177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2230 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2506  ribonuclease BN  100 
 
 		 315 aa  617  1e-176  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.000575853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2230  ribonuclease BN  100 
 
 		 315 aa  617  1e-176  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.956243  normal  0.534293 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2188  ribonuclease BN  91.75 
 
 		 317 aa  532  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.811945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4347  ribonuclease BN  87.81 
 
 		 295 aa  462  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4573  ribonuclease BN  75.87 
 
 		 293 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101037  hitchhiker  0.00311377 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4509  ribonuclease BN  77.49 
 
 		 293 aa  421  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.581699  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3250  ribonuclease BN  51.67 
 
 		 302 aa  280  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0280  ribonuclease BN  54.69 
 
 		 288 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.108034 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0308  putative ribonuclease BN  50.36 
 
 		 300 aa  268  1e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.686269  normal  0.0663425 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5235  ribonuclease BN  52.3 
 
 		 297 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.192166  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0927  ribonuclease BN  51.07 
 
 		 297 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3484  ribonuclease BN  50 
 
 		 297 aa  253  3e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0816  ribonuclease BN  47.95 
 
 		 297 aa  252  7e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.941783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1137  ribonuclease BN-like family transmembrane protein  47.08 
 
 		 301 aa  251  8.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0750  ribonuclease BN  48.58 
 
 		 297 aa  251  1e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4883  ribonuclease BN  49.06 
 
 		 297 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.178095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1004  putative ribonuclease BN  43.48 
 
 		 288 aa  208  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1978  ribonuclease BN, putative  42.81 
 
 		 286 aa  206  4e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1903  YihY family protein  42.81 
 
 		 286 aa  206  4e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2527  putative ribonuclease BN  43.16 
 
 		 290 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.322273 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3028  putative ribonuclease BN  42.21 
 
 		 283 aa  196  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.2377  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4005  ribonuclease transmembrane protein  43.62 
 
 		 298 aa  194  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3556  ribonuclease BN  41.25 
 
 		 307 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176466  normal  0.953277 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3849  ribonuclease BN  42.2 
 
 		 307 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0051  YihY family protein  37.31 
 
 		 285 aa  170  3e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1180  ribonuclease BN, putative  39.18 
 
 		 288 aa  155  6e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.012264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  31.11 
 
 		 289 aa  112  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  31.73 
 
 		 289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  30.37 
 
 		 288 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  30.37 
 
 		 288 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  30.74 
 
 		 289 aa  109  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  30.74 
 
 		 289 aa  109  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  30.74 
 
 		 289 aa  109  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  30.74 
 
 		 289 aa  109  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  30.74 
 
 		 289 aa  109  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  30.74 
 
 		 289 aa  109  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  31.56 
 
 		 299 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  31.56 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  28.92 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  29.77 
 
 		 316 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  29.15 
 
 		 286 aa  106  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  28.92 
 
 		 283 aa  105  7e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  27.96 
 
 		 392 aa  99.4  7e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  29.07 
 
 		 341 aa  95.9  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  29.03 
 
 		 363 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  24.54 
 
 		 277 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  25.45 
 
 		 276 aa  92  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  30.48 
 
 		 289 aa  90.5  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  28.15 
 
 		 319 aa  90.1  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  27.43 
 
 		 277 aa  89.4  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0529  YihY family protein  24.09 
 
 		 274 aa  89.4  8e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  27.64 
 
 		 328 aa  89  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0504  ribonuclease BN  27.07 
 
 		 279 aa  88.6  1e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0979638  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  28.03 
 
 		 316 aa  87.8  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  28.71 
 
 		 323 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  28.71 
 
 		 321 aa  87  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  27.07 
 
 		 316 aa  86.3  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  26.18 
 
 		 401 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0656  ribonuclease BN  30.83 
 
 		 355 aa  83.2  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.173698 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  26.07 
 
 		 359 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  28.37 
 
 		 349 aa  81.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  29.7 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  29.7 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  29.7 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4768  ribonuclease BN  31.92 
 
 		 307 aa  79  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211591  normal  0.0891393 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4339  ribonuclease BN, putative  27.12 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168174  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4425  putative ribonuclease BN  27.12 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690543  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4719  putative ribonuclease BN  27.12 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  29.21 
 
 		 317 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1292  ribonuclease BN family protein  25.2 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3478  ribonuclease BN  26.42 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000152191  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0395  YihY family protein  25.45 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0425  putative ribonuclease BN  25 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.250516  normal  0.726297 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0559  ribonuclease BN  28.01 
 
 		 402 aa  69.7  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  25.1 
 
 		 386 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  28.75 
 
 		 333 aa  68.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  26.52 
 
 		 356 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  26.14 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0138  putative ribonuclease BN  24.19 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.674179  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  26.5 
 
 		 377 aa  67  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  28.57 
 
 		 331 aa  67  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  29.84 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  27.94 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1005  putative ribonuclease BN  26.32 
 
 		 318 aa  65.9  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0050  ribonuclease BN  30.58 
 
 		 344 aa  65.9  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  24.2 
 
 		 386 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1074  hypothetical protein  24.18 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177301  normal  0.340121 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1981  ribonuclease BN  29.08 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00254117  normal  0.063681 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  29.13 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  28.33 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  26.48 
 
 		 328 aa  65.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3229  ribonuclease BN  30.95 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3128  ribonuclease BN  30.95 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5015  ribonuclease BN  25.81 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1844  ribonuclease BN  24.51 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00339541 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3031  ribonuclease BN, putative  27.83 
 
 		 338 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08810  predicted membrane protein  27.65 
 
 		 417 aa  63.5  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0487855  normal  0.0524825 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  27.56 
 
 		 388 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  27.2 
 
 		 374 aa  62.8  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1478  ribonuclease BN  26.07 
 
 		 304 aa  62  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0594099  normal  0.181056 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>