More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_06930 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_06930  ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 		 230 aa  459  9.999999999999999e-129  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.456804 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09930  ribulose-phosphate 3-epimerase  53.07 
 
 		 231 aa  221  7e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.556252  hitchhiker  0.0000105287 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1346  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.37 
 
 		 235 aa  211  7.999999999999999e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.895764  normal  0.645837 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.44 
 
 		 214 aa  206  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.44 
 
 		 214 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.44 
 
 		 214 aa  206  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.44 
 
 		 214 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.44 
 
 		 214 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.44 
 
 		 214 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.44 
 
 		 214 aa  205  5e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.44 
 
 		 214 aa  204  8e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.98 
 
 		 214 aa  204  9e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.44 
 
 		 221 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.44 
 
 		 214 aa  204  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.51 
 
 		 214 aa  201  9e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.12 
 
 		 218 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0731  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.8 
 
 		 224 aa  191  6e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0365158  normal  0.685056 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1716  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.78 
 
 		 218 aa  191  9e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  42.52 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0861  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.13 
 
 		 213 aa  186  3e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1028  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.78 
 
 		 215 aa  186  4e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.198537  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1989  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.73 
 
 		 217 aa  186  4e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.95 
 
 		 221 aa  185  5e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3842  Ribulose-phosphate 3-epimerase  43.89 
 
 		 224 aa  185  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0107323  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1707  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.27 
 
 		 217 aa  184  7e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3971  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  45.25 
 
 		 224 aa  182  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1537  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.99 
 
 		 222 aa  181  7e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2302  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.04 
 
 		 231 aa  181  8.000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.492163  hitchhiker  0.000182482 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  42.67 
 
 		 224 aa  180  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1223  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.78 
 
 		 218 aa  180  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.797627  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1327  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.83 
 
 		 217 aa  179  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.84 
 
 		 221 aa  179  4e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.84 
 
 		 221 aa  179  4e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1048  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.22 
 
 		 226 aa  178  7e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000483627  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5270  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.19 
 
 		 235 aa  178  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.12238 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0479  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.72 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1047  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.64 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000178019  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0074  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  41.36 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0501  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.44 
 
 		 215 aa  176  3e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0447  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.19 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423262  normal  0.174808 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0480  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.29 
 
 		 222 aa  175  4e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0249327  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2043  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.2 
 
 		 211 aa  175  5e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0491  Ribulose-phosphate 3-epimerase  41.67 
 
 		 221 aa  174  9e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1586  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.16 
 
 		 219 aa  174  9e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0803  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.18 
 
 		 221 aa  174  9.999999999999999e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3128  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.82 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2402  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  42.48 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1747  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.28 
 
 		 216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000490404  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2606  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.79 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.203389 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0287  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.36 
 
 		 232 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1855  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.19 
 
 		 224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.593821 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3927  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.29 
 
 		 228 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5433  ribulose-phosphate 3-epimerase  40 
 
 		 219 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal  0.901905 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0476  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.97 
 
 		 215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.774232  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2834  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  42.59 
 
 		 230 aa  172  5e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1488  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.97 
 
 		 215 aa  172  5.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3515  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.56 
 
 		 228 aa  171  6.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2848  Ribulose-phosphate 3-epimerase  42.59 
 
 		 220 aa  171  9e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.19951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2446  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  45.62 
 
 		 239 aa  171  9e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.87044 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3247  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.59 
 
 		 220 aa  171  9e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2786  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  45.58 
 
 		 234 aa  171  9e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2364  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.81 
 
 		 229 aa  170  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2328  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  42.92 
 
 		 228 aa  170  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.377828  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4259  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.13 
 
 		 224 aa  170  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0110433 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3229  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.33 
 
 		 235 aa  171  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1595  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.19 
 
 		 218 aa  170  2e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5220  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.73 
 
 		 216 aa  170  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0238745  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0604  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.33 
 
 		 247 aa  170  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000939667  normal  0.65152 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4082  Ribulose-phosphate 3-epimerase  45.25 
 
 		 224 aa  169  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.349999  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4115  Ribulose-phosphate 3-epimerase  45.25 
 
 		 224 aa  169  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155127  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0229  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.13 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0846712  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3723  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.13 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00616256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0067  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  41.74 
 
 		 221 aa  169  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4153  ribulose-phosphate 3-epimerase  45.1 
 
 		 222 aa  169  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0034722  normal  0.0178041 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2879  Ribulose-phosphate 3-epimerase  43 
 
 		 229 aa  169  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0175  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.11 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3962  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.13 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0524071  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0858  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.24 
 
 		 223 aa  169  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.410208  normal  0.0437061 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4675  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.86 
 
 		 235 aa  169  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0769  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.31 
 
 		 213 aa  169  4e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2582  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.4 
 
 		 230 aa  169  5e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32100  predicted protein  43.06 
 
 		 265 aa  168  5e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0416889  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4448  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.15 
 
 		 230 aa  168  6e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1857  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.84 
 
 		 241 aa  168  7e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.355475  normal  0.402345 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1619  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.73 
 
 		 234 aa  168  7e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1646  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.73 
 
 		 234 aa  168  7e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0264  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.34 
 
 		 225 aa  168  7e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.241717  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0346  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.13 
 
 		 224 aa  168  8e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1363  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  43.78 
 
 		 225 aa  168  8e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3879  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.7 
 
 		 225 aa  167  9e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3105  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.41 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.486623  normal  0.395084 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4611  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.64 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2229  ribulose-phosphate 3-epimerase  45 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.561803  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41053  predicted protein  43.12 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0213314 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1504  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.46 
 
 		 219 aa  166  2e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0207643  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4056  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.26 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00103124  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0566  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.47 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1252  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.74 
 
 		 227 aa  166  2e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.2 
 
 		 220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2726  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.47 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>