203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1978 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1978  ribonuclease BN, putative  100 
 
 
286 aa  569  1e-161  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1903  YihY family protein  100 
 
 
286 aa  569  1e-161  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1004  putative ribonuclease BN  92.61 
 
 
288 aa  511  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3028  putative ribonuclease BN  61.9 
 
 
283 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.2377  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2527  putative ribonuclease BN  59.34 
 
 
290 aa  308  5e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.322273 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0051  YihY family protein  57.09 
 
 
285 aa  298  8e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3849  ribonuclease BN  55.07 
 
 
307 aa  286  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3556  ribonuclease BN  55.43 
 
 
307 aa  285  7e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176466  normal  0.953277 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4005  ribonuclease transmembrane protein  55.84 
 
 
298 aa  276  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0308  putative ribonuclease BN  51.48 
 
 
300 aa  275  8e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.686269  normal  0.0663425 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3250  ribonuclease BN  51.89 
 
 
302 aa  269  5e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5235  ribonuclease BN  49.3 
 
 
297 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.192166  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1137  ribonuclease BN-like family transmembrane protein  48.55 
 
 
301 aa  258  8e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0927  ribonuclease BN  45.45 
 
 
297 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3484  ribonuclease BN  47.99 
 
 
297 aa  249  3e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0816  ribonuclease BN  47.12 
 
 
297 aa  248  8e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.941783  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4883  ribonuclease BN  47.62 
 
 
297 aa  248  9e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.178095  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0280  ribonuclease BN  50.19 
 
 
288 aa  245  6e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.108034 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0750  ribonuclease BN  47.12 
 
 
297 aa  241  1e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4573  ribonuclease BN  44.57 
 
 
293 aa  229  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101037  hitchhiker  0.00311377 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4509  ribonuclease BN  46.3 
 
 
293 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.581699  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4347  ribonuclease BN  44.4 
 
 
295 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2188  ribonuclease BN  42.16 
 
 
317 aa  202  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.811945  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2506  ribonuclease BN  43.12 
 
 
315 aa  195  7e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.000575853  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2230  ribonuclease BN  43.12 
 
 
315 aa  195  7e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.956243  normal  0.534293 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1180  ribonuclease BN, putative  40 
 
 
288 aa  170  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.012264  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0529  YihY family protein  27.44 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  29.17 
 
 
286 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  28.22 
 
 
289 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  28.22 
 
 
289 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  28.22 
 
 
289 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  28.22 
 
 
289 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  28.22 
 
 
289 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  28.22 
 
 
289 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  26.62 
 
 
283 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  28.28 
 
 
289 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1292  ribonuclease BN family protein  28.08 
 
 
271 aa  105  6e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0504  ribonuclease BN  26.28 
 
 
279 aa  105  8e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0979638  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  25.9 
 
 
283 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  26.81 
 
 
289 aa  102  7e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  28.08 
 
 
288 aa  102  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  28.08 
 
 
288 aa  102  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  29.56 
 
 
299 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  29.56 
 
 
299 aa  99  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  26.64 
 
 
276 aa  98.2  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  29.41 
 
 
316 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0050  ribonuclease BN  31.23 
 
 
344 aa  93.6  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  29.77 
 
 
392 aa  92.8  6e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  24.63 
 
 
277 aa  90.1  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3009  putative ribonuclease BN  29.3 
 
 
359 aa  89  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0348363  normal  0.626504 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0119  ribonuclease BN  24.74 
 
 
316 aa  85.9  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.605507 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0137  ribonuclease BN  24.33 
 
 
316 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0395  YihY family protein  25.64 
 
 
279 aa  82  0.00000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  26.32 
 
 
289 aa  80.1  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0656  ribonuclease BN  25.98 
 
 
355 aa  80.1  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.173698 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  29.21 
 
 
321 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  24.83 
 
 
319 aa  79  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  27.83 
 
 
318 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1298  ribonuclease BN  28.11 
 
 
277 aa  79  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  27.83 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  27.83 
 
 
318 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  28.71 
 
 
323 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0318  putative ribonuclease BN  34.48 
 
 
322 aa  76.3  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  25.27 
 
 
374 aa  75.9  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  27.4 
 
 
349 aa  74.7  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  27.41 
 
 
328 aa  74.3  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  25.12 
 
 
317 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  26.79 
 
 
328 aa  73.9  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  23.83 
 
 
363 aa  71.2  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  26.87 
 
 
386 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  25.91 
 
 
341 aa  68.9  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1074  hypothetical protein  21.69 
 
 
313 aa  68.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177301  normal  0.340121 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  27 
 
 
351 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  25.96 
 
 
386 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1900  putative ribonuclease BN  29.94 
 
 
322 aa  67.4  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213292  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  25.91 
 
 
328 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  26.5 
 
 
322 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4768  ribonuclease BN  24.62 
 
 
307 aa  66.6  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211591  normal  0.0891393 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3478  ribonuclease BN  25.09 
 
 
289 aa  65.1  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000152191  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  25.17 
 
 
356 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  24.44 
 
 
401 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1937  putative ribonuclease BN  31.96 
 
 
405 aa  65.1  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.666523  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1971  putative ribonuclease BN  31.96 
 
 
405 aa  65.1  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.493707  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1844  ribonuclease BN  23.13 
 
 
330 aa  65.1  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00339541 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08426  Ribonuclease BN  23.34 
 
 
307 aa  63.9  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.724596  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3229  ribonuclease BN  25.55 
 
 
338 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.436618  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3128  ribonuclease BN  25.55 
 
 
338 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4751  putative ribonuclease BN  25.71 
 
 
330 aa  63.5  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.537612  hitchhiker  0.00670616 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  22.38 
 
 
367 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3031  ribonuclease BN, putative  26.92 
 
 
338 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6692  membrane protein-like protein  29.22 
 
 
324 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.291028 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3487  putative ribonuclease BN  21.92 
 
 
307 aa  62  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  31.44 
 
 
333 aa  60.1  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1250  ribonuclease BN  24.51 
 
 
291 aa  59.7  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1095  hypothetical protein  24.16 
 
 
295 aa  59.7  0.00000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.377246 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  23.02 
 
 
318 aa  58.9  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2660  ribonuclease BN family protein  28.89 
 
 
373 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5015  ribonuclease BN  23.27 
 
 
310 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778134  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0138  putative ribonuclease BN  22.49 
 
 
371 aa  58.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.674179  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1616  ribonuclease BN  22.51 
 
 
318 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119172  normal  0.116701 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>