194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0701 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0701  ribonuclease BN-like family protein  100 
 
 		 307 aa  606  9.999999999999999e-173  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1381  putative ribonuclease BN  29.33 
 
 		 296 aa  153  4e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.528846  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0632  ribonuclease BN-like family protein  28.43 
 
 		 301 aa  132  5e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1576  ribonuclease BN-like family protein  32.99 
 
 		 282 aa  119  6e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0847  ribonuclease BN, putative  24.32 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1515  ribonuclease BN-like family protein  24.32 
 
 		 314 aa  100  3e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  27.56 
 
 		 323 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  27.87 
 
 		 283 aa  97.1  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  31.1 
 
 		 289 aa  95.1  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  25.79 
 
 		 316 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  26.48 
 
 		 283 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  29.86 
 
 		 321 aa  94  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  26.12 
 
 		 289 aa  92.4  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  27.62 
 
 		 392 aa  92.4  9e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  23.2 
 
 		 299 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  25.87 
 
 		 289 aa  92.4  9e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  22.88 
 
 		 299 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  27.17 
 
 		 277 aa  90.5  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  25.77 
 
 		 289 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  25.77 
 
 		 289 aa  90.1  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  25.77 
 
 		 289 aa  90.1  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  25.77 
 
 		 289 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  25.77 
 
 		 289 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  25.77 
 
 		 289 aa  90.1  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  25.77 
 
 		 288 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  25.77 
 
 		 288 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  28.09 
 
 		 318 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  28.09 
 
 		 318 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  29.21 
 
 		 328 aa  88.2  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  25.26 
 
 		 328 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  25.34 
 
 		 286 aa  87  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  23.51 
 
 		 349 aa  87.4  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  27.66 
 
 		 319 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  27.14 
 
 		 316 aa  86.3  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  24.26 
 
 		 363 aa  86.7  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  24.02 
 
 		 341 aa  86.3  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  27.2 
 
 		 317 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  26.98 
 
 		 334 aa  86.3  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  26.14 
 
 		 350 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  26.14 
 
 		 350 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  26.14 
 
 		 350 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  24.83 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  24.83 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0138  putative ribonuclease BN  25 
 
 		 371 aa  81.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.674179  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3115  ribonuclease BN  27.8 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  27.96 
 
 		 277 aa  79  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  23.4 
 
 		 347 aa  79  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  22.15 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  21.5 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  24.81 
 
 		 401 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  25.09 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  26.37 
 
 		 328 aa  76.3  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  22.26 
 
 		 367 aa  75.9  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  25.26 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1250  ribonuclease BN  25.96 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  25.09 
 
 		 445 aa  73.6  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  25.46 
 
 		 402 aa  72.8  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1937  putative ribonuclease BN  31.73 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.666523  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1971  putative ribonuclease BN  31.73 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.493707  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  22.81 
 
 		 377 aa  70.9  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4768  ribonuclease BN  23.84 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211591  normal  0.0891393 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  25.82 
 
 		 377 aa  69.7  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  26.79 
 
 		 397 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  26.79 
 
 		 397 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  22.68 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  22.15 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  29.71 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4235  putative ribonuclease BN  25.76 
 
 		 420 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.721564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  26.42 
 
 		 396 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  24.1 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  23.61 
 
 		 365 aa  65.9  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17180  predicted membrane protein  23.89 
 
 		 381 aa  65.5  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5245  ribonuclease BN  23.62 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1994  ribonuclease BN  22.49 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.158873  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  25 
 
 		 371 aa  62.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  24.05 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  25.76 
 
 		 374 aa  60.1  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4573  ribonuclease BN  23.42 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101037  hitchhiker  0.00311377 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3487  putative ribonuclease BN  24.83 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4509  ribonuclease BN  24.61 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.581699  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1005  putative ribonuclease BN  27.78 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4670  ribonuclease BN, putative  23.1 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  28.35 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3031  ribonuclease BN, putative  22.22 
 
 		 338 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  27.37 
 
 		 386 aa  57  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  26.42 
 
 		 386 aa  57  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0495  ribonuclease BN-like family protein  23.02 
 
 		 286 aa  57  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.582599  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  24.81 
 
 		 384 aa  56.2  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  25.99 
 
 		 330 aa  55.8  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1252  ribonuclease BN  24.54 
 
 		 324 aa  55.1  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  23.43 
 
 		 313 aa  55.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0927  ribonuclease BN  25.78 
 
 		 297 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1408  ribonuclease BN, putative  24.26 
 
 		 317 aa  53.9  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  27.73 
 
 		 322 aa  53.9  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  22.76 
 
 		 304 aa  54.3  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3144  ribonuclease BN  32.43 
 
 		 438 aa  54.3  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  24.37 
 
 		 322 aa  53.5  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3128  ribonuclease BN  19.66 
 
 		 338 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3229  ribonuclease BN  19.66 
 
 		 338 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  23.9 
 
 		 328 aa  53.1  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>