111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0632 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0632  ribonuclease BN-like family protein  100 
 
 
301 aa  602  1.0000000000000001e-171  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0847  ribonuclease BN, putative  44.52 
 
 
306 aa  262  4.999999999999999e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1515  ribonuclease BN-like family protein  42.86 
 
 
314 aa  241  9e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1381  putative ribonuclease BN  28.79 
 
 
296 aa  136  5e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.528846  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0701  ribonuclease BN-like family protein  28.43 
 
 
307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  27.84 
 
 
288 aa  106  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  27.84 
 
 
288 aa  106  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  27.8 
 
 
289 aa  105  9e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  26.67 
 
 
289 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  26.67 
 
 
289 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  26.67 
 
 
289 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  26.67 
 
 
289 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  26.67 
 
 
289 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  26.67 
 
 
289 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  26.86 
 
 
289 aa  100  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  26.67 
 
 
286 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  24.06 
 
 
277 aa  97.8  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  27.04 
 
 
277 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  24.55 
 
 
283 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1576  ribonuclease BN-like family protein  27.07 
 
 
282 aa  84.7  0.000000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  25.72 
 
 
276 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  24.19 
 
 
283 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  25.7 
 
 
316 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  25.74 
 
 
321 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  22.71 
 
 
316 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0495  ribonuclease BN-like family protein  28.68 
 
 
286 aa  75.1  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.582599  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  25.99 
 
 
323 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  24.1 
 
 
299 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  24.1 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3487  putative ribonuclease BN  23.42 
 
 
307 aa  72.8  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  27.48 
 
 
317 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  22.22 
 
 
316 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  25.9 
 
 
359 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  24.9 
 
 
392 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  27.01 
 
 
328 aa  68.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  24.63 
 
 
377 aa  66.6  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  27.48 
 
 
319 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0529  YihY family protein  26.19 
 
 
274 aa  64.3  0.000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3128  ribonuclease BN  26.32 
 
 
338 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3229  ribonuclease BN  26.32 
 
 
338 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  27.1 
 
 
318 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  27.1 
 
 
318 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0504  ribonuclease BN  26.19 
 
 
279 aa  63.5  0.000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0979638  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  21.62 
 
 
341 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1292  ribonuclease BN family protein  24.76 
 
 
271 aa  62  0.00000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  23.4 
 
 
347 aa  60.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3031  ribonuclease BN, putative  25.88 
 
 
338 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  26.97 
 
 
356 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19220  predicted membrane protein  23.25 
 
 
463 aa  58.5  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.234203  normal  0.518782 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1095  hypothetical protein  25 
 
 
295 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.377246 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1074  hypothetical protein  21.33 
 
 
313 aa  57.4  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177301  normal  0.340121 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  22.35 
 
 
328 aa  56.6  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1937  putative ribonuclease BN  24.91 
 
 
405 aa  56.6  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.666523  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  28 
 
 
330 aa  56.6  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1971  putative ribonuclease BN  24.91 
 
 
405 aa  56.6  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.493707  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0395  YihY family protein  25.44 
 
 
279 aa  56.2  0.0000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  23.91 
 
 
317 aa  56.2  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  23.46 
 
 
289 aa  56.2  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1616  ribonuclease BN  22.69 
 
 
318 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119172  normal  0.116701 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  24.72 
 
 
320 aa  53.5  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2034  ribonuclease BN  23.85 
 
 
303 aa  53.5  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4235  putative ribonuclease BN  21.92 
 
 
420 aa  52.8  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.721564  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5015  ribonuclease BN  24.12 
 
 
310 aa  52.8  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778134  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  21.72 
 
 
377 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2354  ribonuclease BN  22.77 
 
 
327 aa  52  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  26.74 
 
 
317 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  23.21 
 
 
363 aa  52  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1004  putative ribonuclease BN  24.01 
 
 
288 aa  50.4  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4005  ribonuclease transmembrane protein  31.15 
 
 
298 aa  50.8  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  25 
 
 
322 aa  49.7  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1844  ribonuclease BN  24.71 
 
 
330 aa  49.7  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00339541 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1137  ribonuclease BN-like family transmembrane protein  23.93 
 
 
301 aa  49.3  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1887  hypothetical protein  24.87 
 
 
433 aa  49.3  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.321613  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3484  ribonuclease BN  23.23 
 
 
297 aa  48.9  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2527  putative ribonuclease BN  27.47 
 
 
290 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.322273 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  26.01 
 
 
322 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  21.29 
 
 
330 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  22.56 
 
 
401 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3478  ribonuclease BN  25.81 
 
 
289 aa  48.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000152191  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  21.22 
 
 
365 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1252  ribonuclease BN  21.4 
 
 
324 aa  48.1  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  23.26 
 
 
351 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0051  YihY family protein  26.82 
 
 
285 aa  47.4  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3250  ribonuclease BN  25.28 
 
 
302 aa  47.8  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3849  ribonuclease BN  25.86 
 
 
307 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  23.17 
 
 
349 aa  47  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1978  ribonuclease BN, putative  24.69 
 
 
286 aa  47  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1903  YihY family protein  24.69 
 
 
286 aa  47  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  21.2 
 
 
334 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  21.67 
 
 
350 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  21.67 
 
 
350 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  21.67 
 
 
350 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3556  ribonuclease BN  28.85 
 
 
307 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176466  normal  0.953277 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5922  ribonuclease BN  22.22 
 
 
323 aa  46.2  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23599  normal  0.574915 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2813  ribonuclease BN  22.71 
 
 
336 aa  45.8  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.934919 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  23.64 
 
 
374 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  22.76 
 
 
331 aa  45.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  23.46 
 
 
367 aa  45.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  19.93 
 
 
301 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  21.74 
 
 
328 aa  44.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>