130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5251 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5251  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  100 
 
 		 226 aa  456  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2605  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  59.91 
 
 		 222 aa  231  5e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0949581  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3252  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  59.91 
 
 		 222 aa  230  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.309546 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1202  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  70.43 
 
 		 245 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00500241 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3051  hypothetical protein  64.32 
 
 		 208 aa  203  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129241 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1747  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  53.44 
 
 		 187 aa  203  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.346445 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0290  hypothetical protein  61.4 
 
 		 179 aa  192  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5477  hypothetical protein  56.22 
 
 		 193 aa  186  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0197  hypothetical protein  55.14 
 
 		 195 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0221  hypothetical protein  56.22 
 
 		 195 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0218  hypothetical protein  54.59 
 
 		 195 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.485558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0051  hypothetical protein  56.73 
 
 		 197 aa  178  7e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0139  hypothetical protein  54.97 
 
 		 197 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2944  hypothetical protein  52.76 
 
 		 197 aa  168  6e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0723144  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69330  hypothetical protein  61.11 
 
 		 192 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5996  hypothetical protein  62.64 
 
 		 192 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3136  hypothetical protein  37.74 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.785317 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0229  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  31.84 
 
 		 222 aa  87.4  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.727419  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0787  hypothetical protein  29.17 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0381  hypothetical protein  31.41 
 
 		 189 aa  72  0.000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1549  hypothetical protein  31.68 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1265  small-conductance mechanosensitive channel  31.68 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.455732 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001007  small-conductance mechanosensitive channel  29.56 
 
 		 197 aa  64.7  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07084  hypothetical protein  27.27 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  30.98 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4184  small-conductance mechanosensitive channel  33.62 
 
 		 184 aa  58.2  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0614  hypothetical protein  40.45 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.431847 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2956  hypothetical protein  28.17 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3043  hypothetical protein  27.33 
 
 		 178 aa  54.7  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.103752  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  30.1 
 
 		 310 aa  54.3  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1709  small conductance mechanosensitive channel  31.87 
 
 		 494 aa  54.3  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0466336 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0540  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  29.38 
 
 		 173 aa  54.3  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000231888  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4090  MscS mechanosensitive ion channel  25.13 
 
 		 349 aa  53.1  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1640  mechanosensitive ion channel  29.38 
 
 		 173 aa  53.5  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0204845  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00718  hypothetical protein  30.77 
 
 		 207 aa  52  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.737648  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0520  hypothetical protein  31.31 
 
 		 179 aa  51.6  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0258  hypothetical protein  31.78 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1197  MscS mechanosensitive ion channel  34.78 
 
 		 247 aa  51.2  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0852  hypothetical protein  35.16 
 
 		 181 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0899  hypothetical protein  35.16 
 
 		 181 aa  51.2  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3512  hypothetical protein  35.16 
 
 		 181 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3635  hypothetical protein  35.16 
 
 		 181 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3441  hypothetical protein  35.16 
 
 		 181 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0961  hypothetical protein  33.98 
 
 		 150 aa  50.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2989  Ricin B lectin  26.51 
 
 		 474 aa  50.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000129425 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  31.51 
 
 		 282 aa  49.7  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000332583  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0583  MscS Mechanosensitive ion channel  29.37 
 
 		 308 aa  49.7  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.330876  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  25.5 
 
 		 351 aa  49.7  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4274  hypothetical protein  30.43 
 
 		 368 aa  49.3  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  24.22 
 
 		 532 aa  48.9  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  27.84 
 
 		 279 aa  48.9  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  28.19 
 
 		 270 aa  48.9  0.00007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0790  hypothetical protein  33.71 
 
 		 183 aa  48.5  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0597866 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0804  hypothetical protein  34.78 
 
 		 181 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445531 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3509  MscS mechanosensitive ion channel  25.12 
 
 		 278 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.126996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0443  MscS mechanosensitive ion channel  25.12 
 
 		 278 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3219  hypothetical protein  34.78 
 
 		 181 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3322  hypothetical protein  34.78 
 
 		 181 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1189  MscS Mechanosensitive ion channel  29.53 
 
 		 445 aa  47  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1797  mechanosensitive ion channel  26.78 
 
 		 561 aa  47.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.433096  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12023  hypothetical protein  24.84 
 
 		 181 aa  47.4  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2842  MscS mechanosensitive ion channel  29.61 
 
 		 369 aa  46.6  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3684  MscS mechanosensitive ion channel  24.76 
 
 		 278 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1730  MscS Mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 276 aa  46.2  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.351236  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1770  MscS mechanosensitive ion channel  26.61 
 
 		 406 aa  46.2  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4903  MscS mechanosensitive ion channel  28.21 
 
 		 327 aa  46.2  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  26.47 
 
 		 533 aa  46.2  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  29.65 
 
 		 277 aa  45.8  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0851  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  25.42 
 
 		 289 aa  45.8  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3818  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  25.42 
 
 		 289 aa  45.8  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.905722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0854  MscS mechanosensitive ion channel  25.42 
 
 		 289 aa  45.8  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5331  MscS mechanosensitive ion channel  27.04 
 
 		 301 aa  45.8  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4182  MscS mechanosensitive ion channel  30.22 
 
 		 324 aa  45.4  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.774704 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5803  Small-conductance mechanosensitive channel  28.21 
 
 		 284 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  28.74 
 
 		 298 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  28.49 
 
 		 270 aa  44.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0258  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  36.78 
 
 		 492 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.986681 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0308  MscS mechanosensitive ion channel  28.1 
 
 		 459 aa  43.9  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0360  MscS mechanosensitive ion channel  27.78 
 
 		 393 aa  43.9  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1496  MscS Mechanosensitive ion channel  20.11 
 
 		 295 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0820  MscS mechanosensitive ion channel  32.35 
 
 		 307 aa  43.9  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.206414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  25.74 
 
 		 534 aa  43.5  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  23.38 
 
 		 292 aa  43.5  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0427  MscS mechanosensitive ion channel  30.07 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0918944  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  25.31 
 
 		 563 aa  43.9  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  25.11 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2755  MscS mechanosensitive ion channel:conserved TM helix  26.15 
 
 		 276 aa  43.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4142  MscS mechanosensitive ion channel  29.7 
 
 		 384 aa  43.5  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.93898  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1616  MscS mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 273 aa  43.5  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.19083  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  28.26 
 
 		 544 aa  43.1  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  23.89 
 
 		 287 aa  43.1  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1335  MscS mechanosensitive ion channel  33.72 
 
 		 275 aa  43.5  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1124  MscS Mechanosensitive ion channel  24.32 
 
 		 345 aa  43.1  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.745547  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0951  MscS Mechanosensitive ion channel  31.73 
 
 		 341 aa  42.7  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0599  MscS mechanosensitive ion channel  29.5 
 
 		 329 aa  42.7  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.316898 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01752  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  20.97 
 
 		 328 aa  42.7  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249612  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  27.23 
 
 		 269 aa  42.4  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0757  MscS mechanosensitive ion channel  28.69 
 
 		 479 aa  42.7  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0195  MscS mechanosensitive ion channel  22.12 
 
 		 354 aa  42.7  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0052728  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4144  MscS mechanosensitive ion channel  29.75 
 
 		 311 aa  42.4  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.789982 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>