235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1180 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1180  ribonuclease BN, putative  100 
 
 		 288 aa  566  1e-160  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.012264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1004  putative ribonuclease BN  40.22 
 
 		 288 aa  179  5.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1978  ribonuclease BN, putative  40 
 
 		 286 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1903  YihY family protein  40 
 
 		 286 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4573  ribonuclease BN  38.95 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101037  hitchhiker  0.00311377 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0308  putative ribonuclease BN  37.68 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.686269  normal  0.0663425 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0280  ribonuclease BN  39.69 
 
 		 288 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.108034 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2527  putative ribonuclease BN  38.93 
 
 		 290 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.322273 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3250  ribonuclease BN  37.23 
 
 		 302 aa  169  4e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3028  putative ribonuclease BN  39.43 
 
 		 283 aa  168  8e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.2377  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4347  ribonuclease BN  38.2 
 
 		 295 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4509  ribonuclease BN  38.35 
 
 		 293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.581699  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4005  ribonuclease transmembrane protein  38.63 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2188  ribonuclease BN  38.43 
 
 		 317 aa  156  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.811945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2230  ribonuclease BN  39.18 
 
 		 315 aa  157  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.956243  normal  0.534293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2506  ribonuclease BN  39.18 
 
 		 315 aa  157  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.000575853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5235  ribonuclease BN  36.49 
 
 		 297 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.192166  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0927  ribonuclease BN  37.36 
 
 		 297 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4883  ribonuclease BN  35.48 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.178095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1137  ribonuclease BN-like family transmembrane protein  35.19 
 
 		 301 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3556  ribonuclease BN  36.92 
 
 		 307 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176466  normal  0.953277 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0816  ribonuclease BN  34.8 
 
 		 297 aa  145  9e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.941783  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3849  ribonuclease BN  37.32 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3484  ribonuclease BN  35.56 
 
 		 297 aa  142  7e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0750  ribonuclease BN  34.89 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  27.14 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  30.5 
 
 		 316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0051  YihY family protein  30.86 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  29.48 
 
 		 286 aa  109  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  30.18 
 
 		 289 aa  107  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  29.89 
 
 		 289 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  33.48 
 
 		 277 aa  106  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  28.36 
 
 		 283 aa  105  9e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  30.26 
 
 		 288 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  30.26 
 
 		 288 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  28.73 
 
 		 283 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  29.52 
 
 		 289 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  29.52 
 
 		 289 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  29.52 
 
 		 289 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  29.52 
 
 		 289 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  29.52 
 
 		 289 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  29.52 
 
 		 289 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  32.26 
 
 		 328 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  26.48 
 
 		 276 aa  100  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  31.63 
 
 		 321 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  29.21 
 
 		 359 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  29.45 
 
 		 363 aa  93.2  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  32.85 
 
 		 323 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  30.05 
 
 		 318 aa  89  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  30.05 
 
 		 319 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  30.05 
 
 		 318 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  27.92 
 
 		 392 aa  87.8  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  28.52 
 
 		 316 aa  87.8  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  33.5 
 
 		 289 aa  86.7  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  31 
 
 		 374 aa  86.7  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  25.64 
 
 		 299 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  28.1 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  25.27 
 
 		 299 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  29.35 
 
 		 349 aa  82.8  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0050  ribonuclease BN  28.08 
 
 		 344 aa  82  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0656  ribonuclease BN  27.54 
 
 		 355 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.173698 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  28.52 
 
 		 401 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  28 
 
 		 328 aa  80.1  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  25.52 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0529  YihY family protein  23.81 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  27.27 
 
 		 319 aa  79  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  28.92 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  26.76 
 
 		 317 aa  78.2  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  29.37 
 
 		 386 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1250  ribonuclease BN  25.35 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  29.54 
 
 		 328 aa  77.8  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0138  putative ribonuclease BN  22.57 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.674179  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  26.43 
 
 		 320 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  29.27 
 
 		 318 aa  75.5  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  28.78 
 
 		 396 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  28.41 
 
 		 397 aa  72.4  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  28.41 
 
 		 397 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6638  ribonuclease BN  30.55 
 
 		 365 aa  72.4  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0964691 
 
 
-
 
NC_002978  WD1292  ribonuclease BN family protein  22.22 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0504  ribonuclease BN  21.6 
 
 		 279 aa  72  0.00000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0979638  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  33.18 
 
 		 371 aa  71.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  27.54 
 
 		 350 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  27.54 
 
 		 350 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  27.54 
 
 		 350 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  27.01 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3229  ribonuclease BN  30 
 
 		 338 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3128  ribonuclease BN  30 
 
 		 338 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  28.17 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  24.07 
 
 		 341 aa  70.1  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4768  ribonuclease BN  26.99 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211591  normal  0.0891393 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3115  ribonuclease BN  25.09 
 
 		 321 aa  68.9  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  27.01 
 
 		 377 aa  68.9  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  27.11 
 
 		 386 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  28.11 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1517  putative ribonuclease BN  29.01 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.573557  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  31.22 
 
 		 322 aa  67  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4670  ribonuclease BN, putative  24.09 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1408  ribonuclease BN, putative  29.25 
 
 		 317 aa  66.6  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08426  Ribonuclease BN  24.45 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.724596  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5245  ribonuclease BN  30.65 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>