185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3480 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2441  peptidase S45 penicillin amidase  64.41 
 
 		 814 aa  1030    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.708556  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3883  peptidase S45 penicillin amidase  62.58 
 
 		 842 aa  1008    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.513553  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1140  peptidase S45, penicillin amidase  65.65 
 
 		 805 aa  1043    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal  0.229861 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3480  peptidase S45 penicillin amidase  100 
 
 		 816 aa  1674    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.996259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2825  peptidase S45 penicillin amidase  37.87 
 
 		 795 aa  491  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.572731 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2419  peptidase S45 penicillin amidase  38.04 
 
 		 795 aa  489  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4860  acyl-homoserine lactone acylase  37.94 
 
 		 804 aa  489  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357957  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2547  aculeacin A acylase transmembrane protein  38.23 
 
 		 795 aa  477  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2063  peptidase S45 penicillin amidase  37.21 
 
 		 779 aa  478  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.530766  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3778  peptidase S45, penicillin amidase  36.89 
 
 		 779 aa  473  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2161  penicillin amidase family protein  35.74 
 
 		 773 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498223  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2448  peptidase S45, penicillin amidase  34.88 
 
 		 819 aa  448  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.868997 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2563  peptidase S45, penicillin amidase  35.32 
 
 		 778 aa  444  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.387542  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2901  penicillin amidase family protein  37.53 
 
 		 772 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.736989 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1971  peptidase S45, penicillin amidase  35.64 
 
 		 779 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25350  acyl-homoserine lactone acylase, PvdQ-like protein  34.65 
 
 		 737 aa  439  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2790  peptidase S45, penicillin amidase  36.95 
 
 		 763 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.311234 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2882  peptidase S45 penicillin amidase  37.37 
 
 		 769 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33820  penicillin acylase-related protein  35.78 
 
 		 762 aa  435  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00307751  normal  0.0883584 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2876  acylase  35.98 
 
 		 760 aa  435  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181315  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1333  peptidase S45, penicillin amidase  36.03 
 
 		 799 aa  423  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.222758  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2403  peptidase S45 penicillin amidase  35.14 
 
 		 770 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.52163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4390  peptidase S45, penicillin amidase  36.25 
 
 		 773 aa  408  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0446871  normal  0.0863607 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0136  peptidase S45 penicillin amidase  31.43 
 
 		 793 aa  379  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.122956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3338  peptidase S45, penicillin amidase  34.78 
 
 		 789 aa  368  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.378065  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3685  peptidase S45 penicillin amidase  32.67 
 
 		 824 aa  365  2e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01895  penicillin acylase-like protein  31.03 
 
 		 841 aa  346  1e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21085  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3553  peptidase S45 penicillin amidase  30.87 
 
 		 854 aa  333  1e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0764  peptidase S45, penicillin amidase  30.87 
 
 		 854 aa  331  4e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0918  aculeacin A acylase  30.83 
 
 		 855 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0771  peptidase S45, penicillin amidase  32.12 
 
 		 860 aa  330  8e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.43 
 
 		 855 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.635154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0760  peptidase S45, penicillin amidase  31.3 
 
 		 855 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.526206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3263  peptidase S45, penicillin amidase  31.18 
 
 		 855 aa  325  1e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0860  peptidase S45, penicillin amidase  30.81 
 
 		 854 aa  323  9.000000000000001e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2773  aculeacin A acylase  29.82 
 
 		 852 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00542255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3676  peptidase S45 penicillin amidase  21.36 
 
 		 708 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5764  peptidase S45 penicillin amidase  23.57 
 
 		 725 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2434  peptidase S45 penicillin amidase  21.05 
 
 		 674 aa  108  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  25.45 
 
 		 827 aa  95.5  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  25.73 
 
 		 827 aa  95.1  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  23.73 
 
 		 809 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3571  Glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  23.81 
 
 		 712 aa  90.9  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.111745  normal  0.0870635 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  24.5 
 
 		 821 aa  90.5  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  25.18 
 
 		 796 aa  90.1  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  25.48 
 
 		 796 aa  89.7  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  23.5 
 
 		 809 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4813  penicillin amidase  25.61 
 
 		 790 aa  89  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.911238  normal  0.40468 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1171  glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  21.93 
 
 		 701 aa  88.2  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.312808  normal  0.0841772 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  26.18 
 
 		 821 aa  88.2  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  22.51 
 
 		 796 aa  88.6  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  23.74 
 
 		 796 aa  88.2  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  24.45 
 
 		 818 aa  88.2  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  22.99 
 
 		 796 aa  87.8  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  24.52 
 
 		 796 aa  87.4  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  24.11 
 
 		 796 aa  87.4  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  22.99 
 
 		 796 aa  87.4  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  24.52 
 
 		 796 aa  87.4  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  24.69 
 
 		 817 aa  87.4  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  24.04 
 
 		 813 aa  85.9  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  26.61 
 
 		 829 aa  85.9  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  22.75 
 
 		 796 aa  85.1  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3459  peptidase S45 penicillin amidase  31.92 
 
 		 885 aa  85.5  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0402135  hitchhiker  0.000204801 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0589  Glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  20.91 
 
 		 694 aa  84.7  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5300  penicillin amidase family protein  25.48 
 
 		 795 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3142  penicillin amidase  22.2 
 
 		 812 aa  82.4  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0903  peptidase S45 penicillin amidase  25.46 
 
 		 864 aa  82  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4858  penicillin amidase  25.54 
 
 		 795 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  24.52 
 
 		 810 aa  80.1  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  26.19 
 
 		 770 aa  80.1  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  24.48 
 
 		 806 aa  80.1  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5398  penicillin amidase  24.15 
 
 		 803 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111495  hitchhiker  0.00200209 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  25.32 
 
 		 803 aa  77.4  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  25.22 
 
 		 804 aa  77.4  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1594  peptidase S45 penicillin amidase  24.19 
 
 		 836 aa  76.3  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1840  penicillin amidase  24.22 
 
 		 821 aa  75.9  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.643427  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0920  peptidase S45, penicillin amidase  22.71 
 
 		 825 aa  74.7  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2388  penicillin amidase  21.42 
 
 		 718 aa  73.9  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.159151 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  24.4 
 
 		 809 aa  72.8  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  25.28 
 
 		 769 aa  73.6  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  23.36 
 
 		 819 aa  72.4  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  26.29 
 
 		 818 aa  72.4  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  27.2 
 
 		 808 aa  71.6  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  25 
 
 		 823 aa  71.2  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  24.76 
 
 		 779 aa  70.5  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0631  penicillin amidase, putative  24.73 
 
 		 797 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1565  acylase precursor  26.49 
 
 		 827 aa  70.5  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0134254  normal  0.042074 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5217  peptidase S45 penicillin amidase  24.07 
 
 		 787 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  22.75 
 
 		 819 aa  68.6  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0937  glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  23.02 
 
 		 724 aa  67.8  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.844114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2452  penicillin amidase  28.99 
 
 		 889 aa  67  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288116  normal  0.271218 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  24.15 
 
 		 783 aa  67  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5164  penicillin amidase family protein  23.3 
 
 		 788 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2845  putative penicillin acylase (penicillin amidase)  22.74 
 
 		 823 aa  66.6  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1448  penicillin amidase  22.34 
 
 		 823 aa  66.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  30.5 
 
 		 811 aa  66.6  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1767  Penicillin amidase  26.74 
 
 		 963 aa  65.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.439064  normal  0.0240982 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19340  Peptidase S45, penicillin amidase family  24.34 
 
 		 839 aa  65.9  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4884  peptidase S45 penicillin amidase  31.87 
 
 		 906 aa  65.9  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4349  putative penicillin amidase  23.35 
 
 		 847 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>