More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2328 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  71.83 
 
 		 624 aa  926    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0302  DNA mismatch repair protein MutL  62.82 
 
 		 624 aa  818    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000565974  hitchhiker  0.00985332 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2328  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 		 629 aa  1305    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1981  DNA mismatch repair protein  67.55 
 
 		 626 aa  874    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  66.82 
 
 		 644 aa  878    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  71.22 
 
 		 626 aa  928    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0267  DNA mismatch repair protein MutL  66.03 
 
 		 622 aa  845    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000997696 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  41.18 
 
 		 608 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0014  DNA mismatch repair protein  39.24 
 
 		 610 aa  475  1e-132  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0481  DNA mismatch repair protein MutL  39.57 
 
 		 623 aa  462  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.324517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0821  DNA mismatch repair protein MutL  37.54 
 
 		 630 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000117941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3811  DNA mismatch repair protein MutL  34.78 
 
 		 629 aa  419  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07070  putative DNA mismatch repair protein  35.91 
 
 		 617 aa  409  1.0000000000000001e-112  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.748012  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1174  hypothetical protein  34.27 
 
 		 628 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0643431 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5569  DNA mismatch repair protein MutL  34.21 
 
 		 685 aa  407  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.590077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0211  DNA mismatch repair protein MutL  34.77 
 
 		 644 aa  388  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  35.36 
 
 		 606 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  34.98 
 
 		 621 aa  355  1e-96  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  35.38 
 
 		 619 aa  353  5e-96  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2145  DNA mismatch repair protein MutL  33.33 
 
 		 612 aa  352  2e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000372508  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  34.47 
 
 		 611 aa  350  4e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  32.86 
 
 		 615 aa  348  2e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  32.58 
 
 		 655 aa  348  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  32.46 
 
 		 644 aa  348  2e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  33.28 
 
 		 652 aa  347  4e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  33.28 
 
 		 625 aa  347  4e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1696  DNA mismatch repair protein MutL  32.24 
 
 		 665 aa  347  4e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930861  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  34 
 
 		 629 aa  346  6e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  33.49 
 
 		 603 aa  346  6e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  34.39 
 
 		 622 aa  346  8e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1078  DNA mismatch repair protein MutL  35.33 
 
 		 572 aa  346  8e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  34.01 
 
 		 628 aa  345  1e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  33.07 
 
 		 608 aa  345  1e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  33.74 
 
 		 623 aa  345  2e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1919  DNA mismatch repair protein MutL  32.45 
 
 		 670 aa  341  2e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.770906  hitchhiker  0.00107591 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  34.3 
 
 		 641 aa  339  9.999999999999999e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  33.59 
 
 		 602 aa  337  5e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  34.85 
 
 		 602 aa  336  7.999999999999999e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  34 
 
 		 605 aa  336  9e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  33.13 
 
 		 644 aa  335  2e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0660  DNA mismatch repair protein  32.26 
 
 		 661 aa  334  4e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  32.37 
 
 		 632 aa  333  4e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  33.9 
 
 		 633 aa  333  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  32.81 
 
 		 639 aa  333  7.000000000000001e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  32.98 
 
 		 636 aa  332  9e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3815  DNA mismatch repair protein  33.08 
 
 		 647 aa  332  9e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  31.92 
 
 		 647 aa  332  1e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  33.54 
 
 		 635 aa  332  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  32.73 
 
 		 647 aa  331  3e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  33.8 
 
 		 620 aa  331  3e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  33.87 
 
 		 586 aa  330  3e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  32.45 
 
 		 633 aa  330  3e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  32.92 
 
 		 647 aa  330  4e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  33.49 
 
 		 632 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  33.02 
 
 		 619 aa  330  5.0000000000000004e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  33.96 
 
 		 605 aa  330  7e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  30.74 
 
 		 647 aa  330  7e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1172  DNA mismatch repair protein  30.47 
 
 		 674 aa  330  7e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3527  DNA mismatch repair protein  32.77 
 
 		 647 aa  329  9e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  33.03 
 
 		 649 aa  329  9e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3780  DNA mismatch repair protein  33.08 
 
 		 647 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0217989 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1432  DNA mismatch repair protein  32.92 
 
 		 647 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.980701 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  31.86 
 
 		 626 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3509  DNA mismatch repair protein  32.92 
 
 		 647 aa  329  1.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  31.86 
 
 		 626 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  33.13 
 
 		 632 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  33.28 
 
 		 633 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  33.85 
 
 		 641 aa  328  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  31.87 
 
 		 616 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  32.14 
 
 		 633 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  34.07 
 
 		 585 aa  327  5e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  32.92 
 
 		 647 aa  327  6e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  34 
 
 		 628 aa  326  1e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  32.78 
 
 		 648 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1359  DNA mismatch repair protein  30.97 
 
 		 674 aa  325  1e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  33.33 
 
 		 645 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  31.09 
 
 		 626 aa  323  6e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0934  DNA mismatch repair protein  33.12 
 
 		 603 aa  323  7e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_002950  PG0412  DNA mismatch repair protein MutL  31.34 
 
 		 618 aa  322  9.000000000000001e-87  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  33.6 
 
 		 589 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  31.79 
 
 		 705 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  31.61 
 
 		 643 aa  321  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  30.94 
 
 		 623 aa  320  3.9999999999999996e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  30.94 
 
 		 623 aa  320  3.9999999999999996e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2096  DNA mismatch repair protein  32.98 
 
 		 630 aa  320  5e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  32.19 
 
 		 630 aa  319  7.999999999999999e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  32.25 
 
 		 630 aa  319  9e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  32.7 
 
 		 605 aa  319  9e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  32.63 
 
 		 656 aa  317  3e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  31.94 
 
 		 631 aa  317  5e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2314  DNA mismatch repair protein  30.96 
 
 		 684 aa  316  7e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1085  DNA mismatch repair protein  30.96 
 
 		 684 aa  316  7e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0514  DNA mismatch repair protein  30.96 
 
 		 684 aa  316  7e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2192  DNA mismatch repair protein  30.96 
 
 		 684 aa  316  7e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1575  DNA mismatch repair protein MutL  31.45 
 
 		 648 aa  316  7e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3297  DNA mismatch repair protein  30.96 
 
 		 684 aa  316  7e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365803  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3264  DNA mismatch repair protein  31.19 
 
 		 681 aa  316  9e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.815986  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  32.66 
 
 		 617 aa  315  9.999999999999999e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0023  DNA mismatch repair protein MutL  31.96 
 
 		 621 aa  316  9.999999999999999e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000493473  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1612  DNA mismatch repair protein  31.9 
 
 		 614 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.235254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>