227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3028 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3028  putative ribonuclease BN  100 
 
 		 283 aa  548  1e-155  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.2377  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1004  putative ribonuclease BN  62.5 
 
 		 288 aa  335  3.9999999999999995e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1978  ribonuclease BN, putative  61.9 
 
 		 286 aa  328  5.0000000000000004e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1903  YihY family protein  61.9 
 
 		 286 aa  328  5.0000000000000004e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2527  putative ribonuclease BN  56.18 
 
 		 290 aa  288  5.0000000000000004e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.322273 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0308  putative ribonuclease BN  50.92 
 
 		 300 aa  280  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.686269  normal  0.0663425 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3849  ribonuclease BN  55.51 
 
 		 307 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3556  ribonuclease BN  53.43 
 
 		 307 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176466  normal  0.953277 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3250  ribonuclease BN  48.7 
 
 		 302 aa  256  3e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0750  ribonuclease BN  48.93 
 
 		 297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4005  ribonuclease transmembrane protein  48.9 
 
 		 298 aa  253  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3484  ribonuclease BN  48.93 
 
 		 297 aa  250  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0051  YihY family protein  49.1 
 
 		 285 aa  249  3e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1137  ribonuclease BN-like family transmembrane protein  47.79 
 
 		 301 aa  246  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4883  ribonuclease BN  46.79 
 
 		 297 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.178095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0280  ribonuclease BN  50.19 
 
 		 288 aa  239  5e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.108034 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0927  ribonuclease BN  46.93 
 
 		 297 aa  238  8e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0816  ribonuclease BN  45.49 
 
 		 297 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.941783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5235  ribonuclease BN  45.71 
 
 		 297 aa  234  9e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.192166  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4573  ribonuclease BN  41.83 
 
 		 293 aa  202  5e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101037  hitchhiker  0.00311377 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4509  ribonuclease BN  42.97 
 
 		 293 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.581699  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4347  ribonuclease BN  41.83 
 
 		 295 aa  187  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2188  ribonuclease BN  40.99 
 
 		 317 aa  187  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.811945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2230  ribonuclease BN  42.21 
 
 		 315 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.956243  normal  0.534293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2506  ribonuclease BN  42.21 
 
 		 315 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.000575853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1180  ribonuclease BN, putative  39.43 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.012264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  29.88 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  29.2 
 
 		 276 aa  117  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  30.22 
 
 		 289 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  29.08 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  29.48 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  32.35 
 
 		 392 aa  113  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  27.56 
 
 		 277 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  29.81 
 
 		 286 aa  112  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  29.85 
 
 		 289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  29.85 
 
 		 289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  29.85 
 
 		 289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  29.85 
 
 		 289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  29.85 
 
 		 289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0529  YihY family protein  28.94 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  29.85 
 
 		 289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  30.26 
 
 		 288 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  30.26 
 
 		 288 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  28.04 
 
 		 277 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0504  ribonuclease BN  24.8 
 
 		 279 aa  97.8  2e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0979638  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0050  ribonuclease BN  33.09 
 
 		 344 aa  97.1  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0656  ribonuclease BN  30.5 
 
 		 355 aa  96.7  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.173698 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  27.96 
 
 		 316 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1292  ribonuclease BN family protein  27.59 
 
 		 271 aa  95.5  1e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  25.89 
 
 		 299 aa  92  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  29.59 
 
 		 359 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  25 
 
 		 299 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  28.32 
 
 		 328 aa  86.7  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  29.56 
 
 		 349 aa  86.7  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  24.73 
 
 		 341 aa  82  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  28.64 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4768  ribonuclease BN  26.69 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211591  normal  0.0891393 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  23.36 
 
 		 316 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  24.5 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  23.72 
 
 		 316 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  32.08 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3487  putative ribonuclease BN  22.01 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  25.95 
 
 		 363 aa  76.6  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  34.92 
 
 		 322 aa  76.3  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  28.5 
 
 		 317 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  27.23 
 
 		 321 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  29.35 
 
 		 319 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  28.52 
 
 		 401 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  28.86 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5015  ribonuclease BN  22.76 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  28.86 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  29.15 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  33.68 
 
 		 386 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  26.76 
 
 		 386 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1971  putative ribonuclease BN  31.16 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.493707  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1937  putative ribonuclease BN  31.16 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.666523  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  27.5 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0395  YihY family protein  26.1 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  30.97 
 
 		 322 aa  71.6  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  27.92 
 
 		 367 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3229  ribonuclease BN  27.88 
 
 		 338 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3128  ribonuclease BN  27.88 
 
 		 338 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08426  Ribonuclease BN  28.3 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.724596  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3031  ribonuclease BN, putative  28.68 
 
 		 338 aa  69.3  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  27.96 
 
 		 333 aa  68.9  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  28.46 
 
 		 396 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  29.57 
 
 		 351 aa  68.9  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  25.61 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0138  putative ribonuclease BN  22.41 
 
 		 371 aa  66.6  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.674179  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  27.5 
 
 		 375 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  29.12 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  26.92 
 
 		 397 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  26.92 
 
 		 397 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  28.21 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  25.36 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  28.21 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  28.21 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  23.96 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  30.89 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2034  ribonuclease BN  20 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>