77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_10300 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_10300  transcriptional regulator, tetR family  100 
 
 		 200 aa  419  1e-116  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2498  transcriptional regulator, TetR family  50.85 
 
 		 184 aa  181  7e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0387  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 174 aa  87.4  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0672  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 193 aa  86.7  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1762  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1190  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1751  transcriptional regulator  25 
 
 		 207 aa  52.4  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000599302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3613  putative transcriptional regulator, TetR family  27.16 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  23.44 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1611  transcriptional regulator, TetR family  21.95 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 196 aa  49.3  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1711  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.418522  normal  0.678609 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1036  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478429 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2355  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.552854 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3411  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945663  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1203  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1515  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  23.7 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1475  transcriptional regulator, TetR family  32.71 
 
 		 238 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.612168  normal  0.616204 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 189 aa  46.6  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 227 aa  46.2  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 198 aa  45.8  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0110  transcriptional regulator, TetR family  24.04 
 
 		 193 aa  45.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 205 aa  46.2  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 203 aa  45.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 231 aa  45.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0927  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 195 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0910  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 195 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.843959  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00523  transcriptional regulator, TetR family protein  50 
 
 		 200 aa  45.1  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1567  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 261 aa  45.1  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.865657 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 222 aa  45.1  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 208 aa  45.1  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3101  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6844  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 195 aa  43.9  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 203 aa  43.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0917  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 226 aa  43.5  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2789  transcriptional regulator  40.62 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0595  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 218 aa  43.5  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1586  transcriptional regulator, TetR family  22.34 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66794  normal  0.155541 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 230 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4161  putative transcriptional regulator  44.9 
 
 		 202 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0941  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 239 aa  42.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3010  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 218 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5376  putative transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3673  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 230 aa  42.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10333  TetR/AcrR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 200 aa  42.4  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0807  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 204 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1771  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 204 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0658  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 232 aa  42.4  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2387  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 232 aa  42.4  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 207 aa  42.4  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3539  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 203 aa  42.4  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 208 aa  42  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 222 aa  41.6  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2967  regulatory protein, TetR  33.02 
 
 		 205 aa  41.6  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 188 aa  41.6  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0128  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 235 aa  41.6  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2994  TetR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 197 aa  41.6  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383158  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 200 aa  41.6  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4482  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 212 aa  41.6  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 218 aa  41.2  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 197 aa  41.6  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 202 aa  41.2  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 203 aa  41.6  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4916  hypothetical protein  27.91 
 
 		 221 aa  41.2  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195255  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1600  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 213 aa  41.2  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>