More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4322 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4322  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 269 aa  541  1e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1117  short chain dehydrogenase  50.58 
 
 		 266 aa  235  4e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1820  short chain dehydrogenase  46.27 
 
 		 267 aa  217  1e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.187339 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0731  short chain dehydrogenase  42.59 
 
 		 274 aa  194  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.240935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0320  short chain dehydrogenase  41.73 
 
 		 267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.130238  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1388  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.63 
 
 		 256 aa  176  4e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0443  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 		 256 aa  171  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0262  short chain dehydrogenase  39.31 
 
 		 265 aa  168  8e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0271  short chain dehydrogenase  39.31 
 
 		 265 aa  168  8e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0281  short chain dehydrogenase  39.31 
 
 		 265 aa  168  8e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.2907  normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0267  short chain dehydrogenase  39.02 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368085 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1892  short chain dehydrogenase  48.4 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0109425  normal  0.804466 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.23 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11910  short chain dehydrogenase  39.77 
 
 		 277 aa  157  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0407  short chain dehydrogenase  37.8 
 
 		 263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37360  short chain dehydrogenase  43.93 
 
 		 252 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000340641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2738  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2782  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2768  short chain dehydrogenase  38.01 
 
 		 282 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682688  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3066  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.74 
 
 		 273 aa  139  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.172953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0417  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.13 
 
 		 262 aa  136  5e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3753  short chain dehydrogenase  39.18 
 
 		 294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1627  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  42.41 
 
 		 271 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0528  short chain dehydrogenase  37.61 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0518  short chain dehydrogenase  37.61 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.693984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0540  short chain dehydrogenase  37.61 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0506548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722445  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1745  short chain dehydrogenase  37.1 
 
 		 269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0217  short chain dehydrogenase  36.32 
 
 		 286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.743608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0690  short chain dehydrogenase  37.18 
 
 		 292 aa  125  9e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965776 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 		 281 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1244  short chain dehydrogenase  40.96 
 
 		 270 aa  124  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.542872  normal  0.404553 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1295  short chain dehydrogenase  36.84 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 		 280 aa  123  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000963224  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.19 
 
 		 295 aa  123  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 		 272 aa  123  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315563  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1337  short chain dehydrogenase  36.73 
 
 		 269 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950533 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.79 
 
 		 267 aa  122  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848764  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.41 
 
 		 246 aa  122  8e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.809389  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3796  putative short-chain dehydrogenase  33.88 
 
 		 295 aa  121  9e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3969  short chain dehydrogenase  36.29 
 
 		 269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4106  short chain dehydrogenase  36.52 
 
 		 295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.779242  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  34.29 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1844  short chain dehydrogenase  37.34 
 
 		 270 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2203  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 273 aa  119  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000419362  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.44 
 
 		 272 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21640  short chain dehydrogenase  36.93 
 
 		 270 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 		 269 aa  119  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5157  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 		 271 aa  118  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 		 280 aa  118  9e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.434492  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 		 281 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255746 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299534  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.53 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.66 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0817481  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.88 
 
 		 248 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 		 244 aa  116  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3360  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.48 
 
 		 296 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0880635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.88 
 
 		 273 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0700292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.86 
 
 		 250 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0527344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.39 
 
 		 248 aa  115  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0361624 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1346  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.56 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2524  short chain dehydrogenase  31.56 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1008  short chain dehydrogenase  31.56 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.388516  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.56 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0827865  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1269  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.56 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1472  short chain dehydrogenase  31.18 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.730562  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 		 308 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683076  hitchhiker  0.00146118 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.15 
 
 		 238 aa  113  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6766  putative short-chain dehydrogenase  34.1 
 
 		 279 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.47 
 
 		 248 aa  113  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 		 308 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.73 
 
 		 280 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3645  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 		 268 aa  113  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4692  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.41 
 
 		 274 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.169711  normal  0.0760952 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.28 
 
 		 263 aa  112  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.325129 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.16 
 
 		 273 aa  112  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1790  short chain dehydrogenase  32.45 
 
 		 307 aa  112  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000125648 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.75 
 
 		 296 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.09 
 
 		 285 aa  112  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.976299 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0558  short chain dehydrogenase  30.53 
 
 		 272 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.449424 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.84 
 
 		 261 aa  112  9e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.32 
 
 		 312 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169146  normal  0.55969 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.29 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.05 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2185  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 		 237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.756927  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2470  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3792  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.8 
 
 		 290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 		 245 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2581  short chain dehydrogenase  35.43 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.09 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02326  short chain dehydrogenase  36 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.58 
 
 		 245 aa  110  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 		 264 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02287  hypothetical protein  36 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2562  short chain dehydrogenase  35.43 
 
 		 263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2811  short chain dehydrogenase  35.43 
 
 		 263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3656  short chain dehydrogenase  35.43 
 
 		 263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2798  short chain dehydrogenase  35.43 
 
 		 263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>