149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5680 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5680  porin  100 
 
 		 192 aa  384  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.024221  normal  0.409431 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0662  porin Gram-negative type  64.77 
 
 		 397 aa  238  2.9999999999999997e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.228009  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0933  porin  52.58 
 
 		 374 aa  176  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.760858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5778  porin  29.7 
 
 		 358 aa  62  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.431185 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3210  porin Gram-negative type  35.54 
 
 		 368 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0008  OmpC family outer membrane porin  31.29 
 
 		 365 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2863  porin Gram-negative type  39.58 
 
 		 374 aa  54.7  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180964 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3097  porin  36.61 
 
 		 402 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3234  porin  36.94 
 
 		 401 aa  52.8  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2144  outer membrane protein  34.78 
 
 		 419 aa  51.6  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0977931  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3010  outer membrane protein (porin)  30.3 
 
 		 398 aa  51.6  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536281  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  33.33 
 
 		 353 aa  51.6  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  30.21 
 
 		 362 aa  51.2  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0029  porin  29.76 
 
 		 264 aa  51.2  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  30.21 
 
 		 362 aa  51.2  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  30.21 
 
 		 362 aa  51.2  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2803  outer membrane protein (porin)  29.32 
 
 		 387 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0760601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  33.11 
 
 		 355 aa  50.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2074  porin  27.03 
 
 		 360 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1125  outer membrane porin OpcP, putative  33.7 
 
 		 407 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.61922  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  37.25 
 
 		 354 aa  49.7  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0932  putative outer membrane porin  33.7 
 
 		 407 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0904  porin  24.73 
 
 		 360 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.3308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1567  putative outer membrane porin  33.7 
 
 		 407 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0706686  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0227  putative outer membrane porin  33.7 
 
 		 407 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1988  outer membrane porin  33.7 
 
 		 407 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2009  outer membrane porin  33.7 
 
 		 407 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3002  porin  35.96 
 
 		 373 aa  49.7  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.703821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0061  porin  29.76 
 
 		 363 aa  49.3  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0431794  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2370  outer membrane porin OpcP  35.87 
 
 		 419 aa  49.7  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.52025  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6771  porin Gram-negative type  39.33 
 
 		 379 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0165431  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2282  porin  37.93 
 
 		 357 aa  49.3  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  30.7 
 
 		 355 aa  48.9  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  30.7 
 
 		 355 aa  48.9  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2933  putative porin signal peptide protein  28.73 
 
 		 379 aa  48.9  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3052  porin  35.96 
 
 		 384 aa  48.9  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2917  porin  35.96 
 
 		 384 aa  48.9  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5539  porin  30.22 
 
 		 386 aa  47.8  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6354  outer membrane protein, (porin)  34.83 
 
 		 373 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  29.41 
 
 		 376 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4239  outer membrane porin  33.03 
 
 		 377 aa  47.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2394  porin  34.83 
 
 		 373 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.636281  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3008  porin  34.83 
 
 		 373 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3027  porin  34.83 
 
 		 373 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3345  outer membrane porin, putative  30.77 
 
 		 377 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3905  porin  38.2 
 
 		 413 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  26.32 
 
 		 394 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  28.57 
 
 		 388 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3782  porin  33.65 
 
 		 388 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  29.56 
 
 		 355 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  26.32 
 
 		 396 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  27.27 
 
 		 394 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4962  porin Gram-negative type  34.74 
 
 		 354 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0589815  normal  0.0680007 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3014  porin  30.77 
 
 		 377 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2783  porin Gram-negative type  34.74 
 
 		 354 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0106499  normal  0.0987784 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2079  porin  30.77 
 
 		 377 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3333  porin  30.77 
 
 		 377 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3091  outer membrane porin signal peptide protein  28.82 
 
 		 376 aa  46.2  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  28.99 
 
 		 381 aa  45.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05376  porin signal peptide protein  26.37 
 
 		 368 aa  45.8  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0326647 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  35.92 
 
 		 389 aa  45.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6305  porin  29.81 
 
 		 356 aa  45.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  27.78 
 
 		 384 aa  45.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0484  outer membrane porin protein precursor  30.77 
 
 		 377 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1323  outer membrane porin protein precursor  28.65 
 
 		 357 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2320  outer membrane protein (porin)-like  29.5 
 
 		 381 aa  45.1  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0260  porin  30.77 
 
 		 378 aa  45.1  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2044  OmpC family outer membrane porin  31.73 
 
 		 387 aa  45.4  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231547  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3099  outer membrane porin  29.21 
 
 		 354 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.345873  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0302  outer membrane porin  30.77 
 
 		 377 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2974  outer membrane porin  29.21 
 
 		 354 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.598026  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  30.34 
 
 		 383 aa  45.1  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0289  outer membrane porin  30.77 
 
 		 377 aa  45.1  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  30.21 
 
 		 381 aa  44.7  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7454  outer membrane protein (porin)  28.21 
 
 		 383 aa  44.7  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  30 
 
 		 377 aa  44.7  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  31.16 
 
 		 383 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_003296  RS01789  porin protein  29.17 
 
 		 273 aa  44.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3025  porin Gram-negative type  30 
 
 		 376 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3709  porin Gram-negative type  35.92 
 
 		 383 aa  43.9  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0741295  hitchhiker  0.00542912 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  33.9 
 
 		 393 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  29.32 
 
 		 363 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1023  outer membrane protein (porin)  31.85 
 
 		 361 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615146  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3372  porin Gram-negative type  30 
 
 		 376 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2135  porin  28.23 
 
 		 422 aa  44.3  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1699  OmpC family outer membrane porin  27.88 
 
 		 386 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712335  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2192  OmpC family outer membrane porin  32.28 
 
 		 387 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.711966 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  35 
 
 		 371 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  33.02 
 
 		 352 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  31.16 
 
 		 374 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  31.16 
 
 		 383 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6021  porin  28.19 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.852349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4800  porin  27.59 
 
 		 367 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0160312  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4101  porin  27.75 
 
 		 372 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  35.92 
 
 		 389 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  29.23 
 
 		 377 aa  43.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0730  OmpC family outer membrane porin  28.43 
 
 		 369 aa  43.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0127031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1733  porin  27.43 
 
 		 398 aa  43.5  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0848216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0400  porin  27.54 
 
 		 375 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.676022  normal  0.200977 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6404  porin Gram-negative type  26.32 
 
 		 359 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>