211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3849 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3849  ribonuclease BN  100 
 
 
307 aa  607  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3556  ribonuclease BN  96.74 
 
 
307 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176466  normal  0.953277 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2527  putative ribonuclease BN  66.21 
 
 
290 aa  363  3e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.322273 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4005  ribonuclease transmembrane protein  67.83 
 
 
298 aa  355  7.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1004  putative ribonuclease BN  56.16 
 
 
288 aa  299  5e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1978  ribonuclease BN, putative  55.07 
 
 
286 aa  295  8e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1903  YihY family protein  55.07 
 
 
286 aa  295  8e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3028  putative ribonuclease BN  55.51 
 
 
283 aa  288  7e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.2377  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3250  ribonuclease BN  48.88 
 
 
302 aa  245  8e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0308  putative ribonuclease BN  47.79 
 
 
300 aa  244  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.686269  normal  0.0663425 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1137  ribonuclease BN-like family transmembrane protein  46.81 
 
 
301 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0280  ribonuclease BN  50.37 
 
 
288 aa  242  6e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.108034 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3484  ribonuclease BN  43.1 
 
 
297 aa  238  1e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0750  ribonuclease BN  44.33 
 
 
297 aa  237  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5235  ribonuclease BN  45.13 
 
 
297 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.192166  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4883  ribonuclease BN  43.48 
 
 
297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.178095  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0927  ribonuclease BN  45.85 
 
 
297 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0816  ribonuclease BN  45.49 
 
 
297 aa  228  8e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.941783  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0051  YihY family protein  45.13 
 
 
285 aa  223  3e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4573  ribonuclease BN  40.91 
 
 
293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101037  hitchhiker  0.00311377 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4509  ribonuclease BN  41.39 
 
 
293 aa  196  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.581699  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4347  ribonuclease BN  42.55 
 
 
295 aa  189  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2188  ribonuclease BN  42.5 
 
 
317 aa  187  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.811945  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2230  ribonuclease BN  42.2 
 
 
315 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.956243  normal  0.534293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2506  ribonuclease BN  42.2 
 
 
315 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.000575853  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1180  ribonuclease BN, putative  35.9 
 
 
288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.012264  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0504  ribonuclease BN  29.75 
 
 
279 aa  121  9.999999999999999e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0979638  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0529  YihY family protein  27.53 
 
 
274 aa  121  9.999999999999999e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  30.14 
 
 
289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  29.97 
 
 
286 aa  112  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1292  ribonuclease BN family protein  28.92 
 
 
271 aa  112  7.000000000000001e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  30.72 
 
 
289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  30.72 
 
 
289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  30.72 
 
 
289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  30.72 
 
 
289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  30.72 
 
 
289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  30.72 
 
 
289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  30.37 
 
 
392 aa  109  6e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  30.61 
 
 
288 aa  109  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  30.61 
 
 
288 aa  109  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  30.47 
 
 
289 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  30.12 
 
 
283 aa  106  6e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  30.62 
 
 
283 aa  105  7e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0656  ribonuclease BN  29.96 
 
 
355 aa  100  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.173698 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  28.78 
 
 
316 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0395  YihY family protein  26.6 
 
 
279 aa  97.4  2e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  26.56 
 
 
299 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  26.89 
 
 
299 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  29.38 
 
 
277 aa  94.7  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  26.3 
 
 
276 aa  94  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  26.74 
 
 
277 aa  93.6  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4768  ribonuclease BN  28.52 
 
 
307 aa  90.1  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211591  normal  0.0891393 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0050  ribonuclease BN  29.8 
 
 
344 aa  90.1  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  25.4 
 
 
318 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  29.56 
 
 
289 aa  87  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  25.4 
 
 
318 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  26.23 
 
 
319 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  25.42 
 
 
317 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  26.84 
 
 
323 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  26.29 
 
 
321 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  25.35 
 
 
359 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  26.74 
 
 
341 aa  83.6  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  27.05 
 
 
351 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  25.25 
 
 
349 aa  79.3  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  25.75 
 
 
363 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  29.56 
 
 
374 aa  78.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  25.94 
 
 
401 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  28.78 
 
 
356 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  25.84 
 
 
328 aa  76.3  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  26.81 
 
 
330 aa  76.3  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1937  putative ribonuclease BN  31.5 
 
 
405 aa  75.5  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.666523  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1971  putative ribonuclease BN  31.5 
 
 
405 aa  75.5  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.493707  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  27.78 
 
 
333 aa  75.1  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  24.54 
 
 
320 aa  75.1  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  26.77 
 
 
347 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5015  ribonuclease BN  22.85 
 
 
310 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778134  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  26.39 
 
 
351 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  25.59 
 
 
316 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  25.35 
 
 
316 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3031  ribonuclease BN, putative  26.19 
 
 
338 aa  73.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2034  ribonuclease BN  26.36 
 
 
303 aa  72.8  0.000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  31.58 
 
 
322 aa  71.6  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  27.36 
 
 
319 aa  71.2  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  30.06 
 
 
322 aa  71.6  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  30.42 
 
 
328 aa  70.5  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3478  ribonuclease BN  26.63 
 
 
289 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000152191  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1844  ribonuclease BN  25.77 
 
 
330 aa  69.3  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00339541 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1265  ribonuclease BN  24.91 
 
 
347 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1115  ribonuclease BN  24.91 
 
 
347 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  27.08 
 
 
334 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1440  ribonuclease BN  29.39 
 
 
317 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4670  ribonuclease BN, putative  24.18 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08810  predicted membrane protein  30.61 
 
 
417 aa  67  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0487855  normal  0.0524825 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1381  putative ribonuclease BN  25.68 
 
 
296 aa  66.6  0.0000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.528846  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  26.55 
 
 
321 aa  66.2  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3778  ribonuclease BN  25.64 
 
 
348 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541742  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  24.63 
 
 
318 aa  65.9  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  25.94 
 
 
331 aa  64.7  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  26.09 
 
 
388 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  25.93 
 
 
328 aa  65.1  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>