194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0891 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0891  C-5 cytosine-specific DNA methylase  100 
 
 
397 aa  830    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0160  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  51.03 
 
 
404 aa  424  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4269  DNA-cytosine methyltransferase  44.01 
 
 
359 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2196  DNA-cytosine methyltransferase  30.36 
 
 
366 aa  146  6e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227819  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  31.44 
 
 
365 aa  142  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1628  C-5 cytosine-specific DNA methylase  31.2 
 
 
359 aa  141  3e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3681  modification methylase HgiDII  29.94 
 
 
344 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0528  DNA-cytosine methyltransferase  29.1 
 
 
354 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1175  DNA-cytosine methyltransferase  30.51 
 
 
349 aa  136  6.0000000000000005e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2193  DNA-cytosine methyltransferase  30.41 
 
 
358 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.877984  normal  0.072963 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  29.28 
 
 
342 aa  133  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3845  DNA-cytosine methyltransferase  31.73 
 
 
371 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  30.36 
 
 
313 aa  120  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0606  DNA-cytosine methyltransferase  27.15 
 
 
355 aa  119  6e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.08 
 
 
387 aa  118  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  30.2 
 
 
399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  27.9 
 
 
373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0680  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.22 
 
 
350 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000225645 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  27.61 
 
 
352 aa  116  8.999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  28.42 
 
 
371 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4678  DNA-cytosine methyltransferase  28.73 
 
 
345 aa  114  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.201023  normal  0.324334 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  26.74 
 
 
362 aa  112  8.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  27.7 
 
 
375 aa  112  9e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  26.65 
 
 
374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  26.63 
 
 
361 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  27.36 
 
 
689 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  25.61 
 
 
686 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  25.86 
 
 
385 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  28.88 
 
 
340 aa  107  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  26.25 
 
 
357 aa  105  1e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  28.97 
 
 
361 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  26.03 
 
 
652 aa  104  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  25.06 
 
 
389 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  25.07 
 
 
398 aa  104  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  27.27 
 
 
671 aa  103  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04331  DNA-cytosine methyltransferase  25.39 
 
 
698 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  27.27 
 
 
373 aa  103  7e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  27.22 
 
 
319 aa  103  7e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  27.37 
 
 
381 aa  103  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  27.98 
 
 
313 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  26.52 
 
 
434 aa  100  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1008  DNA-cytosine methyltransferase  25.57 
 
 
367 aa  98.6  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1673  DNA-cytosine methyltransferase  25.32 
 
 
366 aa  96.3  9e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  26.38 
 
 
489 aa  95.9  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  27.09 
 
 
423 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  26.09 
 
 
438 aa  94  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  28.8 
 
 
360 aa  94.4  4e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  27.3 
 
 
323 aa  92.8  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0938  DNA-cytosine methyltransferase  25.58 
 
 
355 aa  92.8  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  25.33 
 
 
415 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  26.97 
 
 
423 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  25.92 
 
 
308 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  24.94 
 
 
370 aa  90.1  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  26.54 
 
 
468 aa  89.4  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  24.49 
 
 
395 aa  89.4  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  25.53 
 
 
355 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  26.96 
 
 
310 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  23.66 
 
 
362 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0576  DNA-cytosine methyltransferase  28.1 
 
 
313 aa  87  5e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.85 
 
 
431 aa  84.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  26.41 
 
 
388 aa  85.1  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  26.55 
 
 
377 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3989  DNA-cytosine methyltransferase  25.82 
 
 
348 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.519304  normal  0.0147961 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  25.96 
 
 
320 aa  84  0.000000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1093  DNA-cytosine methyltransferase  26.55 
 
 
386 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1839  DNA-cytosine methyltransferase  26.24 
 
 
318 aa  81.6  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.414211  normal  0.341933 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  23.71 
 
 
356 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  24.24 
 
 
418 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  24.24 
 
 
418 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  24.55 
 
 
450 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3920  DNA-cytosine methyltransferase  26.7 
 
 
358 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1383  DNA-cytosine methyltransferase  25.34 
 
 
309 aa  80.5  0.00000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  26.58 
 
 
337 aa  80.1  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  30.61 
 
 
446 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  28 
 
 
379 aa  78.2  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  25.07 
 
 
313 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  25.82 
 
 
345 aa  77  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  21.88 
 
 
465 aa  76.6  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0700  DNA-cytosine methyltransferase  25.68 
 
 
320 aa  76.3  0.0000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  24.93 
 
 
415 aa  76.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1413  DNA-cytosine methyltransferase  24.29 
 
 
420 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.582499  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2163  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  26.72 
 
 
375 aa  75.9  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41914  normal  0.896778 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1510  DNA-cytosine methyltransferase  23.2 
 
 
414 aa  75.9  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  25.7 
 
 
424 aa  75.5  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  23.38 
 
 
421 aa  74.7  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4338  modification methylase DdeI  23.77 
 
 
468 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00618638  hitchhiker  0.00000000596927 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  26.28 
 
 
361 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  25.82 
 
 
365 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  25.2 
 
 
325 aa  73.2  0.000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  24.23 
 
 
431 aa  73.2  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0931  DNA-cytosine methyltransferase  23.86 
 
 
474 aa  73.2  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  25.69 
 
 
313 aa  71.6  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  23.86 
 
 
390 aa  70.9  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  24.15 
 
 
334 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3927  DNA-cytosine methyltransferase  27.92 
 
 
500 aa  70.5  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  24.25 
 
 
368 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  28.29 
 
 
657 aa  68.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  24.51 
 
 
364 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  28.49 
 
 
406 aa  67  0.0000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  22.43 
 
 
454 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>