173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4509 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4509  ribonuclease BN  100 
 
 		 293 aa  570  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.581699  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4573  ribonuclease BN  92.15 
 
 		 293 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101037  hitchhiker  0.00311377 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2188  ribonuclease BN  78.14 
 
 		 317 aa  424  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.811945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2506  ribonuclease BN  76.92 
 
 		 315 aa  410  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.000575853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2230  ribonuclease BN  76.92 
 
 		 315 aa  410  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.956243  normal  0.534293 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4347  ribonuclease BN  76.79 
 
 		 295 aa  409  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3250  ribonuclease BN  52.99 
 
 		 302 aa  289  3e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5235  ribonuclease BN  53.96 
 
 		 297 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.192166  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0308  putative ribonuclease BN  53.33 
 
 		 300 aa  272  6e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.686269  normal  0.0663425 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0280  ribonuclease BN  52.63 
 
 		 288 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.108034 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0927  ribonuclease BN  50.17 
 
 		 297 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0816  ribonuclease BN  50.18 
 
 		 297 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.941783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0750  ribonuclease BN  50.52 
 
 		 297 aa  262  4e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4883  ribonuclease BN  49.65 
 
 		 297 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.178095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3484  ribonuclease BN  49.49 
 
 		 297 aa  255  6e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1137  ribonuclease BN-like family transmembrane protein  47.97 
 
 		 301 aa  250  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1004  putative ribonuclease BN  46.04 
 
 		 288 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1978  ribonuclease BN, putative  46.04 
 
 		 286 aa  215  9e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1903  YihY family protein  46.04 
 
 		 286 aa  215  9e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2527  putative ribonuclease BN  43.66 
 
 		 290 aa  202  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.322273 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3028  putative ribonuclease BN  42.59 
 
 		 283 aa  194  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.2377  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4005  ribonuclease transmembrane protein  41.84 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3556  ribonuclease BN  41.99 
 
 		 307 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176466  normal  0.953277 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3849  ribonuclease BN  40.91 
 
 		 307 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0051  YihY family protein  37.69 
 
 		 285 aa  155  7e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1180  ribonuclease BN, putative  37.91 
 
 		 288 aa  152  8.999999999999999e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.012264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  28.74 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  28.35 
 
 		 283 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  26.95 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  26.84 
 
 		 289 aa  102  7e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  31.32 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  30.42 
 
 		 316 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  30.68 
 
 		 299 aa  99  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  29.21 
 
 		 289 aa  99  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  30.48 
 
 		 316 aa  98.2  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  27.96 
 
 		 328 aa  96.7  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  27.6 
 
 		 316 aa  96.3  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  28.42 
 
 		 289 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  28.42 
 
 		 289 aa  96.3  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  28.42 
 
 		 289 aa  96.3  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  28.42 
 
 		 289 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  28.42 
 
 		 289 aa  96.3  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  28.42 
 
 		 289 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  28.16 
 
 		 288 aa  95.5  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  28.16 
 
 		 288 aa  95.5  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  30.8 
 
 		 341 aa  94  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  28.32 
 
 		 286 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  30 
 
 		 359 aa  89.4  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  26.94 
 
 		 277 aa  88.2  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  28.46 
 
 		 363 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  28.7 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  29.9 
 
 		 323 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  29.41 
 
 		 321 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4768  ribonuclease BN  31.05 
 
 		 307 aa  82  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211591  normal  0.0891393 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  28.31 
 
 		 277 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  26.49 
 
 		 392 aa  79  0.00000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0504  ribonuclease BN  24.72 
 
 		 279 aa  79  0.0000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0979638  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0529  YihY family protein  23.08 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0656  ribonuclease BN  27.97 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.173698 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  26.82 
 
 		 319 aa  75.5  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  27.6 
 
 		 349 aa  74.3  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1292  ribonuclease BN family protein  25.2 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  28.51 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  28.51 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  28.51 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0395  YihY family protein  24.83 
 
 		 279 aa  72  0.00000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  29.47 
 
 		 401 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  29.66 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  28.05 
 
 		 317 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3128  ribonuclease BN  29.13 
 
 		 338 aa  69.7  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1616  ribonuclease BN  27.31 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119172  normal  0.116701 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3229  ribonuclease BN  29.13 
 
 		 338 aa  69.7  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3031  ribonuclease BN, putative  28.05 
 
 		 338 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3478  ribonuclease BN  25.21 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000152191  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  26.29 
 
 		 386 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4670  ribonuclease BN, putative  28.46 
 
 		 296 aa  67  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  24.03 
 
 		 414 aa  66.2  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0138  putative ribonuclease BN  22.38 
 
 		 371 aa  65.9  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.674179  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  26.12 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  26.12 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  26.12 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  27.9 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  28.08 
 
 		 367 aa  63.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  27.34 
 
 		 374 aa  63.9  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0050  ribonuclease BN  29.03 
 
 		 344 aa  63.5  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  27.8 
 
 		 367 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1250  ribonuclease BN  24.81 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1844  ribonuclease BN  24.22 
 
 		 330 aa  62.4  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00339541 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  28.09 
 
 		 356 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  28.57 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  30.04 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3555  ribonuclease BN  29.57 
 
 		 354 aa  61.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.862191  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  23.81 
 
 		 386 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1074  hypothetical protein  24.15 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177301  normal  0.340121 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  23.08 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  30.83 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  27.42 
 
 		 402 aa  59.7  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  25.83 
 
 		 377 aa  59.3  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3115  ribonuclease BN  24.43 
 
 		 321 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  25.45 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>