More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2380 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2380  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
233 aa  480  1e-135  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2113  undecaprenyl diphosphate synthase  65.04 
 
 
247 aa  311  5.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1945  undecaprenyl diphosphate synthase  65.04 
 
 
231 aa  309  2e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.77987 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2918  undecaprenyl diphosphate synthase  63.68 
 
 
250 aa  304  8.000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.15769 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1126  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  60.18 
 
 
243 aa  297  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0518  undecaprenyl diphosphate synthase  62.83 
 
 
280 aa  276  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  52.44 
 
 
256 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_317  undecaprenyl diphosphate synthase  50.89 
 
 
236 aa  250  1e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0373  undecaprenyl diphosphate synthase  50.45 
 
 
236 aa  250  2e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0355  undecaprenyl diphosphate synthase  49.55 
 
 
236 aa  246  3e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.580646  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.75 
 
 
249 aa  245  6e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  48.92 
 
 
282 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.13 
 
 
256 aa  241  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.44 
 
 
253 aa  241  1e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.44 
 
 
253 aa  241  1e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  47.83 
 
 
276 aa  238  6.999999999999999e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1782  undecaprenyl diphosphate synthase  50.87 
 
 
248 aa  238  6.999999999999999e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  46.09 
 
 
276 aa  235  5.0000000000000005e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1750  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  47.41 
 
 
291 aa  234  9e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.57 
 
 
246 aa  234  9e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.57 
 
 
249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0444  undecaprenyl diphosphate synthase  49.35 
 
 
228 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00160687  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3929  undecaprenyl diphosphate synthase  51.1 
 
 
236 aa  233  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.709304  normal  0.124781 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  51.3 
 
 
251 aa  232  3e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81385e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.57 
 
 
249 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  50 
 
 
285 aa  232  4.0000000000000004e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  47.14 
 
 
234 aa  231  1e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0685  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.58 
 
 
259 aa  230  1e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000229491  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2015  undecaprenyl diphosphate synthase  50.66 
 
 
236 aa  230  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.766228  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  47.11 
 
 
263 aa  230  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.57 
 
 
246 aa  229  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.221115  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1917  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.83 
 
 
246 aa  229  3e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1393  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.22 
 
 
260 aa  229  3e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0177  undecaprenyl diphosphate synthase  47.51 
 
 
244 aa  229  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000336524  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0398  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.39 
 
 
282 aa  229  3e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216703  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.56 
 
 
256 aa  227  1e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  45.65 
 
 
272 aa  227  1e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14881  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.56 
 
 
256 aa  227  1e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.574217 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  48.92 
 
 
246 aa  227  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3706  undecaprenyl diphosphate synthase  48.25 
 
 
255 aa  225  4e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0594  undecaprenyl diphosphate synthase  45.25 
 
 
232 aa  225  4e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0529  undecaprenyl diphosphate synthase  47.14 
 
 
241 aa  224  8e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48 
 
 
259 aa  224  8e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0709  undecaprenyl diphosphate synthase  48.67 
 
 
259 aa  224  1e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0105503  unclonable  0.000000024348 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3921  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.22 
 
 
257 aa  223  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.878425  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1323  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.22 
 
 
258 aa  223  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.364051  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2475  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.78 
 
 
258 aa  223  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000367791  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  44.44 
 
 
247 aa  222  3e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3564  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.22 
 
 
258 aa  222  3e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3582  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.22 
 
 
258 aa  222  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3870  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.22 
 
 
258 aa  222  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386864  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3835  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.22 
 
 
258 aa  222  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3864  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.22 
 
 
258 aa  222  4e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.281196  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3674  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.22 
 
 
258 aa  222  4e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.56489  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3961  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.22 
 
 
258 aa  222  4e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2048  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.09 
 
 
251 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.454425  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.28 
 
 
237 aa  222  4.9999999999999996e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16161  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0190  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.55 
 
 
254 aa  221  6e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.763759 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1051  undecaprenyl diphosphate synthase  46.09 
 
 
253 aa  221  6e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000164156  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  48.48 
 
 
240 aa  221  7e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.85 
 
 
257 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1193  undecaprenyl diphosphate synthase  46.67 
 
 
238 aa  220  9.999999999999999e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000857215  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.52 
 
 
258 aa  220  9.999999999999999e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3646  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.78 
 
 
258 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0097469  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  44.25 
 
 
249 aa  220  9.999999999999999e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.18 
 
 
249 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1960  undecaprenyl diphosphate synthase  48.89 
 
 
273 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1158  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.44 
 
 
254 aa  219  3e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.500874  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1115  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.44 
 
 
254 aa  219  3e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4513  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.56 
 
 
251 aa  219  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.537254 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2824  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.19 
 
 
252 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2033  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.39 
 
 
255 aa  219  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2631  undecaprenyl diphosphate synthase  45.89 
 
 
263 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000342439  normal  0.527492 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  45.65 
 
 
246 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0640  undecaprenyl diphosphate synthase  46.85 
 
 
231 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000259882  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0511  undecaprenyl diphosphate synthase  46.05 
 
 
257 aa  218  5e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0663424  normal  0.27617 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1447  undecaprenyl diphosphate synthase  45.19 
 
 
257 aa  218  6e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1145  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.29 
 
 
258 aa  218  6e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000692152  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.96 
 
 
249 aa  218  6e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  47.56 
 
 
264 aa  218  7e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10941  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.56 
 
 
266 aa  218  7e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.291205  normal  0.66612 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2853  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.75 
 
 
252 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.299861  normal  0.452075 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1923  undecaprenyl diphosphate synthase  49.33 
 
 
234 aa  217  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.44 
 
 
267 aa  217  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2432  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.69 
 
 
248 aa  217  1e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11981  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.44 
 
 
267 aa  216  2e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  45.22 
 
 
245 aa  216  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  45.78 
 
 
257 aa  216  2.9999999999999998e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  47.11 
 
 
266 aa  215  4e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1279  undecaprenyl diphosphate synthase  46.64 
 
 
225 aa  215  4e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1103  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.56 
 
 
267 aa  215  5e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0486  undecaprenyl diphosphate synthase  45.8 
 
 
294 aa  215  5e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.407745 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1001  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  45.33 
 
 
252 aa  214  7e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000193058  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3585  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.41 
 
 
251 aa  214  7e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3411  undecaprenyl pyrophosphate synthetase (di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase)  46.75 
 
 
260 aa  214  7e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  44.98 
 
 
240 aa  214  8e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2440  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.67 
 
 
252 aa  214  9e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138642  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1698  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.76 
 
 
252 aa  214  9e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64591  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0128  undecaprenyl pyrophosphate synthase  43.81 
 
 
249 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0805  undecaprenyl pyrophosphate synthase  45.65 
 
 
239 aa  214  9.999999999999999e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655328  hitchhiker  0.0000000226437 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>