170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6382 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6382  beta-lactamase  100 
 
 		 472 aa  979    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1815  beta-lactamase  67.91 
 
 		 408 aa  549  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.270787 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2416  beta-lactamase  43.22 
 
 		 376 aa  269  7e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0407  beta-lactamase  36.73 
 
 		 364 aa  226  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0488571  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1161  beta-lactamase  33.24 
 
 		 356 aa  221  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.580362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3104  putative Beta-lactamase  27.91 
 
 		 463 aa  95.9  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  26.88 
 
 		 363 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1691  beta-lactamase  27.01 
 
 		 380 aa  84.3  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00227097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5602  beta-lactamase  27.34 
 
 		 475 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1179  beta-lactamase  26.54 
 
 		 449 aa  77.8  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.43 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3093  beta-lactamase  23.42 
 
 		 333 aa  76.3  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2815  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  25.67 
 
 		 315 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.22186  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2236  amide hydrolase  28.41 
 
 		 340 aa  73.6  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  25.82 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3052  beta-lactamase  24.56 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  26.76 
 
 		 397 aa  73.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2842  hypothetical protein  25.15 
 
 		 315 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.653108  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2775  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  25.82 
 
 		 315 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.522634  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3056  hypothetical protein  25.15 
 
 		 315 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0766054  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  26.58 
 
 		 380 aa  72  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  26.58 
 
 		 380 aa  72  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2638  beta-lactamase  24.22 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2835  beta-lactamase  25.78 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00277998  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3085  hypothetical protein  24.38 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  27.19 
 
 		 401 aa  70.1  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1926  beta-lactamase  25.23 
 
 		 387 aa  70.1  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.449475  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  25.33 
 
 		 640 aa  70.1  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  22.71 
 
 		 305 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13543  putative hydrolase transmembrane protein  30.73 
 
 		 369 aa  69.7  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  23.02 
 
 		 396 aa  69.7  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  24.67 
 
 		 598 aa  68.6  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  24.93 
 
 		 505 aa  68.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  24.92 
 
 		 425 aa  69.3  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3087  hypothetical protein  24.91 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0916  hypothetical protein  23.5 
 
 		 405 aa  68.2  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2343  beta-lactamase  24.07 
 
 		 309 aa  67  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4003  hypothetical protein  23.62 
 
 		 335 aa  66.6  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2194  beta-lactamase  24.56 
 
 		 314 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179906 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  23.21 
 
 		 382 aa  65.5  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  24.12 
 
 		 395 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  23.08 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  21.05 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  21.36 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  21.36 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  27.16 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2485  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  21.08 
 
 		 305 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0277031  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  23.76 
 
 		 340 aa  62.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  23.24 
 
 		 530 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2520  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  20.89 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155828  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0889  beta-lactamase  32.23 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  22.73 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0928  beta-lactamase  32.23 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  21.9 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3326  beta-lactamase  24.76 
 
 		 481 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0484154 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0255  beta-lactamase  25.87 
 
 		 503 aa  60.5  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2368  beta-lactamase  25.52 
 
 		 530 aa  60.1  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21424  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4047  Beta-lactamase  24.26 
 
 		 368 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2556  beta-lactamase  21.45 
 
 		 305 aa  59.3  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443651  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1749  Beta-lactamase  37.27 
 
 		 496 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5369  beta-lactamase  26.71 
 
 		 432 aa  58.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.545883 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5414  beta-lactamase  35.79 
 
 		 473 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4822  beta-lactamase  35.79 
 
 		 473 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.606365 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5447  beta-lactamase  35.79 
 
 		 473 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.341891 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  36.56 
 
 		 328 aa  57  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2107  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  21.77 
 
 		 420 aa  57  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5881  beta-lactamase  26.14 
 
 		 475 aa  57  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.08 
 
 		 449 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2763  beta-lactamase  20.37 
 
 		 305 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0204  Beta-lactamase  35.79 
 
 		 466 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  23.98 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  21.77 
 
 		 305 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03703  hypothetical protein  35.29 
 
 		 116 aa  55.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.505696  normal  0.773408 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  32.04 
 
 		 368 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2998  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  20.63 
 
 		 419 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.520876  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3990  beta-lactamase  38.04 
 
 		 522 aa  55.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  23.59 
 
 		 419 aa  55.5  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2155  beta-lactamase  38.37 
 
 		 459 aa  55.5  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4792  beta-lactamase  34.74 
 
 		 467 aa  55.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  24.27 
 
 		 414 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5334  beta-lactamase  34.74 
 
 		 467 aa  55.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1370  hypothetical protein  24.8 
 
 		 426 aa  55.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.550304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  32.23 
 
 		 360 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3087  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  21.27 
 
 		 419 aa  55.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.641141  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  22.77 
 
 		 396 aa  55.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2902  beta-lactamase  26.21 
 
 		 413 aa  55.1  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3323  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  20.95 
 
 		 419 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2093  beta-lactamase  35.4 
 
 		 497 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4462  beta-lactamase  30.77 
 
 		 362 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210437  hitchhiker  0.0088578 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0045  beta-lactamase  25 
 
 		 374 aa  54.7  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.975073  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  25.42 
 
 		 323 aa  54.3  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2701  hypothetical protein  22.18 
 
 		 338 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1524  beta-lactamase  23.57 
 
 		 404 aa  53.5  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00136534  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  24.54 
 
 		 384 aa  53.1  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37730  beta-lactamase class C protein  26.54 
 
 		 371 aa  52.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1124  beta-lactamase  30 
 
 		 346 aa  53.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2609  hypothetical protein  21.3 
 
 		 338 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176051 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1949  beta-lactamase  25.62 
 
 		 486 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4279  beta-lactamase  30.3 
 
 		 400 aa  53.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3101  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  20.95 
 
 		 419 aa  52.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0260575  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>