More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6021 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6021  porin  100 
 
 		 206 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.852349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  94.06 
 
 		 394 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  92.57 
 
 		 396 aa  380  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  97.52 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  60.4 
 
 		 383 aa  226  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1699  OmpC family outer membrane porin  60 
 
 		 386 aa  224  8e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712335  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  58.71 
 
 		 385 aa  224  9e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  60.5 
 
 		 386 aa  221  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  56.22 
 
 		 383 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  57.5 
 
 		 414 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  57 
 
 		 384 aa  210  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  57 
 
 		 384 aa  210  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  57 
 
 		 384 aa  210  1e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  57 
 
 		 384 aa  210  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  57 
 
 		 384 aa  210  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  57 
 
 		 384 aa  210  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  57 
 
 		 384 aa  210  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  54.77 
 
 		 384 aa  206  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  57.45 
 
 		 383 aa  204  8e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  54.27 
 
 		 384 aa  202  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  54.27 
 
 		 384 aa  202  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  53.77 
 
 		 384 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  53.77 
 
 		 384 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  53.77 
 
 		 384 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  53.5 
 
 		 381 aa  194  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02026  porin signal peptide protein  51.05 
 
 		 382 aa  191  5e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.555277 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  54.27 
 
 		 384 aa  185  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2108  porin signal peptide protein  49.5 
 
 		 381 aa  181  5.0000000000000004e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0434327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7454  outer membrane protein (porin)  46.23 
 
 		 383 aa  171  9e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0393  OmpC family outer membrane porin  42.08 
 
 		 386 aa  149  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0215  outer membrane porin OpcP  41.38 
 
 		 382 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6314  porin  42.08 
 
 		 377 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  44.28 
 
 		 380 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  44.28 
 
 		 380 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  41.21 
 
 		 379 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4328  porin  38.12 
 
 		 391 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428613  normal  0.0399975 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  40.39 
 
 		 379 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  40.39 
 
 		 379 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1943  hypothetical protein  37.86 
 
 		 209 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.366238  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0960  hypothetical protein  37.86 
 
 		 209 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  40.39 
 
 		 379 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1247  hypothetical protein  37.86 
 
 		 209 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.127148  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2222  hypothetical protein  37.86 
 
 		 209 aa  122  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  40.39 
 
 		 379 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  39.8 
 
 		 374 aa  121  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  39.8 
 
 		 383 aa  121  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  39.9 
 
 		 379 aa  121  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  40.5 
 
 		 379 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  39.8 
 
 		 383 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0293  outer membrane porin OpcP  37.38 
 
 		 209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.484848  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1660  hypothetical protein  37.38 
 
 		 209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  39.32 
 
 		 383 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  39.71 
 
 		 383 aa  118  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  40.82 
 
 		 375 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  39 
 
 		 379 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  38.24 
 
 		 381 aa  116  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6717  porin  35.96 
 
 		 382 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.653963  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6482  porin  35.96 
 
 		 382 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0226396  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0849  OmpC family outer membrane porin  38.73 
 
 		 384 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153062  normal  0.0195066 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  39.8 
 
 		 375 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  38.19 
 
 		 381 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  39.09 
 
 		 375 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  38.58 
 
 		 384 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  37.93 
 
 		 384 aa  108  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5966  porin  34.83 
 
 		 380 aa  108  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.084261 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  38.27 
 
 		 375 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  38.27 
 
 		 375 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6642  porin  40.69 
 
 		 386 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000730188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5676  porin  34.48 
 
 		 389 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.919602 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3740  porin  34.98 
 
 		 389 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4628  porin  34.98 
 
 		 389 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  36.41 
 
 		 379 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  41.34 
 
 		 384 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  41.34 
 
 		 384 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0415  OmpC family outer membrane porin  37.81 
 
 		 386 aa  105  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  41.34 
 
 		 384 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  41.34 
 
 		 384 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  41.34 
 
 		 384 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  37.76 
 
 		 391 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  41.38 
 
 		 384 aa  105  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7203  porin Gram-negative type  35.96 
 
 		 386 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  40.78 
 
 		 384 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  37.31 
 
 		 376 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  37.24 
 
 		 409 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  37.24 
 
 		 409 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  37.81 
 
 		 381 aa  102  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  38.71 
 
 		 380 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  34.33 
 
 		 363 aa  97.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  35.61 
 
 		 377 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2206  outer membrane porin  36.57 
 
 		 387 aa  96.3  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0690503  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  37.38 
 
 		 385 aa  96.3  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  34.63 
 
 		 377 aa  95.5  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4838  porin  31 
 
 		 385 aa  94  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000248162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3816  porin  32.86 
 
 		 409 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.386084  normal  0.290962 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1546  outer membrane protein (porin)  33.18 
 
 		 403 aa  93.6  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  37.36 
 
 		 381 aa  92.4  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  36.45 
 
 		 393 aa  92  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  35.94 
 
 		 380 aa  92  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  37.9 
 
 		 385 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  37.9 
 
 		 385 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>