108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0829 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0829  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 351 aa  733    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0915  Radical SAM domain protein  78.06 
 
 		 351 aa  579  1e-164  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0073  Radical SAM domain protein  72.16 
 
 		 352 aa  538  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.127824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1591  hypothetical protein  57.73 
 
 		 344 aa  429  1e-119  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05035  hypothetical protein  47.7 
 
 		 351 aa  345  8e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30480  predicted protein  49.85 
 
 		 358 aa  312  5.999999999999999e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0590  radical SAM domain-containing protein  48.55 
 
 		 317 aa  311  7.999999999999999e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0750  radical SAM domain-containing protein  47.78 
 
 		 319 aa  299  4e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3861  Radical SAM domain protein  49.83 
 
 		 327 aa  299  6e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1160  hypothetical protein  48.26 
 
 		 322 aa  298  7e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2221  hypothetical protein  47.34 
 
 		 329 aa  298  7e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1069  radical SAM domain-containing protein  49.36 
 
 		 321 aa  297  2e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.872388  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1763  Radical SAM domain protein  49.03 
 
 		 319 aa  296  3e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2614  Radical SAM domain protein  46.86 
 
 		 316 aa  296  3e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3555  Radical SAM domain protein  47.99 
 
 		 337 aa  296  3e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1628  putative radical SAM superfamily protein  46.98 
 
 		 320 aa  294  1e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00346391  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0283  Radical SAM domain protein  46.31 
 
 		 364 aa  294  1e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.716398  normal  0.948397 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1925  Radical SAM domain protein  46.47 
 
 		 338 aa  290  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13125  predicted protein  49.34 
 
 		 308 aa  288  8e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.005765  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1611  radical SAM family protein  47.94 
 
 		 320 aa  288  1e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06651  Fe-S oxidoreductase  45.86 
 
 		 310 aa  286  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07041  Fe-S oxidoreductase  46.71 
 
 		 310 aa  286  4e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.156574  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0638  hypothetical protein  45.54 
 
 		 310 aa  284  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2457  radical SAM family protein  45.34 
 
 		 318 aa  281  9e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00277932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07011  Fe-S oxidoreductases  45.11 
 
 		 314 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0350076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0078  hypothetical protein  46.75 
 
 		 314 aa  277  2e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07461  Fe-S oxidoreductase  45.64 
 
 		 311 aa  276  4e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.390345  normal  0.116185 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0305  radical SAM domain-containing protein  43.71 
 
 		 314 aa  275  9e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3480  radical SAM domain-containing protein  45.14 
 
 		 318 aa  270  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06941  Fe-S oxidoreductases  45.51 
 
 		 310 aa  270  2e-71  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.426586  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13341  Fe-S oxidoreductase  43.98 
 
 		 332 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.761988 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1779  L-asparaginase II  48.39 
 
 		 317 aa  270  2.9999999999999997e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.251936  normal  0.0342174 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3751  radical SAM domain-containing protein  44.41 
 
 		 337 aa  268  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0866  L-asparaginase II  47.56 
 
 		 314 aa  267  2e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1988  radical SAM family protein  43.71 
 
 		 328 aa  256  3e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.252976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2228  Radical SAM domain protein  43.67 
 
 		 332 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.419306 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1312  radical SAM domain-containing protein  40.37 
 
 		 335 aa  250  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3799  radical SAM family protein  42.04 
 
 		 335 aa  248  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0945  hypothetical protein  42.27 
 
 		 324 aa  246  3e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1335  Radical SAM domain protein  42.77 
 
 		 337 aa  242  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1566  radical SAM domain-containing protein  41.78 
 
 		 341 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3171  Radical SAM domain protein  41.48 
 
 		 319 aa  238  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1091  Radical SAM domain protein  41.16 
 
 		 319 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4074  Radical SAM domain protein  40.62 
 
 		 329 aa  232  8.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4113  Radical SAM domain protein  40.62 
 
 		 329 aa  232  8.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00130178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1674  Radical SAM domain protein  28.36 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1685  hypothetical protein  27.52 
 
 		 314 aa  57  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0732068  normal  0.0666172 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  24.79 
 
 		 365 aa  56.2  0.0000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3378  hypothetical protein  27.93 
 
 		 595 aa  56.2  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5883  radical SAM domain-containing protein  27.4 
 
 		 332 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0414  radical SAM domain-containing protein  26.38 
 
 		 330 aa  52.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.910572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0763  radical SAM family protein  28.07 
 
 		 354 aa  52  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959991  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  28.05 
 
 		 391 aa  52  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  24.81 
 
 		 422 aa  51.6  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  34.29 
 
 		 345 aa  51.6  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1148  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.88 
 
 		 298 aa  50.4  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  22.93 
 
 		 323 aa  50.1  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  29.17 
 
 		 380 aa  49.3  0.00009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  29.85 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1175  radical SAM domain-containing protein  42.31 
 
 		 348 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.913807  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  27.34 
 
 		 800 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 		 406 aa  47.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4391  Radical SAM domain protein  30.66 
 
 		 327 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 1000 aa  47.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  26.32 
 
 		 406 aa  47.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  26.53 
 
 		 429 aa  47.8  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  27.15 
 
 		 401 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  25.25 
 
 		 333 aa  47.4  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  27.15 
 
 		 401 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  27.15 
 
 		 401 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1991  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 		 381 aa  47.4  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0387606  normal  0.206645 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4168  putative hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein  24.32 
 
 		 388 aa  47  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.159717  normal  0.0664961 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2560  radical SAM family protein  25 
 
 		 369 aa  46.6  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0538253  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0897  radical SAM family protein  21.59 
 
 		 380 aa  46.6  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  21.97 
 
 		 316 aa  46.6  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2615  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 471 aa  46.6  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  25.77 
 
 		 335 aa  45.4  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  31.43 
 
 		 330 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  25.95 
 
 		 347 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0194  radical SAM domain-containing protein  28.67 
 
 		 579 aa  45.8  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.369341  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11698  molybdopterin biosynthesis protein moeX  27.27 
 
 		 330 aa  46.2  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.509473 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5373  Radical SAM domain protein  25.85 
 
 		 327 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4899  radical SAM family protein  23.65 
 
 		 386 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.152748  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0011  Radical SAM domain protein  26.35 
 
 		 338 aa  45.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3245  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  25.87 
 
 		 382 aa  45.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.207112 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2079  MoaA/NifB/PqqE family Fe-S oxidoreductase  25.32 
 
 		 336 aa  44.3  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  25.71 
 
 		 375 aa  44.7  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4663  Radical SAM domain protein  29.33 
 
 		 381 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0193587 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  25.17 
 
 		 395 aa  43.9  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  27.52 
 
 		 396 aa  43.9  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 		 418 aa  43.9  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1614  Radical SAM domain protein  32.1 
 
 		 471 aa  43.9  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2543  radical SAM family protein  25.37 
 
 		 379 aa  43.9  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1762  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.03 
 
 		 333 aa  43.5  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.114768 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0815  MoaA/NifB/PqqE family protein  26.14 
 
 		 371 aa  43.5  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1646  radical SAM family protein  27.7 
 
 		 368 aa  43.5  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1390  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.03 
 
 		 296 aa  43.5  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.212128  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2768  molybdopterin biosynthesis, protein A  29.21 
 
 		 333 aa  43.1  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149516  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3061  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  26.67 
 
 		 326 aa  43.1  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2384  Radical SAM domain protein  38.18 
 
 		 364 aa  43.1  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>