More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_05090 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_05090  predicted permease  100 
 
 		 405 aa  808    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.114877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2556  protein of unknown function UPF0118  45.55 
 
 		 429 aa  359  5e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07790  predicted permease  38.42 
 
 		 492 aa  264  2e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0456  protein of unknown function UPF0118  28.83 
 
 		 460 aa  147  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.204189  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  26.22 
 
 		 405 aa  110  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  27.06 
 
 		 354 aa  107  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  26.02 
 
 		 361 aa  104  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  25.52 
 
 		 343 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  28.84 
 
 		 345 aa  101  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  23.81 
 
 		 361 aa  101  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  27.19 
 
 		 402 aa  100  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  27.19 
 
 		 402 aa  100  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  24.32 
 
 		 361 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  24.32 
 
 		 361 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  24.32 
 
 		 361 aa  99  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  27.12 
 
 		 354 aa  99.4  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  24.32 
 
 		 348 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  24.24 
 
 		 349 aa  99.4  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  24.59 
 
 		 361 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  24.59 
 
 		 361 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  23.37 
 
 		 390 aa  96.7  6e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  24.07 
 
 		 349 aa  96.7  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  24.31 
 
 		 373 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  23.91 
 
 		 348 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  23.91 
 
 		 361 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  25.56 
 
 		 341 aa  92.8  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1556  hypothetical protein  31.35 
 
 		 407 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  24.14 
 
 		 355 aa  90.1  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  24.14 
 
 		 355 aa  90.1  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  24.14 
 
 		 355 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  24.14 
 
 		 355 aa  90.1  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  24.14 
 
 		 355 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  29.68 
 
 		 398 aa  88.6  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  23.73 
 
 		 355 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  23.73 
 
 		 355 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  23.25 
 
 		 351 aa  87  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  25.07 
 
 		 373 aa  87  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  22.52 
 
 		 371 aa  87  6e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  24.11 
 
 		 384 aa  87  6e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  26.69 
 
 		 368 aa  86.3  8e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  26.45 
 
 		 392 aa  86.3  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  26.56 
 
 		 529 aa  86.3  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  25.93 
 
 		 372 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  23.89 
 
 		 344 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  23.94 
 
 		 358 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  22.1 
 
 		 404 aa  84.3  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  27.15 
 
 		 365 aa  84.3  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  24.45 
 
 		 369 aa  84.7  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  25.92 
 
 		 417 aa  83.6  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  26.09 
 
 		 345 aa  83.6  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  24.78 
 
 		 383 aa  83.2  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  23.42 
 
 		 355 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  25.53 
 
 		 397 aa  82.8  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3424  hypothetical protein  29.54 
 
 		 403 aa  80.9  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000157289  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  24.93 
 
 		 371 aa  80.9  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2385  protein of unknown function UPF0118  26.58 
 
 		 542 aa  80.5  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3715  hypothetical protein  24.55 
 
 		 412 aa  79.7  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291378 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4850  hypothetical protein  30.9 
 
 		 394 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3920  hypothetical protein  24.9 
 
 		 434 aa  79.7  0.00000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000253725  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  23.75 
 
 		 400 aa  79.7  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2485  hypothetical protein  22.77 
 
 		 435 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.957524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  27.27 
 
 		 397 aa  78.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  24.15 
 
 		 424 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1252  hypothetical protein  28.22 
 
 		 376 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  29.34 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  29.34 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1354  hypothetical protein  23.98 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000360215  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  23.85 
 
 		 355 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2233  hypothetical protein  24.86 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6357  protein of unknown function UPF0118  28.41 
 
 		 363 aa  77  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2800  hypothetical protein  29.33 
 
 		 425 aa  76.6  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0330256  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2478  hypothetical protein  30 
 
 		 369 aa  76.6  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  20.7 
 
 		 377 aa  76.3  0.0000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8629  permease-like protein  26.28 
 
 		 423 aa  76.3  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4473  hypothetical protein  22.99 
 
 		 356 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17401  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  23.83 
 
 		 387 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  24.68 
 
 		 383 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3407  hypothetical protein  28.11 
 
 		 407 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1156  permease  25.2 
 
 		 382 aa  75.1  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0866214  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3280  sporulation integral membrane protein YtvI  24.03 
 
 		 372 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  24.24 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2392  hypothetical protein  21.74 
 
 		 349 aa  74.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3926  protein of unknown function UPF0118  22.74 
 
 		 340 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 		 389 aa  74.3  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  25.21 
 
 		 399 aa  73.9  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3009  protein of unknown function UPF0118  24.1 
 
 		 382 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  27.94 
 
 		 345 aa  73.6  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3786  protein of unknown function UPF0118  27.49 
 
 		 386 aa  73.2  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.262236  normal  0.0203414 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  26.82 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  21.26 
 
 		 368 aa  72.4  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  22.64 
 
 		 373 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  22.37 
 
 		 392 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3031  protein of unknown function UPF0118  24.77 
 
 		 377 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5642  protein of unknown function UPF0118  23.86 
 
 		 361 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.45964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  26.59 
 
 		 388 aa  72.8  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  22.92 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2026  protein of unknown function UPF0118  26.14 
 
 		 398 aa  72  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  26.39 
 
 		 426 aa  71.6  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  22.9 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  22.9 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>