222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3556 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3556  ribonuclease BN  100 
 
 		 307 aa  607  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176466  normal  0.953277 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3849  ribonuclease BN  96.74 
 
 		 307 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4005  ribonuclease transmembrane protein  68.88 
 
 		 298 aa  358  8e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2527  putative ribonuclease BN  66.55 
 
 		 290 aa  357  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.322273 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1004  putative ribonuclease BN  56.52 
 
 		 288 aa  297  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1978  ribonuclease BN, putative  55.43 
 
 		 286 aa  293  3e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1903  YihY family protein  55.43 
 
 		 286 aa  293  3e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3028  putative ribonuclease BN  53.43 
 
 		 283 aa  286  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.2377  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3250  ribonuclease BN  49.25 
 
 		 302 aa  248  1e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0280  ribonuclease BN  51.11 
 
 		 288 aa  247  2e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.108034 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1137  ribonuclease BN-like family transmembrane protein  47.52 
 
 		 301 aa  246  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0308  putative ribonuclease BN  48.34 
 
 		 300 aa  244  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.686269  normal  0.0663425 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5235  ribonuclease BN  45.85 
 
 		 297 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.192166  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0927  ribonuclease BN  46.57 
 
 		 297 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0750  ribonuclease BN  44.68 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3484  ribonuclease BN  44.68 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4883  ribonuclease BN  46.1 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.178095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0816  ribonuclease BN  46.21 
 
 		 297 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.941783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0051  YihY family protein  45.13 
 
 		 285 aa  223  3e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4509  ribonuclease BN  42.34 
 
 		 293 aa  199  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.581699  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4573  ribonuclease BN  41.26 
 
 		 293 aa  199  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101037  hitchhiker  0.00311377 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4347  ribonuclease BN  42.76 
 
 		 295 aa  194  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2188  ribonuclease BN  42.6 
 
 		 317 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.811945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2230  ribonuclease BN  40.92 
 
 		 315 aa  188  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.956243  normal  0.534293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2506  ribonuclease BN  40.92 
 
 		 315 aa  188  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.000575853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1180  ribonuclease BN, putative  36.69 
 
 		 288 aa  149  6e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.012264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0529  YihY family protein  28.62 
 
 		 274 aa  122  9.999999999999999e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0504  ribonuclease BN  29.39 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0979638  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1292  ribonuclease BN family protein  28.92 
 
 		 271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  31.39 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  31.16 
 
 		 289 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  31.16 
 
 		 289 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  31.16 
 
 		 289 aa  110  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  31.16 
 
 		 289 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  31.16 
 
 		 289 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  31.16 
 
 		 289 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  31.6 
 
 		 286 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  30.53 
 
 		 289 aa  109  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  31.85 
 
 		 392 aa  108  8.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  31.16 
 
 		 288 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  31.16 
 
 		 288 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  29.57 
 
 		 283 aa  106  6e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  30 
 
 		 283 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  28.23 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0656  ribonuclease BN  30.35 
 
 		 355 aa  99.8  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.173698 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  28.47 
 
 		 299 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  27.72 
 
 		 299 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  28.71 
 
 		 277 aa  97.1  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0395  YihY family protein  26.6 
 
 		 279 aa  97.1  3e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  26.67 
 
 		 276 aa  97.1  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  26.55 
 
 		 277 aa  95.9  7e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  28.63 
 
 		 323 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  27.59 
 
 		 321 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  26.47 
 
 		 318 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  26.47 
 
 		 319 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  26.47 
 
 		 318 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  26.04 
 
 		 359 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  29.56 
 
 		 289 aa  89.4  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  25.85 
 
 		 317 aa  89  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0050  ribonuclease BN  29.41 
 
 		 344 aa  88.6  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4768  ribonuclease BN  29.2 
 
 		 307 aa  87.4  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211591  normal  0.0891393 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  25.49 
 
 		 363 aa  86.3  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  26.01 
 
 		 349 aa  85.9  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  26.69 
 
 		 401 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  26.59 
 
 		 328 aa  80.5  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  25.34 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  26.22 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  27.37 
 
 		 341 aa  80.1  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  27.05 
 
 		 351 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  28.85 
 
 		 374 aa  79.3  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  26.95 
 
 		 330 aa  79  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5015  ribonuclease BN  22.85 
 
 		 310 aa  75.9  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  28.52 
 
 		 356 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  26.54 
 
 		 347 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3031  ribonuclease BN, putative  27.27 
 
 		 338 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  26.16 
 
 		 351 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  24.16 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  28.52 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2034  ribonuclease BN  26.36 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  27.78 
 
 		 334 aa  73.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1971  putative ribonuclease BN  29.65 
 
 		 405 aa  72.4  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.493707  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1937  putative ribonuclease BN  29.65 
 
 		 405 aa  72.4  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.666523  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  27.34 
 
 		 333 aa  72.4  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  30.64 
 
 		 322 aa  72.4  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  31.58 
 
 		 322 aa  71.6  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1844  ribonuclease BN  27.36 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00339541 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  25.16 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  29.79 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3478  ribonuclease BN  25.95 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000152191  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  27.92 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  26.59 
 
 		 328 aa  69.3  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4670  ribonuclease BN, putative  24.91 
 
 		 296 aa  68.9  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  30.18 
 
 		 317 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08810  predicted membrane protein  31.63 
 
 		 417 aa  68.2  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0487855  normal  0.0524825 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  27.97 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5922  ribonuclease BN  24.54 
 
 		 323 aa  67  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.23599  normal  0.574915 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1381  putative ribonuclease BN  25.68 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.528846  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1115  ribonuclease BN  23.51 
 
 		 347 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1265  ribonuclease BN  23.51 
 
 		 347 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  28.02 
 
 		 331 aa  65.9  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>