More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0699 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0699  ABC transporter-related protein  100 
 
 
286 aa  591  1e-168  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.011362  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1146  ABC transporter related  34.52 
 
 
262 aa  156  4e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3704  ABC transporter-like  37.89 
 
 
260 aa  154  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1893  ATPase  36.28 
 
 
258 aa  152  5.9999999999999996e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0578772  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3409  ABC transporter related  35.08 
 
 
258 aa  152  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2707  ABC transporter related  35.08 
 
 
258 aa  152  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1039  ABC transporter related  36.28 
 
 
270 aa  152  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.418168 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1545  ABC transporter related  36.56 
 
 
252 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2774  ABC transporter-like protein protein  37.44 
 
 
261 aa  150  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7949  ABC transporter related  34.2 
 
 
252 aa  146  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.274237  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0402  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.24 
 
 
254 aa  145  1e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.869027  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3205  ABC transporter related protein  34.78 
 
 
351 aa  143  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1806  ABC transporter related  35.65 
 
 
246 aa  143  4e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.944964  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4884  ABC transporter related  36.89 
 
 
260 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0106  ABC transporter related protein  36.36 
 
 
302 aa  142  7e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.732505  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3961  ABC transporter related  35.68 
 
 
252 aa  142  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.721772  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1488  ABC transporter related protein  34.96 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3968  ABC transporter related protein  34.5 
 
 
263 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1975  ABC transporter related  35.74 
 
 
247 aa  140  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0671  ABC transporter related  34.19 
 
 
252 aa  139  7e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1974  ABC transporter related protein  32.61 
 
 
315 aa  138  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0931609  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3414  ABC transporter component  35.68 
 
 
255 aa  138  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1184  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  34.78 
 
 
293 aa  137  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00283179  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3842  ABC transporter related  34.8 
 
 
252 aa  136  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2890  ABC transporter related protein  34.35 
 
 
353 aa  136  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1981  putative branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  32.17 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.547444 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1260  ABC transporter related  31.28 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1034  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.06 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.634603  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0824  ABC transporter related  35.09 
 
 
247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0315  ABC transporter related  34.35 
 
 
246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1159  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.06 
 
 
256 aa  133  3e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.394443  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2474  ABC transporter related  32.47 
 
 
257 aa  133  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0659  ABC transporter related protein  33.76 
 
 
266 aa  133  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2748  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.74 
 
 
266 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.916728  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3005  ABC transporter related  33.74 
 
 
256 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448839  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0773  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.06 
 
 
256 aa  132  6e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.69143  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4441  ABC transporter related  34.16 
 
 
603 aa  132  6e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1406  ABC transporter related  33.77 
 
 
254 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.260319  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2237  ABC transporter related  31.74 
 
 
255 aa  132  9e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.945618  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0273  ABC transporter related  29.13 
 
 
253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197534  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1229  ABC transporter related  31.74 
 
 
367 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000210796 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43540  ABC transporter, ATP binding component  36.8 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0288454  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  30 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3819  ABC transporter related  31.56 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0171499  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  31.03 
 
 
254 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2849  ABC transporter related protein  32.62 
 
 
247 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.485647  normal  0.511604 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4896  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
265 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408295  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2551  ABC transporter-related protein  32.03 
 
 
256 aa  130  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0761  ABC transporter-related protein  32.76 
 
 
258 aa  130  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105936 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3796  ABC transporter related  32.82 
 
 
265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.477228  normal  0.17284 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3909  ABC transporter related  32.82 
 
 
265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804783  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  33.33 
 
 
257 aa  129  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  31 
 
 
256 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  33.33 
 
 
257 aa  128  9.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  33.33 
 
 
268 aa  128  9.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  31.74 
 
 
254 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5992  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  32.37 
 
 
248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2205  ABC transporter related  31.74 
 
 
310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3102  ABC transporter related protein  30.99 
 
 
256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6107  ABC transporter related  34.12 
 
 
261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.319085  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2364  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  30.34 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  32.75 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2755  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  33.05 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214976  normal  0.395353 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1502  ABC transporter related  32.17 
 
 
247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.202973  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1156  ABC transporter related  30.43 
 
 
349 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0530  ABC transporter related  31.91 
 
 
257 aa  127  3e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000384964  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0505  ABC transporter related  30.89 
 
 
265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  29.52 
 
 
258 aa  126  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3290  hypothetical protein  32.75 
 
 
252 aa  125  6e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0159101 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5693  ABC transporter related  29.44 
 
 
271 aa  125  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0103926 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0836  ABC transporter-related protein  31.17 
 
 
253 aa  125  6e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.547307  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0598  ABC transporter related  35.1 
 
 
253 aa  125  6e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2726  ABC transporter related  31.6 
 
 
258 aa  125  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  36.48 
 
 
250 aa  125  8.000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  31.6 
 
 
255 aa  125  9e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1827  ABC transporter related  34.91 
 
 
260 aa  124  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.754325  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2431  ABC transporter related protein  31.3 
 
 
252 aa  124  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103052  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  32.76 
 
 
271 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0101  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  31.72 
 
 
256 aa  124  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1114  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  33.88 
 
 
256 aa  124  1e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0032  ABC transporter related  31.54 
 
 
294 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3533  ABC transporter related  30.58 
 
 
252 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.594682  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  32.6 
 
 
254 aa  124  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3689  ABC transporter-related protein  33.19 
 
 
252 aa  124  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1583  ABC transporter related  34.5 
 
 
240 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0097  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  32.24 
 
 
302 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.232532 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4072  ABC transporter related  31.82 
 
 
261 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3015  ABC transporter related  30.87 
 
 
327 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2024  ABC transporter related  35.32 
 
 
224 aa  123  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6115  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  34.05 
 
 
247 aa  123  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.746507  normal  0.28119 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  31.88 
 
 
259 aa  123  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2394  ABC transporter related  32.35 
 
 
262 aa  123  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3715  ABC transporter related  32.19 
 
 
256 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.231207  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1518  ABC transporter related  29.65 
 
 
253 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.121559  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0107  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  30.84 
 
 
256 aa  123  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1481  ABC transporter related  29.69 
 
 
259 aa  123  5e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0365  ABC transporter related  29.07 
 
 
253 aa  122  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000174953  unclonable  0.0000000581692 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  29.6 
 
 
262 aa  122  6e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  32.61 
 
 
259 aa  122  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0111  ABC transporter related  30.99 
 
 
257 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.683249  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>