154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0050 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0050  ribonuclease BN  100 
 
 		 344 aa  679    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0656  ribonuclease BN  49.55 
 
 		 355 aa  293  4e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.173698 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4768  ribonuclease BN  46.18 
 
 		 307 aa  253  5.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211591  normal  0.0891393 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3028  putative ribonuclease BN  32.71 
 
 		 283 aa  89  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.2377  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1292  ribonuclease BN family protein  26.88 
 
 		 271 aa  86.7  5e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1978  ribonuclease BN, putative  31.23 
 
 		 286 aa  84.7  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0504  ribonuclease BN  28.46 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0979638  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1903  YihY family protein  31.23 
 
 		 286 aa  84.7  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0529  YihY family protein  28.08 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1004  putative ribonuclease BN  29.1 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  25.94 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  27.94 
 
 		 286 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3849  ribonuclease BN  29.13 
 
 		 307 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  29.2 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  29.2 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3556  ribonuclease BN  28.74 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176466  normal  0.953277 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0280  ribonuclease BN  27.38 
 
 		 288 aa  75.9  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.108034 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  28.69 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  28.69 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  28.69 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  28.69 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  28.69 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  28.69 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4005  ribonuclease transmembrane protein  26.79 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  28 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  28.29 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0308  putative ribonuclease BN  29.15 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.686269  normal  0.0663425 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  25.27 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0750  ribonuclease BN  29.24 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  24.76 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2527  putative ribonuclease BN  26.62 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.322273 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  25.09 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5235  ribonuclease BN  28.32 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.192166  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3495  ribonuclease BN  28.85 
 
 		 342 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.385493 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  24.57 
 
 		 350 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  24.57 
 
 		 350 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  24.57 
 
 		 350 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  23.55 
 
 		 349 aa  68.9  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4883  ribonuclease BN  26.94 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.178095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  24.29 
 
 		 386 aa  68.6  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  22.34 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  26.62 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  23.42 
 
 		 374 aa  67  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  22.34 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3250  ribonuclease BN  27.48 
 
 		 302 aa  67  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  21.12 
 
 		 320 aa  67  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  22.96 
 
 		 283 aa  67  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  26.14 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4573  ribonuclease BN  28.88 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101037  hitchhiker  0.00311377 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  23.05 
 
 		 356 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  23.33 
 
 		 277 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1517  putative ribonuclease BN  25.35 
 
 		 317 aa  65.5  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.573557  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  21.28 
 
 		 401 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  20.98 
 
 		 396 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0927  ribonuclease BN  27.11 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0816  ribonuclease BN  27.51 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.941783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  24.91 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1180  ribonuclease BN, putative  28.08 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.012264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  23.27 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  22.22 
 
 		 316 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  23.49 
 
 		 321 aa  62  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3484  ribonuclease BN  27.72 
 
 		 297 aa  62.4  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  21.4 
 
 		 283 aa  62.4  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  24.01 
 
 		 299 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  25.48 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  21.21 
 
 		 330 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  25.23 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  25.89 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1249  ribonuclease BN  30.56 
 
 		 360 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00563624  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  23.99 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5245  ribonuclease BN  23.44 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  25.52 
 
 		 392 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  25.79 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  25.27 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1137  ribonuclease BN-like family transmembrane protein  27.57 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  22.41 
 
 		 334 aa  59.3  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1252  ribonuclease BN  24.17 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4672  ribonuclease BN  25.23 
 
 		 359 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.498388  normal  0.619058 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4509  ribonuclease BN  29.84 
 
 		 293 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.581699  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  22.03 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0818  ribonuclease BN  24.73 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  25.45 
 
 		 384 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  24.18 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1336  putative ribonuclease BN  25.23 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.926948  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1250  ribonuclease BN  22.52 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  25.3 
 
 		 386 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  23.68 
 
 		 323 aa  57  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  25.24 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  21.25 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  23.36 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  21.9 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  20.79 
 
 		 377 aa  56.2  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2494  ribonuclease BN  25.07 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.12214  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4776  ribonuclease BN  22.73 
 
 		 367 aa  56.2  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0858939  normal  0.337427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  24.22 
 
 		 365 aa  56.2  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  21.49 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  25.36 
 
 		 371 aa  55.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3487  putative ribonuclease BN  21.5 
 
 		 307 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  21.49 
 
 		 318 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  21.9 
 
 		 317 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>