196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0916 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  83.85 
 
 		 453 aa  820    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  86.09 
 
 		 453 aa  832    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  81.9 
 
 		 455 aa  798    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  84.29 
 
 		 453 aa  819    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  88.05 
 
 		 453 aa  838    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  100 
 
 		 453 aa  946    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  87.17 
 
 		 453 aa  839    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  38.96 
 
 		 472 aa  345  8.999999999999999e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  39.42 
 
 		 463 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  39.13 
 
 		 464 aa  338  8e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  40.47 
 
 		 474 aa  338  9.999999999999999e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  38.91 
 
 		 462 aa  337  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  38.89 
 
 		 472 aa  336  5e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  40.09 
 
 		 475 aa  333  5e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  39.87 
 
 		 475 aa  332  8e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  38.83 
 
 		 473 aa  327  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  38.78 
 
 		 479 aa  326  5e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  39.57 
 
 		 472 aa  326  6e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  39.44 
 
 		 465 aa  325  1e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  38.69 
 
 		 472 aa  323  4e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  38.78 
 
 		 471 aa  322  8e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  37.82 
 
 		 479 aa  322  9.000000000000001e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  39.22 
 
 		 466 aa  320  3e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  37.58 
 
 		 460 aa  318  9e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  38.23 
 
 		 459 aa  318  1e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  39.01 
 
 		 466 aa  318  1e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  36.66 
 
 		 477 aa  313  5.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  36.03 
 
 		 589 aa  309  5e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  36.61 
 
 		 490 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  36.61 
 
 		 490 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  37.13 
 
 		 484 aa  300  4e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  35.37 
 
 		 489 aa  299  7e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  35.68 
 
 		 483 aa  299  9e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  36.1 
 
 		 484 aa  296  3e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  36.71 
 
 		 499 aa  296  7e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  36.31 
 
 		 599 aa  296  7e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  35.97 
 
 		 478 aa  293  4e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  37.05 
 
 		 484 aa  293  5e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1181  Carotene 7,8-desaturase  36.16 
 
 		 459 aa  293  6e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000113252  normal  0.0145788 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  35.07 
 
 		 482 aa  292  8e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  34.25 
 
 		 624 aa  291  2e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1176  Carotene 7,8-desaturase  35.66 
 
 		 462 aa  291  2e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.180076  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  34.85 
 
 		 488 aa  290  4e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  33.68 
 
 		 479 aa  289  6e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  36.29 
 
 		 486 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1512  zeta-carotene desaturase  36.38 
 
 		 481 aa  288  2e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.311968  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  34.11 
 
 		 479 aa  287  2.9999999999999996e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  35.26 
 
 		 486 aa  287  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  34.61 
 
 		 552 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  34.09 
 
 		 461 aa  281  2e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  34.44 
 
 		 488 aa  280  3e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1283  carotene 7,8-desaturase  33.41 
 
 		 462 aa  279  9e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.859886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0877  Carotene 7,8-desaturase  34.5 
 
 		 460 aa  273  5.000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0378337  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1173  zeta-carotene desaturase  34.42 
 
 		 461 aa  272  7e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000320899  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26211  zeta-carotene desaturase  34.23 
 
 		 490 aa  262  8.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53974  zeta-carotene desaturase  32.59 
 
 		 591 aa  246  4e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.246168  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  26.22 
 
 		 451 aa  149  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1747  carotene 7,8-desaturase  24.01 
 
 		 481 aa  147  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.969616 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4330  amine oxidase  26.24 
 
 		 500 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4193  squalene-associated FAD-dependent desaturase  25.22 
 
 		 447 aa  113  7.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0368  amine oxidase  24.14 
 
 		 503 aa  112  9e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3204  squalene-associated FAD-dependent desaturase  23.11 
 
 		 477 aa  111  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.55236  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3736  amine oxidase  25.11 
 
 		 520 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0307  amine oxidase  24.03 
 
 		 448 aa  108  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5505  squalene-associated FAD-dependent desaturase  23.76 
 
 		 417 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.342763  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23100  squalene-associated FAD-dependent desaturase  21.27 
 
 		 439 aa  103  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620646  normal  0.191871 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  23.36 
 
 		 452 aa  103  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  23.36 
 
 		 452 aa  103  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  23.36 
 
 		 452 aa  103  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0018  amine oxidase  23.92 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4952  amine oxidase  23.66 
 
 		 417 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15769  normal  0.0932773 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4555  squalene-associated FAD-dependent desaturase  23.33 
 
 		 417 aa  100  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.160695 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5179  amine oxidase  23.33 
 
 		 417 aa  99.8  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5680  amine oxidase  23.33 
 
 		 417 aa  99.8  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799558  hitchhiker  0.00195148 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3174  squalene-associated FAD-dependent desaturase  24.19 
 
 		 417 aa  94.7  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.724661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5080  amine oxidase  24.95 
 
 		 506 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.984429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  24.95 
 
 		 506 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4516  amine oxidase  22.81 
 
 		 432 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5459  amine oxidase  24.57 
 
 		 506 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.723961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  20.63 
 
 		 438 aa  84.7  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6348  squalene-associated FAD-dependent desaturase  23.36 
 
 		 424 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0839028  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  25.98 
 
 		 647 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  25.98 
 
 		 647 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5425  squalene-associated FAD-dependent desaturase  24.19 
 
 		 433 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2270  amine oxidase  22.86 
 
 		 417 aa  80.5  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.160101 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2440  squalene-associated FAD-dependent desaturase  21.68 
 
 		 447 aa  79.7  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  24.25 
 
 		 645 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4138  squalene-associated FAD-dependent desaturase  23.71 
 
 		 425 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2219  squalene-associated FAD-dependent desaturase  23.8 
 
 		 433 aa  76.6  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.698048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1943  squalene-associated FAD-dependent desaturase  23.8 
 
 		 433 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273475  normal  0.570646 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0117  amine oxidase  22.58 
 
 		 410 aa  76.3  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2707  amine oxidase  23.56 
 
 		 410 aa  75.1  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0288942  hitchhiker  0.00000819833 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2162  amine oxidase  22.15 
 
 		 811 aa  74.7  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.352891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  24.18 
 
 		 647 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2159  squalene-associated FAD-dependent desaturase  22.2 
 
 		 441 aa  72.4  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7145  squalene-associated FAD-dependent desaturase  23.25 
 
 		 438 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5715  amine oxidase  27.14 
 
 		 562 aa  71.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0865614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3813  amine oxidase  23.11 
 
 		 523 aa  70.5  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966571  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1844  amine oxidase  22.3 
 
 		 511 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0063  amine oxidase  23.38 
 
 		 432 aa  70.1  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>