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0791  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.16 
 
 
1118 aa  178  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.84 
 
 
1236 aa  178  4e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  30 
 
 
1683 aa  178  5e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3041  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.41 
 
 
873 aa  178  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616698  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.84 
 
 
1236 aa  178  5e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 
1238 aa  178  5e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.84 
 
 
1236 aa  178  6e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3075  histidine kinase  31.48 
 
 
550 aa  177  9e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798755 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.05 
 
 
1267 aa  177  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  32.31 
 
 
2035 aa  177  9.999999999999999e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  32.24 
 
 
1200 aa  177  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  29.43 
 
 
1179 aa  177  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.17 
 
 
1234 aa  177  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.32 
 
 
785 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.69 
 
 
1784 aa  176  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.69 
 
 
1792 aa  176  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.61 
 
 
907 aa  176  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0578  histidine kinase  28.16 
 
 
732 aa  176  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2948  histidine kinase  33.24 
 
 
800 aa  176  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549542  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4954  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.91 
 
 
1016 aa  176  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0561599 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.69 
 
 
1786 aa  176  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>