More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1145 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1145  ABC transporter related  100 
 
 
236 aa  478  1e-134  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1715  ATPase  55.93 
 
 
236 aa  263  2e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2874  ABC transporter related  55.08 
 
 
236 aa  261  4.999999999999999e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.675054  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1479  ABC transporter related  54.89 
 
 
240 aa  259  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2067  peptide ABC transporter ATP-binding protein  56.64 
 
 
240 aa  259  3e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1918  ABC transporter related  52.94 
 
 
236 aa  256  2e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  54.78 
 
 
244 aa  255  4e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  54.78 
 
 
244 aa  254  6e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1942  ABC transporter related  55.16 
 
 
254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  53.91 
 
 
248 aa  252  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4676  Sigma 54 interacting domain protein  51.72 
 
 
234 aa  251  6e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1212  ABC transporter related  51.72 
 
 
251 aa  250  1e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00777209 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1479  ABC transporter-related protein  52 
 
 
244 aa  248  7e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2084  ABC transporter related  52.94 
 
 
239 aa  246  2e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2064  ABC transporter related protein  51.91 
 
 
244 aa  246  2e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.325549  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3583  ABC transporter related  55.16 
 
 
241 aa  245  4e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  53.1 
 
 
238 aa  244  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2178  ABC transporter related  48.92 
 
 
233 aa  244  9.999999999999999e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0076  ABC transporter ATP-binding protein  52.21 
 
 
235 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.514919 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1013  ABC transporter related  53.65 
 
 
245 aa  243  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5173  ABC transporter related  51.52 
 
 
238 aa  242  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2453  ABC transporter related  49.36 
 
 
234 aa  243  3e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000726379  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0302  ABC transporter related  54.42 
 
 
250 aa  241  7e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0216  hypothetical protein  52.47 
 
 
236 aa  239  2e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  47.83 
 
 
234 aa  240  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0324  ABC transporter related protein  51.27 
 
 
235 aa  239  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4501  ABC transporter related  55.56 
 
 
234 aa  238  8e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.293779 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4369  ABC transporter related  55.56 
 
 
234 aa  238  8e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3436  putative ABC transporter, ATP-binding protein  52.65 
 
 
245 aa  237  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01920  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  48.92 
 
 
233 aa  236  2e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1509  ABC transporter related  50 
 
 
248 aa  236  3e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2281  ABC transporter related  52.91 
 
 
235 aa  235  4e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341913  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1421  ABC transporter related  47.46 
 
 
244 aa  234  7e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1576  ABC transporter related  50.42 
 
 
236 aa  234  1.0000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4268  ABC transporter-related protein  52.02 
 
 
238 aa  233  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  47.32 
 
 
233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  49.57 
 
 
233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0745  ABC transporter, ATP-binding protein  46.52 
 
 
233 aa  231  5e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.913109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0728  ABC transporter, ATP-binding protein  46.52 
 
 
233 aa  231  5e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2356  ABC transporter related  45.89 
 
 
233 aa  231  7.000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0836286  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1279  ABC transporter related  49.35 
 
 
253 aa  231  8.000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5377  putative ABC transporter, ATP-binding protein  52.91 
 
 
253 aa  231  8.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.409003 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1125  ATPase  50 
 
 
245 aa  230  2e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.237557 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  46.19 
 
 
233 aa  228  7e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1114  ABC transporter related  45.45 
 
 
233 aa  228  8e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1205  peptide ABC transporter ATPase  45.45 
 
 
233 aa  228  8e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2206  ABC transporter related  50.44 
 
 
251 aa  226  2e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1004  ABC transporter, ATP-binding protein  46.96 
 
 
233 aa  226  3e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00659829  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0062  ABC transporter, ATP-binding protein  50.21 
 
 
234 aa  226  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.857763  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  44.07 
 
 
604 aa  225  4e-58  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1056  ABC transporter related  52.68 
 
 
240 aa  224  7e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1363  ABC transporter related  48 
 
 
234 aa  224  1e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  42.49 
 
 
345 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2302  ABC transporter related  48.92 
 
 
243 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704098  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6252  ABC transporter related  51.39 
 
 
234 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.946819  normal  0.438945 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1583  ABC transporter ATPase  51.77 
 
 
241 aa  217  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.929196  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  48.89 
 
 
286 aa  215  4e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  47.56 
 
 
319 aa  214  9e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4213  ABC transporter related  47.39 
 
 
245 aa  212  3.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  44.92 
 
 
236 aa  212  3.9999999999999995e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  44.64 
 
 
235 aa  211  7.999999999999999e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1693  ABC transporter related  44.4 
 
 
232 aa  209  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0390  ABC transporter related  43.1 
 
 
232 aa  207  1e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1583  ABC transporter related  42.6 
 
 
232 aa  205  5e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  47.53 
 
 
234 aa  203  2e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  47.53 
 
 
234 aa  203  2e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  48.26 
 
 
229 aa  201  7e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0132  ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 
233 aa  201  7e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  44.8 
 
 
233 aa  200  9.999999999999999e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.684387  normal  0.338705 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1515  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  44.83 
 
 
233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  44.87 
 
 
246 aa  199  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1775  ABC transporter related  46.22 
 
 
298 aa  198  5e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  46.02 
 
 
239 aa  198  7e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  48.82 
 
 
235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  43.67 
 
 
252 aa  196  3e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  49.1 
 
 
253 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  49.1 
 
 
253 aa  195  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01810  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  41.59 
 
 
236 aa  195  6e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  48.18 
 
 
228 aa  194  9e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  47.11 
 
 
707 aa  193  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  43.36 
 
 
235 aa  192  3e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  46.05 
 
 
230 aa  192  5e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  44.81 
 
 
240 aa  192  5e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  43.04 
 
 
238 aa  191  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  41.74 
 
 
249 aa  189  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  45.66 
 
 
248 aa  190  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1004  ABC transporter related  45.5 
 
 
234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.664588  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  45.78 
 
 
231 aa  188  5e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  43.38 
 
 
220 aa  189  5e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  41.96 
 
 
226 aa  188  5e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1468  ABC transporter related  44.55 
 
 
233 aa  188  5e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4336  ABC transporter related  48.15 
 
 
268 aa  188  8e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  43.42 
 
 
230 aa  187  8e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0109  ABC transporter related  42.41 
 
 
243 aa  187  1e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.112558  normal  0.0826339 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  43.42 
 
 
228 aa  186  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8051  ABC transporter-related protein  45.96 
 
 
235 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260355  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  43.44 
 
 
232 aa  186  3e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  42.11 
 
 
230 aa  185  4e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  44.75 
 
 
229 aa  185  4e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  41.44 
 
 
231 aa  185  5e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>