267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1696 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1696  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 163 aa  333  7.999999999999999e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 160 aa  87.8  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 160 aa  85.5  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 160 aa  84.7  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  29.37 
 
 		 160 aa  84.7  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 160 aa  84.7  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  29.37 
 
 		 160 aa  84.7  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  29.37 
 
 		 160 aa  84.3  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  29.37 
 
 		 160 aa  84.3  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 160 aa  84.3  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  32.04 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1309  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  29.7 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  29.7 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 142 aa  53.1  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3904  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  24.65 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  30.58 
 
 		 176 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 162 aa  52.4  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4318  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1439  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 140 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.207252  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 168 aa  51.6  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  30.39 
 
 		 168 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  25.22 
 
 		 162 aa  51.2  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1477  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 139 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1545  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 139 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00793933  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1506  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 131 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 140 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1299  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 131 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.541752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1272  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 131 aa  50.8  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.610251  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 142 aa  51.2  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1273  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 131 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1406  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 131 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  29 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  27.61 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  25.45 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1206  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 206 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 163 aa  48.5  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3781  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  22.73 
 
 		 149 aa  49.3  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1149  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.332522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0142  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 139 aa  48.5  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1112  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 140 aa  48.1  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1832  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 141 aa  47.8  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1786  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 161 aa  47.8  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 147 aa  47.8  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2713  transcriptional regulator, MarR family  32.04 
 
 		 196 aa  47.4  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  29.52 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  25.22 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  30.86 
 
 		 169 aa  47.4  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  27.72 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  22.45 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0840  regulatory protein, MarR  24.58 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3597  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2624  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000470188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4529  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000513075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  32.86 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  27.62 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0136  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  22.45 
 
 		 142 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  31.03 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0145  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753357  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1674  transcriptional regulator, MarR family  34.33 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0126  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1928  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 181 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00769589  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  30.34 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2205  transcriptional regulator, MarR family  23.53 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  26.92 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1523  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 176 aa  45.1  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.7127  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  27 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1405  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.159583  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 178 aa  45.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2193  MarR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 212 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255124  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2106  MarR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 212 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0118  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466512  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3076  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371862  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5835  transcriptional regulator, MarR family  28.92 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2205  transcriptional regulator, MarR family  29.57 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00450336  hitchhiker  0.0000000000000144268 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1561  MarR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 212 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175593  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0015  transcriptional regulator, TrmB  29 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0473427  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  23.01 
 
 		 151 aa  45.1  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2043  MarR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 212 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.756399  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0722  MarR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 212 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2780  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 139 aa  44.7  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00474606  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0456  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 137 aa  44.7  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>