More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_3373 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2729  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 528 aa  1037    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3373  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 528 aa  1037    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  51.12 
 
 		 550 aa  544  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0846  mechanosensitive ion channel protein MscS  47.34 
 
 		 537 aa  467  9.999999999999999e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3962  MscS mechanosensitive ion channel  47.63 
 
 		 538 aa  463  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000243935  hitchhiker  0.0037815 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5186  MscS Mechanosensitive ion channel  30.96 
 
 		 600 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000148025 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0610  hypothetical protein  32.98 
 
 		 599 aa  238  2e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0540  MscS Mechanosensitive ion channel  32.76 
 
 		 582 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2054  MscS Mechanosensitive ion channel  40.33 
 
 		 350 aa  215  1.9999999999999998e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2274  MscS mechanosensitive ion channel  33.65 
 
 		 586 aa  212  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1803  MscS Mechanosensitive ion channel  32.21 
 
 		 595 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal  0.895337 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13451  putative mechanosensitive ion channel, MscS family protein  42.34 
 
 		 656 aa  201  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  41.87 
 
 		 344 aa  191  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0602  MscS mechanosensitive ion channel  45.5 
 
 		 568 aa  188  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0823902  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1833  MscS mechanosensitive ion channel  40.7 
 
 		 394 aa  187  3e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1197  MscS Mechanosensitive ion channel  29.5 
 
 		 569 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1226  MscS Mechanosensitive ion channel  29.5 
 
 		 569 aa  187  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3531  MscS Mechanosensitive ion channel  36.68 
 
 		 356 aa  184  5.0000000000000004e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5312  MscS mechanosensitive ion channel  37.84 
 
 		 454 aa  180  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.518656 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1378  MscS mechanosensitive ion channel  37.67 
 
 		 342 aa  180  4.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586081  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1334  MscS Mechanosensitive ion channel  39.37 
 
 		 335 aa  180  5.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.158272  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7354  mechanosensitive ion channel  39.73 
 
 		 337 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3072  MscS mechanosensitive ion channel  41.33 
 
 		 773 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.718015  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1154  MscS mechanosensitive ion channel  37.39 
 
 		 442 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0266  small-conductance mechanosensitive channel-like  32.61 
 
 		 505 aa  174  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068339 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2549  mechanosensitive ion channel MscS  38.64 
 
 		 342 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2396  MscS mechanosensitive ion channel  30.39 
 
 		 283 aa  173  6.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000120764  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1136  MscS Mechanosensitive ion channel  36.7 
 
 		 325 aa  171  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3908  putative small-conductance mechanosensitive channel transmembrane protein  38.89 
 
 		 771 aa  170  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.385979 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1324  MscS mechanosensitive ion channel  36.24 
 
 		 458 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00452452  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1579  mechanosensitive ion channel family protein  37.22 
 
 		 455 aa  167  4e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.397271  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1456  mechanosensitive ion channel protein  35.81 
 
 		 455 aa  166  9e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000389307  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0499  mechanosensitive ion channel  35.43 
 
 		 321 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.979826 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  32.45 
 
 		 288 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0186  MscS Mechanosensitive ion channel  43.69 
 
 		 304 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0950  MscS mechanosensitive ion channel  37.39 
 
 		 787 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2861  small conductance mechanosensitive channel ion channel  34.22 
 
 		 767 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.753072  normal  0.757549 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11820  small-conductance mechanosensitive channel  35.71 
 
 		 336 aa  164  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.139296 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3563  MscS mechanosensitive ion channel  35.94 
 
 		 762 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3310  MscS mechanosensitive ion channel  35.74 
 
 		 289 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.026322  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1608  MscS Mechanosensitive ion channel  33.78 
 
 		 876 aa  162  9e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1277  MscS mechanosensitive ion channel  36.28 
 
 		 718 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.175782  normal  0.44534 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1754  MscS mechanosensitive ion channel  34.67 
 
 		 879 aa  162  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0853  MscS mechanosensitive ion channel  36.16 
 
 		 327 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0593395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0847  MscS mechanosensitive ion channel  36.16 
 
 		 327 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0864  MscS mechanosensitive ion channel  36.16 
 
 		 327 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1688  MscS mechanosensitive ion channel  37.21 
 
 		 719 aa  160  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.265093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5854  hypothetical protein  32.97 
 
 		 735 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.213099  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1535  MscS Mechanosensitive ion channel  35.68 
 
 		 336 aa  157  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.20239  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67630  hypothetical protein  33.7 
 
 		 735 aa  157  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3068  hypothetical protein  37.73 
 
 		 756 aa  155  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.36924 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3795  MscS mechanosensitive ion channel  36.04 
 
 		 313 aa  154  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.840492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3421  MscS Mechanosensitive ion channel  33.62 
 
 		 299 aa  154  5e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0306302  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23390  MscS Mechanosensitive ion channel  36.7 
 
 		 299 aa  154  5e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350298  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1247  MscS Mechanosensitive ion channel  37.79 
 
 		 370 aa  153  7e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1916  MscS mechanosensitive ion channel  36.41 
 
 		 308 aa  153  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3991  MscS mechanosensitive ion channel  38.42 
 
 		 715 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0693455  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3550  MscS Mechanosensitive ion channel  32.75 
 
 		 294 aa  152  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3001  MscS mechanosensitive ion channel  34.11 
 
 		 693 aa  152  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1320  MscS mechanosensitive ion channel  37.89 
 
 		 717 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1802  MscS Mechanosensitive ion channel  35.45 
 
 		 753 aa  150  5e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.135784  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1728  hypothetical protein  37.89 
 
 		 717 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.784062  normal  0.0313644 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4477  MscS mechanosensitive ion channel  33.63 
 
 		 772 aa  149  9e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1188  MscS Mechanosensitive ion channel  36.04 
 
 		 549 aa  149  9e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24600  small-conductance mechanosensitive channel  33.49 
 
 		 337 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.503052  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0676  mechanosensitive ion channel family protein  33.63 
 
 		 767 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1801  MscS Mechanosensitive ion channel  33.76 
 
 		 335 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4634  MscS Mechanosensitive ion channel  32.23 
 
 		 334 aa  147  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0333987  normal  0.045581 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2401  MscS Mechanosensitive ion channel  32.68 
 
 		 718 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0124939 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3911  MscS mechanosensitive ion channel  35.51 
 
 		 367 aa  146  9e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0410  MscS Mechanosensitive ion channel  36.41 
 
 		 372 aa  146  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4017  MscS mechanosensitive ion channel  32.42 
 
 		 285 aa  145  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1398  MscS Mechanosensitive ion channel  35.92 
 
 		 266 aa  145  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3355  MscS Mechanosensitive ion channel  32.52 
 
 		 278 aa  144  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0940  MscS Mechanosensitive ion channel  31.58 
 
 		 293 aa  143  8e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.285938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0901  MscS Mechanosensitive ion channel  34.55 
 
 		 766 aa  142  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3994  hypothetical protein  34.63 
 
 		 792 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.535307  normal  0.386715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3871  MscS mechanosensitive ion channel  33.17 
 
 		 674 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3536  MscS mechanosensitive ion channel  34.86 
 
 		 388 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7342  MscS Mechanosensitive ion channel  34.25 
 
 		 342 aa  141  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546474 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5664  mechanosensitive ion channel family protein  31.96 
 
 		 293 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5330  mechanosensitive ion channel family protein  31.96 
 
 		 293 aa  140  6e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5158  mechanosensitive ion channel family protein  31.96 
 
 		 293 aa  140  6e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5174  mechanosensitive ion channel family protein  31.96 
 
 		 293 aa  140  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1895  small-conductance mechanosensitive ion channel  35.06 
 
 		 787 aa  140  6e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5587  mechanosensitive ion channel family protein  31.96 
 
 		 293 aa  140  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187397 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5726  mechanosensitive ion channel family protein  31.96 
 
 		 293 aa  140  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0727395  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2744  MscS mechanosensitive ion channel  36.04 
 
 		 315 aa  139  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.535922  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0544  MscS mechanosensitive ion channel  34.63 
 
 		 787 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3797  MscS mechanosensitive ion channel  34.4 
 
 		 871 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198076  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2432  MscS Mechanosensitive ion channel  36.67 
 
 		 307 aa  139  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00547938  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0349  MscS Mechanosensitive ion channel  34.36 
 
 		 759 aa  139  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3278  MscS mechanosensitive ion channel  34.4 
 
 		 864 aa  139  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3348  MscS Mechanosensitive ion channel  36.04 
 
 		 757 aa  139  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.703913 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5628  mechanosensitive ion channel family protein  31.51 
 
 		 293 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177271  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1487  MscS mechanosensitive ion channel  39.57 
 
 		 796 aa  138  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2511  MscS mechanosensitive ion channel  38.42 
 
 		 282 aa  138  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.399769  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2062  MscS mechanosensitive ion channel  34.72 
 
 		 747 aa  138  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3001  MscS Mechanosensitive ion channel  35.59 
 
 		 755 aa  137  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.996341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1631  MscS mechanosensitive ion channel  34.23 
 
 		 414 aa  137  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.697444 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>