46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3373 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3373  hypothetical protein  100 
 
 		 476 aa  962    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.257825  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  35.64 
 
 		 1882 aa  157  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0168  hypothetical protein  32.49 
 
 		 395 aa  147  5e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.143679  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  29.53 
 
 		 1052 aa  145  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0419  surface antigen BspA-like protein  30.2 
 
 		 460 aa  126  8.000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000239882  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1660  leucine rich repeat domain-containing protein  31.62 
 
 		 1518 aa  118  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00213306  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  37.17 
 
 		 1842 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2258  surface antigen BspA, putative  39.15 
 
 		 355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000806541  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  24.56 
 
 		 1732 aa  107  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1995  hypothetical protein  31.91 
 
 		 691 aa  104  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.349501  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0278  cell surface protein  27.58 
 
 		 352 aa  104  4e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.269797  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0497  FNIP  28.37 
 
 		 456 aa  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1958  surface protein, putative  24.75 
 
 		 458 aa  100  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1975  Ig domain-containing protein  25.4 
 
 		 730 aa  100  8e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000242777  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1981  Ig domain protein group 2 domain protein  34.03 
 
 		 2392 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0233872 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1994  hypothetical protein  29.46 
 
 		 361 aa  87.8  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2534  hypothetical protein  29.41 
 
 		 320 aa  87  6e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1679  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 		 589 aa  81.3  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1195  hypothetical protein  29.95 
 
 		 1247 aa  80.5  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0540388 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0013  hypothetical protein  31.98 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192957  hitchhiker  0.00103528 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2835  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 		 399 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.84844  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  28.27 
 
 		 2495 aa  73.6  0.000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_02  hypothetical protein  31.12 
 
 		 237 aa  72.4  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0574  surface protein, putative  29.56 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2178  hypothetical protein  30.67 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.130105  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0234  hypothetical protein  35.57 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1443  hypothetical protein  34.51 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1525  hypothetical protein  31.17 
 
 		 434 aa  62.4  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0741  hypothetical protein  28.08 
 
 		 657 aa  62  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000898595  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3469  hypothetical protein  36.03 
 
 		 290 aa  62  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0235  hypothetical protein  43.88 
 
 		 269 aa  59.7  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0940  surface antigen BspA-like protein  28.15 
 
 		 271 aa  58.9  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000275444  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1979  hypothetical protein  29.86 
 
 		 2031 aa  58.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.665478  hitchhiker  0.00595287 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2852  hypothetical protein  25.08 
 
 		 1118 aa  58.2  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0153974  normal  0.439704 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1632  hypothetical protein  28.4 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0263591  hitchhiker  0.000262102 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0939  hypothetical protein  30.86 
 
 		 1323 aa  56.6  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.552149  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0945  hypothetical protein  49.09 
 
 		 1331 aa  54.7  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03360  hypothetical protein  39.29 
 
 		 213 aa  54.3  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1220  hypothetical protein  32.73 
 
 		 297 aa  54.3  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0948  hypothetical protein  28.19 
 
 		 278 aa  52.8  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.601784  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1337  hypothetical protein  31.29 
 
 		 506 aa  52.4  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2442  surface protein, putative  30.77 
 
 		 231 aa  52.8  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000653811  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0947  hypothetical protein  27.41 
 
 		 270 aa  52  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.797238  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0421  hypothetical protein  28.05 
 
 		 1055 aa  50.4  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16110  hypothetical protein  35 
 
 		 380 aa  44.3  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000023311 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0946  hypothetical protein  26.73 
 
 		 275 aa  43.9  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>