More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2678 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2678  ribonuclease BN  100 
 
 		 266 aa  530  1e-149  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00324748  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  30.55 
 
 		 277 aa  116  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  30.8 
 
 		 283 aa  113  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  29.35 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  25.09 
 
 		 276 aa  106  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  28.52 
 
 		 286 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  25.75 
 
 		 288 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  29.7 
 
 		 392 aa  97.4  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  25.75 
 
 		 288 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  26.74 
 
 		 289 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  26.74 
 
 		 289 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  26.74 
 
 		 289 aa  95.9  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  26.74 
 
 		 289 aa  95.9  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  26.74 
 
 		 289 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  26.74 
 
 		 289 aa  95.9  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  27.11 
 
 		 289 aa  95.9  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  25.75 
 
 		 316 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  28.84 
 
 		 359 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  26.74 
 
 		 289 aa  94.4  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  26.84 
 
 		 299 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  27.27 
 
 		 328 aa  90.1  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  26.84 
 
 		 299 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  29.74 
 
 		 321 aa  89  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  29 
 
 		 323 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  26.91 
 
 		 277 aa  88.2  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  29.47 
 
 		 289 aa  85.1  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  28.74 
 
 		 330 aa  84.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4672  ribonuclease BN  28.88 
 
 		 359 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498388  normal  0.619058 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  26.42 
 
 		 321 aa  84  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  25.94 
 
 		 351 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  30.65 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  30.65 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  30.65 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  29.92 
 
 		 333 aa  82.8  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1381  putative ribonuclease BN  25.65 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.528846  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1252  ribonuclease BN  24.32 
 
 		 324 aa  82  0.000000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4670  ribonuclease BN, putative  25 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2816  putative ribonuclease BN  27.61 
 
 		 293 aa  81.6  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1616  ribonuclease BN  27.11 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119172  normal  0.116701 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  27.48 
 
 		 375 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4741  ribonuclease BN  29.34 
 
 		 359 aa  80.1  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  28.43 
 
 		 317 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3128  ribonuclease BN  29.11 
 
 		 338 aa  78.6  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3229  ribonuclease BN  29.11 
 
 		 338 aa  78.6  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  27.24 
 
 		 322 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  26.52 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  25.46 
 
 		 388 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  25.46 
 
 		 388 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  27.08 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  25.19 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  27.27 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  26.79 
 
 		 330 aa  75.9  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  27.47 
 
 		 328 aa  75.5  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  26.57 
 
 		 384 aa  75.5  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  26.21 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  25.56 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1074  hypothetical protein  26.52 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177301  normal  0.340121 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  27.64 
 
 		 386 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  28.72 
 
 		 331 aa  74.3  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  25.68 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  25.1 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0701  ribonuclease BN-like family protein  28.28 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  23.68 
 
 		 317 aa  73.6  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3031  ribonuclease BN, putative  27.27 
 
 		 338 aa  73.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  29.05 
 
 		 322 aa  72.8  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  26.3 
 
 		 349 aa  72  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3478  ribonuclease BN  27.51 
 
 		 289 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000152191  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  26.15 
 
 		 356 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  27.56 
 
 		 341 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  27.24 
 
 		 352 aa  70.5  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  27.2 
 
 		 386 aa  70.5  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  28 
 
 		 347 aa  70.5  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  24.26 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  25.93 
 
 		 351 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  28.89 
 
 		 374 aa  69.7  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5015  ribonuclease BN  23.66 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0138  putative ribonuclease BN  37.14 
 
 		 371 aa  68.9  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.674179  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0425  putative ribonuclease BN  25.19 
 
 		 300 aa  68.6  0.00000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.250516  normal  0.726297 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  25.6 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  29.41 
 
 		 371 aa  68.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  27.14 
 
 		 402 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  27.34 
 
 		 401 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1250  ribonuclease BN  25.56 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  28.31 
 
 		 367 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  24.53 
 
 		 347 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1292  ribonuclease BN family protein  25.48 
 
 		 271 aa  67  0.0000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1115  ribonuclease BN  23.94 
 
 		 347 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1265  ribonuclease BN  23.94 
 
 		 347 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  23.05 
 
 		 367 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1576  ribonuclease BN-like family protein  27.36 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2623  putative ribonuclease BN  24.42 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1517  putative ribonuclease BN  25.39 
 
 		 317 aa  65.9  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.573557  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  23.02 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17180  predicted membrane protein  33.68 
 
 		 381 aa  65.9  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  24.33 
 
 		 318 aa  65.5  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  24.06 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  23.43 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1844  ribonuclease BN  39.36 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00339541 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08810  predicted membrane protein  40.22 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0487855  normal  0.0524825 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3200  ribonuclease BN  37.27 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>