169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0280 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0280  ribonuclease BN  100 
 
 
288 aa  570  1e-161  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.108034 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3250  ribonuclease BN  69.06 
 
 
302 aa  371  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0308  putative ribonuclease BN  55.63 
 
 
300 aa  318  6e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.686269  normal  0.0663425 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1137  ribonuclease BN-like family transmembrane protein  55.47 
 
 
301 aa  311  9e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0927  ribonuclease BN  56.93 
 
 
297 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5235  ribonuclease BN  52.74 
 
 
297 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.192166  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0816  ribonuclease BN  54.74 
 
 
297 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.941783  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3484  ribonuclease BN  54.01 
 
 
297 aa  295  5e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4883  ribonuclease BN  53.28 
 
 
297 aa  291  7e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.178095  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0750  ribonuclease BN  53.65 
 
 
297 aa  289  3e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4573  ribonuclease BN  49.64 
 
 
293 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101037  hitchhiker  0.00311377 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4509  ribonuclease BN  51.85 
 
 
293 aa  280  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.581699  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2188  ribonuclease BN  52.01 
 
 
317 aa  266  4e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.811945  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4347  ribonuclease BN  51.48 
 
 
295 aa  261  6e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2506  ribonuclease BN  53.99 
 
 
315 aa  260  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.000575853  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2230  ribonuclease BN  53.99 
 
 
315 aa  260  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.956243  normal  0.534293 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1004  putative ribonuclease BN  48.75 
 
 
288 aa  256  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1978  ribonuclease BN, putative  48.75 
 
 
286 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1903  YihY family protein  48.75 
 
 
286 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3028  putative ribonuclease BN  50.37 
 
 
283 aa  247  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.2377  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2527  putative ribonuclease BN  49.09 
 
 
290 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.322273 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3556  ribonuclease BN  51.26 
 
 
307 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176466  normal  0.953277 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3849  ribonuclease BN  50.54 
 
 
307 aa  235  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4005  ribonuclease transmembrane protein  47.87 
 
 
298 aa  230  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0051  YihY family protein  41.52 
 
 
285 aa  204  2e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1180  ribonuclease BN, putative  39.18 
 
 
288 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.012264  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  29.43 
 
 
283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  29.17 
 
 
283 aa  109  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0504  ribonuclease BN  26.35 
 
 
279 aa  107  2e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0979638  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  28.26 
 
 
289 aa  105  7e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0529  YihY family protein  25.09 
 
 
274 aa  105  8e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  28.87 
 
 
316 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  27.44 
 
 
289 aa  103  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  28.97 
 
 
299 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  26.81 
 
 
289 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  26.81 
 
 
289 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  26.81 
 
 
289 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  26.81 
 
 
289 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  26.81 
 
 
289 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  27.5 
 
 
286 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  26.81 
 
 
289 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  28.77 
 
 
299 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  27.8 
 
 
288 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  27.8 
 
 
288 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1292  ribonuclease BN family protein  27.44 
 
 
271 aa  95.1  1e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  28 
 
 
392 aa  94.4  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  25.09 
 
 
276 aa  93.2  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0656  ribonuclease BN  31.27 
 
 
355 aa  92  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.173698 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  28.46 
 
 
328 aa  90.9  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  25.56 
 
 
277 aa  90.1  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  27.11 
 
 
316 aa  87.4  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  26.9 
 
 
316 aa  86.3  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0050  ribonuclease BN  28.98 
 
 
344 aa  85.9  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  27.08 
 
 
341 aa  85.9  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  30.21 
 
 
359 aa  85.5  9e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  30.04 
 
 
289 aa  83.2  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4768  ribonuclease BN  29.52 
 
 
307 aa  82.8  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211591  normal  0.0891393 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  25.33 
 
 
277 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  28.19 
 
 
323 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  28.24 
 
 
321 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0395  YihY family protein  24.28 
 
 
279 aa  77.8  0.0000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  22.92 
 
 
320 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  25.51 
 
 
363 aa  73.6  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  28.38 
 
 
318 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  27.73 
 
 
356 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  25.83 
 
 
401 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  25.36 
 
 
349 aa  72  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  28.38 
 
 
318 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  28.11 
 
 
319 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  26.7 
 
 
317 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1073  ribonuclease BN  24.43 
 
 
328 aa  69.3  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3487  putative ribonuclease BN  22.09 
 
 
307 aa  69.3  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3128  ribonuclease BN  27.92 
 
 
338 aa  69.3  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3229  ribonuclease BN  27.92 
 
 
338 aa  69.3  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  26.3 
 
 
317 aa  67.8  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  23.99 
 
 
386 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1937  putative ribonuclease BN  28.12 
 
 
405 aa  67  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.666523  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1971  putative ribonuclease BN  28.12 
 
 
405 aa  67  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.493707  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3031  ribonuclease BN, putative  28.33 
 
 
338 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  28 
 
 
351 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  22.39 
 
 
386 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08426  Ribonuclease BN  25.19 
 
 
307 aa  65.5  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.724596  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  25.94 
 
 
319 aa  64.3  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  24.62 
 
 
388 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  24.62 
 
 
388 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  24.35 
 
 
397 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  24.35 
 
 
397 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  22.84 
 
 
321 aa  63.5  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  27.88 
 
 
384 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  24.11 
 
 
328 aa  63.2  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  26.55 
 
 
331 aa  62.8  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5015  ribonuclease BN  22.35 
 
 
310 aa  62.4  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778134  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  26.11 
 
 
322 aa  62  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  24.35 
 
 
396 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  24.73 
 
 
386 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  24.9 
 
 
375 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  26.72 
 
 
347 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  23.83 
 
 
328 aa  60.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  26.73 
 
 
386 aa  60.1  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0138  putative ribonuclease BN  24.09 
 
 
371 aa  60.5  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.674179  normal  0.0540864 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>