More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3460 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3460  penicillin-binding protein transpeptidase  100 
 
 
659 aa  1263    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0389  penicillin-binding protein transpeptidase  51.45 
 
 
649 aa  494  9.999999999999999e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.998965  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3919  penicillin-binding protein transpeptidase  48.4 
 
 
662 aa  490  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4146  penicillin-binding protein, transpeptidase  47.9 
 
 
664 aa  484  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36830  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  50.39 
 
 
645 aa  485  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00463694  normal  0.702417 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3275  penicillin-binding protein transpeptidase  49.91 
 
 
661 aa  463  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4600  penicillin-binding protein, transpeptidase  50.45 
 
 
639 aa  465  1e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06090  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  41.28 
 
 
636 aa  353  4e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0475  penicillin-binding protein transpeptidase  40.96 
 
 
678 aa  291  3e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00366439  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33330  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  37.43 
 
 
625 aa  286  7e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5329  penicillin-binding protein transpeptidase  39 
 
 
619 aa  280  7e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3971  penicillin-binding protein transpeptidase  38.99 
 
 
633 aa  266  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1416  putative secreted penicillin binding protein  41.19 
 
 
689 aa  219  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.451828  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12880  penicillin-binding lipoprotein  30.82 
 
 
603 aa  208  3e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2030  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.87 
 
 
606 aa  205  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.609137  normal  0.0382075 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2093  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.2 
 
 
606 aa  200  6e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.904796  normal  0.984313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2047  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.82 
 
 
590 aa  200  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0844454  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2552  penicillin-binding protein transpeptidase  40.2 
 
 
826 aa  197  7e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.389315  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4002  NTF2 domain protein transpeptidase  33.39 
 
 
643 aa  196  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2475  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  31.48 
 
 
643 aa  190  5.999999999999999e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2266  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.8 
 
 
588 aa  189  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3641  penicillin-binding protein, transpeptidase  38.85 
 
 
563 aa  188  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1089  penicillin-binding protein transpeptidase  38.55 
 
 
608 aa  180  7e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4076  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.01 
 
 
604 aa  180  9e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311746  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5886  penicillin-binding protein transpeptidase  33.45 
 
 
599 aa  176  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1727  penicillin-binding protein transpeptidase  39.23 
 
 
540 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23852  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1441  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  38.69 
 
 
507 aa  176  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4062  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  34.68 
 
 
543 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115206  normal  0.0599617 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4955  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.03 
 
 
586 aa  171  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5043  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.03 
 
 
586 aa  171  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836546  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5336  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.03 
 
 
586 aa  171  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4630  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.66 
 
 
593 aa  169  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2190  penicillin-binding protein transpeptidase  32.36 
 
 
644 aa  164  6e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247055  hitchhiker  0.00185337 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2080  penicillin-binding protein, transpeptidase  32.35 
 
 
585 aa  164  6e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047299  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2121  penicillin-binding protein transpeptidase  30.2 
 
 
608 aa  157  7e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1690  penicillin-binding protein transpeptidase  31.49 
 
 
612 aa  149  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0748496  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3720  penicillin-binding protein transpeptidase  31.33 
 
 
689 aa  148  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290465  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3973  penicillin-binding protein transpeptidase  30.47 
 
 
580 aa  147  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129617  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7683  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  38.9 
 
 
512 aa  144  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1448  penicillin-binding protein transpeptidase  37.13 
 
 
570 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0796  NTF2 domain-containing protein transpeptidase  33.6 
 
 
630 aa  142  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144212  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6659  penicillin-binding protein transpeptidase  37.72 
 
 
417 aa  137  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal  0.727752 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1456  putative penicillin-binding protein  30.21 
 
 
627 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1307  penicillin-binding protein transpeptidase  33.91 
 
 
573 aa  130  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  26.84 
 
 
639 aa  128  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  26.93 
 
 
643 aa  125  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  26.79 
 
 
647 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  26.98 
 
 
645 aa  120  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3583  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  37.21 
 
 
531 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.227285 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  26.81 
 
 
642 aa  117  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1404  penicillin-binding protein 2  27.41 
 
 
619 aa  114  5e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  25.7 
 
 
640 aa  114  5e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  26.77 
 
 
636 aa  114  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1352  penicillin-binding protein  25.78 
 
 
617 aa  114  7.000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3845  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.67 
 
 
472 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0630  penicillin-binding protein 2  28.57 
 
 
615 aa  112  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2131  peptidoglycan glycosyltransferase  27.16 
 
 
689 aa  111  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5826  penicillin-binding protein transpeptidase  34.63 
 
 
590 aa  111  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.739783  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  25.05 
 
 
610 aa  110  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  27.96 
 
 
619 aa  110  8.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1500  peptidoglycan glycosyltransferase  26.51 
 
 
535 aa  110  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1630  peptidoglycan glycosyltransferase  26.85 
 
 
636 aa  109  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0924694  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  25.27 
 
 
646 aa  108  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  30.03 
 
 
473 aa  109  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7282  penicillin-binding protein 2  27.26 
 
 
724 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2465  penicillin-binding protein 2  26.24 
 
 
686 aa  107  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.181798 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  26.39 
 
 
640 aa  106  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0805  penicillin-binding protein 2  25.36 
 
 
648 aa  106  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0571  peptidoglycan glycosyltransferase  27.83 
 
 
634 aa  106  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.784328  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  32.12 
 
 
487 aa  103  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2090  peptidoglycan glycosyltransferase  28.19 
 
 
597 aa  103  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27584  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  26.65 
 
 
647 aa  102  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  27.45 
 
 
471 aa  102  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.38 
 
 
476 aa  102  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  32.12 
 
 
487 aa  101  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.79 
 
 
489 aa  100  6e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7279  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.62 
 
 
692 aa  100  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_002978  WD0719  penicillin-binding protein  25.77 
 
 
524 aa  100  9e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  29.56 
 
 
708 aa  100  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0016  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.54 
 
 
478 aa  99.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  28.22 
 
 
645 aa  99.8  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  32.77 
 
 
504 aa  99  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2605  penicillin-binding protein 2  27.13 
 
 
605 aa  98.6  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  26.55 
 
 
643 aa  98.6  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0514  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.92 
 
 
822 aa  98.2  5e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  26.99 
 
 
633 aa  97.8  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0079  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.61 
 
 
493 aa  97.8  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4069  stage V sporulation protein D  27.03 
 
 
682 aa  97.4  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00580  putative penicillin-binding protein 2  26.54 
 
 
622 aa  97.1  8e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4602  peptidoglycan glycosyltransferase  31.14 
 
 
660 aa  96.7  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3205  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.33 
 
 
635 aa  97.1  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0996816  normal  0.0272319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0495  peptidoglycan glycosyltransferase  29.91 
 
 
662 aa  95.9  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0682861  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1381  cell division protein  31.98 
 
 
488 aa  95.9  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2219  penicillin-binding protein 2  28.99 
 
 
600 aa  96.3  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0025  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.9 
 
 
491 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0658  peptidoglycan glycosyltransferase  31.41 
 
 
639 aa  95.5  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.83418  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1370  peptidoglycan glycosyltransferase  26.71 
 
 
808 aa  95.5  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0776138  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2084  penicillin-binding protein 3  21.94 
 
 
661 aa  94.7  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00596278  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2022  penicillin-binding protein 3  21.94 
 
 
661 aa  94.7  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00891602  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0837  stage V sporulation protein D  28.1 
 
 
711 aa  94.7  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.677302 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>