147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1467 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1467  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
1948 aa  4051    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160999  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0302  putative helicase  27.57 
 
 
1878 aa  548  1e-154  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1964  helicase domain protein  28.29 
 
 
1780 aa  511  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.285846  normal  0.0141604 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1679  helicase superfamily protein  36.74 
 
 
1784 aa  218  8e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1673  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.1 
 
 
1589 aa  209  4e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2269  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  21.84 
 
 
1607 aa  194  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0631  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.28 
 
 
1740 aa  183  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3298  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.08 
 
 
1741 aa  180  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0293  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.71 
 
 
1787 aa  179  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0588  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.74 
 
 
1759 aa  144  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0240  helicase superfamily protein  31.35 
 
 
2097 aa  145  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1404  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.16 
 
 
1602 aa  137  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3253  DEAD/DEAH box helicase-like  23.32 
 
 
2093 aa  128  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.224571  normal  0.0428877 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2038  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.25 
 
 
2120 aa  115  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.104871 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2319  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.24 
 
 
1525 aa  109  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102202  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1124  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  24.42 
 
 
1561 aa  105  8e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.416463  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1539  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.21 
 
 
1542 aa  101  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0511  helicase  26.71 
 
 
1578 aa  100  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.769472  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2494  hypothetical protein  24.7 
 
 
2106 aa  99.4  6e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0806  DEAD/DEAH box helicase-like protein  25.62 
 
 
1543 aa  87.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.62 
 
 
1543 aa  87.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.301369 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4091  helicase domain-containing protein  27.89 
 
 
1422 aa  87  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1319  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.23 
 
 
2213 aa  87  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1675  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.1 
 
 
2104 aa  86.3  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5422  helicase superfamily protein  27.65 
 
 
2224 aa  85.5  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.383128 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4093  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.94 
 
 
685 aa  83.6  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.317776  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4896  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.21 
 
 
2113 aa  82.8  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0833  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  22.12 
 
 
1765 aa  81.6  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.888983 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7833  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.37 
 
 
1723 aa  81.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1711  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.36 
 
 
1764 aa  80.9  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3883  helicase superfamily protein  26.15 
 
 
2113 aa  81.3  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0319703  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4830  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.15 
 
 
2113 aa  81.3  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5810  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.15 
 
 
2113 aa  81.3  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2015  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.61 
 
 
1743 aa  79.3  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.724661  normal  0.480876 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4772  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.5 
 
 
1741 aa  79  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.232543 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1353  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.43 
 
 
2099 aa  78.2  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1527  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.05 
 
 
1725 aa  77.8  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.46826  normal  0.102614 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0274  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.25 
 
 
1754 aa  77.8  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2672  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.27 
 
 
1770 aa  77.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.47983 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3350  hypothetical protein  23.82 
 
 
1838 aa  77.4  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.168378  normal  0.500488 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4827  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.49 
 
 
2104 aa  75.5  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2590  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.13 
 
 
1672 aa  75.9  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000259422 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2860  helicase domain protein  28.15 
 
 
459 aa  74.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00993541  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2729  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.25 
 
 
1722 aa  75.5  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.631527  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35200  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  26.96 
 
 
2082 aa  75.1  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3886  helicase superfamily protein  23 
 
 
2104 aa  74.7  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5807  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.49 
 
 
2104 aa  74.3  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.04 
 
 
1723 aa  73.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1302  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.04 
 
 
1719 aa  73.6  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3296  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.24 
 
 
1734 aa  73.6  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0223  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.37 
 
 
1711 aa  70.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.229884  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0352  DEAD/DEAH box helicase-like  39.64 
 
 
1704 aa  70.1  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1954  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41 
 
 
1695 aa  70.1  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1543  DEAD/DEAH box helicase-like protein  25.63 
 
 
1711 aa  69.7  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2665  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.65 
 
 
1698 aa  68.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3086  helicase superfamily protein  24.87 
 
 
2125 aa  67.4  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.652376  hitchhiker  0.00603337 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1418  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.5 
 
 
2136 aa  66.2  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411331  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0354  Protein of unknown function DUF1998  47.56 
 
 
2087 aa  66.2  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1002  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.48 
 
 
739 aa  64.3  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1523  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.51 
 
 
744 aa  64.7  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.750209  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1303  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.46 
 
 
756 aa  63.9  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000031195  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0220  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.83 
 
 
902 aa  60.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0370  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.93 
 
 
778 aa  60.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0213184  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1650  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.8 
 
 
751 aa  61.6  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1391  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.93 
 
 
781 aa  61.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.036578  normal  0.532638 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3881  Protein of unknown function DUF1998  28.77 
 
 
795 aa  61.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.911773  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1457  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.37 
 
 
744 aa  58.2  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.507421  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0493  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.11 
 
 
815 aa  57.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0546  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.23 
 
 
740 aa  58.2  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0742  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.19 
 
 
1861 aa  58.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0601  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.58 
 
 
848 aa  56.6  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.502776  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1020  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.14 
 
 
744 aa  56.2  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  1.28402e-16 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0283  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.05 
 
 
807 aa  56.2  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.926162  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4829  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.25 
 
 
807 aa  55.8  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4799  DEAD/DEAH box helicase-like protein  33.33 
 
 
775 aa  55.5  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4885  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.33 
 
 
775 aa  55.5  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60576  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5399  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.4 
 
 
782 aa  55.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.265021  normal  0.178291 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5185  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.33 
 
 
775 aa  55.5  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159348 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5321  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.61 
 
 
764 aa  55.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0653251  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13678  helicase  31.73 
 
 
771 aa  55.5  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00132558  normal  0.157688 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.82 
 
 
738 aa  54.7  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0482  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.69 
 
 
812 aa  54.7  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.016003  hitchhiker  0.00542226 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2218  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.23 
 
 
861 aa  54.7  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.344745 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8451  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.67 
 
 
806 aa  53.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113754 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1443  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.87 
 
 
803 aa  53.9  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111055  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28840  putative helicase  41.82 
 
 
736 aa  53.5  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474734  decreased coverage  0.00000000117417 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1162  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.73 
 
 
764 aa  53.5  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0572  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.6 
 
 
775 aa  53.1  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.29 
 
 
768 aa  53.1  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.199645  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25230  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  29.51 
 
 
780 aa  52.4  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0012  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.8 
 
 
762 aa  52.4  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0793231  hitchhiker  0.00171802 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0123  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  29.77 
 
 
761 aa  52  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0336832  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4429  DEAD/DEAH box helicase  44 
 
 
740 aa  52  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.306961  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.9 
 
 
744 aa  51.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3741  Protein of unknown function DUF1998  35.59 
 
 
2124 aa  52  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0060  DEAD/DEAH box helicase-like  31.03 
 
 
906 aa  50.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0763729  normal  0.477512 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2941  putative DEAD/DEAH box helicase  24.84 
 
 
1475 aa  50.8  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0313  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.53 
 
 
815 aa  50.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4978  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.68 
 
 
739 aa  50.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1247  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.78 
 
 
743 aa  50.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000127914 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>