More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1610 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1610  pentapeptide repeat protein  100 
 
 		 408 aa  818    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000228674  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1777  pentapeptide repeat protein  48.46 
 
 		 432 aa  365  1e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1048  pentapeptide repeat-containing protein  49.88 
 
 		 420 aa  355  7.999999999999999e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0897049  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1237  pentapeptide repeat-containing protein  46.86 
 
 		 438 aa  302  8.000000000000001e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  37.9 
 
 		 412 aa  226  7e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0951  pentapeptide repeat protein  36.09 
 
 		 393 aa  220  3e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  31.68 
 
 		 408 aa  164  3e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  34 
 
 		 447 aa  159  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  30.64 
 
 		 442 aa  159  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  29.03 
 
 		 447 aa  147  5e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  29 
 
 		 450 aa  143  4e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  31.64 
 
 		 446 aa  143  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1728  pentapeptide repeat-containing protein  32.44 
 
 		 389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.952308  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  32.02 
 
 		 449 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  29.6 
 
 		 401 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  29.02 
 
 		 401 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  29.97 
 
 		 381 aa  109  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  27.62 
 
 		 862 aa  100  6e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  33.14 
 
 		 309 aa  99.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  40.59 
 
 		 299 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  29.31 
 
 		 440 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  30.12 
 
 		 336 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  30.12 
 
 		 336 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  28.13 
 
 		 401 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  28.13 
 
 		 401 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  32.74 
 
 		 300 aa  96.7  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  30.06 
 
 		 493 aa  94.4  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  33.23 
 
 		 872 aa  94  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  29.86 
 
 		 1191 aa  94.4  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  38.76 
 
 		 225 aa  93.6  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  43.04 
 
 		 184 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  37.85 
 
 		 333 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  27.82 
 
 		 448 aa  92  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  32.48 
 
 		 332 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  32.22 
 
 		 311 aa  90.5  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  27.84 
 
 		 389 aa  90.1  7e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  40.97 
 
 		 521 aa  88.2  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  28.95 
 
 		 880 aa  89  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  28.95 
 
 		 880 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  28.95 
 
 		 880 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  28.95 
 
 		 880 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  28.36 
 
 		 880 aa  87.8  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  40.13 
 
 		 340 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  36.69 
 
 		 517 aa  87  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  28.66 
 
 		 295 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  47.41 
 
 		 277 aa  86.7  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  29.41 
 
 		 412 aa  86.3  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  29.78 
 
 		 319 aa  85.1  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  26.5 
 
 		 515 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  30 
 
 		 14916 aa  83.6  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  34.81 
 
 		 386 aa  83.6  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  31.6 
 
 		 576 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  27.93 
 
 		 846 aa  81.6  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0246  pentapeptide repeat protein  32.76 
 
 		 260 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  39.86 
 
 		 213 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  36.71 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  40 
 
 		 745 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  39.02 
 
 		 204 aa  81.3  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  37.5 
 
 		 286 aa  80.9  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  37.58 
 
 		 567 aa  80.9  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38880  hypothetical protein  37.43 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3313  hypothetical protein  37.43 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  45.45 
 
 		 381 aa  80.1  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  38.14 
 
 		 441 aa  80.1  0.00000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2635  hypothetical protein  41.26 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.224677  normal  0.134206 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  25.9 
 
 		 872 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5006  pentapeptide repeat-containing protein  48.98 
 
 		 267 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.993691  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1083  pentapeptide repeat-containing protein  19.79 
 
 		 607 aa  79.3  0.0000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.581758  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  41.78 
 
 		 343 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  41.78 
 
 		 343 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  37.25 
 
 		 268 aa  79  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  38.64 
 
 		 600 aa  79  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1482  pentapeptide repeat-containing protein  29.61 
 
 		 392 aa  79  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0501113  normal  0.460509 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  26.75 
 
 		 877 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  25.16 
 
 		 285 aa  77.8  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  42.11 
 
 		 416 aa  77.4  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0289  pentapeptide repeat protein  33.52 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  25.75 
 
 		 349 aa  77  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  40.62 
 
 		 1033 aa  77  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  30.17 
 
 		 710 aa  77  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0289  pentapeptide repeat protein  33.52 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1211  pentapeptide repeat-containing protein  28.93 
 
 		 419 aa  77  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.645913 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3456  pentapeptide repeat protein  34.55 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651627 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  37.27 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3764  pentapeptide repeat protein  30.05 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  26.18 
 
 		 351 aa  76.6  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  41.26 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  37.88 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  42.34 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1956  pentapeptide repeat-containing protein  39.16 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.342311  normal  0.646224 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3090  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  36.49 
 
 		 234 aa  75.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  37.5 
 
 		 225 aa  76.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  37.8 
 
 		 203 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  36.21 
 
 		 227 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3446  pentapeptide repeat protein  33.57 
 
 		 206 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  38.06 
 
 		 727 aa  74.7  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  41.54 
 
 		 245 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  41.94 
 
 		 234 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  27.92 
 
 		 483 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>