166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3672 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3672  phage shock protein A, PspA  100 
 
 		 225 aa  447  1e-125  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000619428  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3075  phage shock protein A, PspA  70.48 
 
 		 225 aa  301  6.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000922891  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0161  phage shock protein A, PspA  33.48 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0179  phage shock protein A, PspA  31.56 
 
 		 220 aa  97.8  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394162  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0913  phage shock protein A  30.94 
 
 		 256 aa  96.7  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3083  phage shock protein A, PspA  32.6 
 
 		 220 aa  90.9  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249888  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0232  phage shock protein A, PspA  29.36 
 
 		 219 aa  87.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2144  phage shock protein A, PspA  28.64 
 
 		 259 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.865725 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4081  phage shock protein A, PspA  28 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.537261  hitchhiker  0.00031127 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3471  phage shock protein A, PspA  31.05 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0896  phage shock protein A, PspA  31.62 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.855031 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003814  phage shock protein A  32.63 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.968962  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4082  phage shock protein A, PspA  27.8 
 
 		 254 aa  81.6  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224572  hitchhiker  0.000308318 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0017  phage shock protein A, PspA  29.91 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4929  hypothetical protein  30.14 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4961  hypothetical protein  29.68 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4944  hypothetical protein  29.68 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0310  hypothetical protein  29.68 
 
 		 221 aa  78.2  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4700  hypothetical protein  29.22 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4540  phage shock protein A  29.22 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4557  phage shock protein A  29.22 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5061  hypothetical protein  29.22 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4925  hypothetical protein  29.22 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01872  hypothetical protein  31.49 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3867  phage shock protein A, PspA  28.25 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4182  phage shock protein A, PspA  30.43 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179284  hitchhiker  0.000596951 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4639  phage shock protein A, PspA  29.22 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1754  phage shock protein PspA  29.52 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0384  phage shock protein A, PspA  29.69 
 
 		 243 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.790128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0794  membrane-associated 30 kD protein-like  28.15 
 
 		 257 aa  75.1  0.0000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1799  phage shock protein A, PspA  29.11 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.867438 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2169  phage shock protein PspA  28.64 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.985709  normal  0.0801185 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1283  phage shock protein A  32.02 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0216  phage shock protein A, PspA  28 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0013  phage shock protein A, PspA  28.12 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2496  phage shock protein A, PspA  30.65 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.307534  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2669  phage shock protein A, PspA  30.11 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2578  phage shock protein A, PspA  28.12 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4751  phage shock protein A  30.13 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3100  phage shock protein A, PspA  30.06 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.640678  hitchhiker  0.0000229067 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4080  phage shock protein A, PspA  27.43 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1460  phage shock protein PspA  27.73 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.404115  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1814  phage shock protein PspA  27.73 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000037249 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2335  phage shock protein PspA  28.18 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1876  phage shock protein PspA  27.73 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890059 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2610  phage shock protein PspA  28.18 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0101575  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1617  phage shock protein A, PspA  28.18 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5914  predicted protein  28.19 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0219584  normal  0.0472601 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1642  phage shock protein PspA  27.73 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000040084 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1606  phage shock protein A, PspA  28.18 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1640  phage shock protein A, PspA  28.18 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2737  phage shock protein A, PspA  28.18 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.282837  normal  0.137978 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3916  phage shock protein A, PspA  27.73 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02833  phage shock protein A  27.73 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19661  predicted protein  27.04 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.527645  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1225  phage shock protein A, PspA  28.95 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.374246  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01281  regulatory protein for phage-shock-protein operon  27.73 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2342  phage shock protein A, PspA  27.73 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00393606  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01292  hypothetical protein  27.73 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1946  phage shock protein PspA  27.73 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1419  phage shock protein PspA  27.73 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1514  phage shock protein PspA  27.73 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2321  phage shock protein PspA  27.73 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1540  phage shock protein PspA  27.73 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1815  phage shock protein PspA  27.73 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.216453 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1818  phage shock protein PspA  27.73 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264575 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3226  phage shock protein A  53.23 
 
 		 221 aa  68.2  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3317  phage shock protein A, PspA  30.22 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3520  phage shock protein A, PspA  29.6 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1237  phage shock protein A  28.16 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1502  phage shock protein A, PspA  28.38 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1554  phage shock protein A, PspA  29.57 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000370882 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3772  phage shock protein A  29.69 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1807  phage shock protein A  38.46 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2480  PspA/IM30  28.9 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1722  phage shock protein PspA  29.09 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212383  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2482  phage shock protein A, PspA  38.46 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0189828 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2550  phage shock protein A, PspA  38.46 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2648  phage shock protein A, PspA  38.46 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.511063 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3152  PspA/IM30 family protein  25.75 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0996  phage shock protein A, PspA  27.64 
 
 		 237 aa  65.1  0.0000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204828  normal  0.0136537 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03595  phage shock protein A  26.55 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0300107  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1156  phage shock protein A, PspA  29.26 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.366088  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1894  phage shock protein PspA  26.36 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1786  phage shock protein PspA  26.36 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0481  phage shock protein A  27.56 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2537  phage shock protein PspA  26.36 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31450  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  26.36 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.0055276  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2934  phage shock protein A, PspA  25.93 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.708363  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2624  phage shock protein PspA  27.13 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.377014  normal  0.46618 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4044  phage shock protein A, PspA  39.36 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2745  phage shock protein A, PspA  26.36 
 
 		 268 aa  62  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0150152  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0207  phage shock protein A, PspA  29.5 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.761137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3220  phage shock protein A  26.58 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0154742 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0716  phage shock protein A, PspA  27.18 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138037  normal  0.0481757 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1782  phage shock protein A, PspA  27.88 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.957793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20810  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  25.22 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.837208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0699  phage shock protein A, PspA  29.41 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0406  phage shock protein A, PspA  34.02 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04291  Phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  26.5 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>