More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0443 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0443  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 256 aa  518  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1388  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.67 
 
 		 256 aa  328  4e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0262  short chain dehydrogenase  41.96 
 
 		 265 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0271  short chain dehydrogenase  41.96 
 
 		 265 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0281  short chain dehydrogenase  41.96 
 
 		 265 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.2907  normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0320  short chain dehydrogenase  41.57 
 
 		 267 aa  201  8e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.130238  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.85 
 
 		 254 aa  192  7e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0267  short chain dehydrogenase  41.96 
 
 		 263 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368085 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0407  short chain dehydrogenase  41.8 
 
 		 263 aa  187  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4322  short chain dehydrogenase  41.67 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1820  short chain dehydrogenase  40.86 
 
 		 267 aa  170  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.187339 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0417  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.61 
 
 		 262 aa  169  6e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1892  short chain dehydrogenase  44.55 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0109425  normal  0.804466 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1117  short chain dehydrogenase  38.34 
 
 		 266 aa  150  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37360  short chain dehydrogenase  35.98 
 
 		 252 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000340641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0731  short chain dehydrogenase  41.67 
 
 		 274 aa  130  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.240935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2738  short chain dehydrogenase  45.36 
 
 		 282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2782  short chain dehydrogenase  45.36 
 
 		 282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2768  short chain dehydrogenase  45.36 
 
 		 282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682688  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11910  short chain dehydrogenase  34.07 
 
 		 277 aa  122  7e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  34.6 
 
 		 295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 		 295 aa  105  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 276 aa  105  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0643496  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11271  short-chain type dehydrogenase/reductase  36.36 
 
 		 276 aa  105  9e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000317139  hitchhiker  0.0033897 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 		 276 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171067  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3975  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 		 276 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3796  putative short-chain dehydrogenase  33.18 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 		 276 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848764  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.46 
 
 		 280 aa  103  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.434492  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1244  short chain dehydrogenase  35.42 
 
 		 270 aa  102  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.542872  normal  0.404553 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3360  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.86 
 
 		 296 aa  102  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0880635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3753  short chain dehydrogenase  34.04 
 
 		 294 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722445  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1790  short chain dehydrogenase  32.24 
 
 		 307 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000125648 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6766  putative short-chain dehydrogenase  35.64 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.32 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.44 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.78 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176242  normal  0.778008 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.52 
 
 		 312 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.596903 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0217  short chain dehydrogenase  30.35 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.743608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1472  short chain dehydrogenase  32.04 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.730562  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6322  putative short-chain dehydrogenase  31.6 
 
 		 252 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72840  putative short-chain dehydrogenase  31.6 
 
 		 252 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13102  short-chain type dehydrogenase/reductase  34.06 
 
 		 276 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.432292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.52 
 
 		 311 aa  99.8  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.98 
 
 		 264 aa  99.8  4e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.38 
 
 		 296 aa  99.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1144  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.21 
 
 		 307 aa  99  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151567  normal  0.117156 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33 
 
 		 296 aa  99.4  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.04 
 
 		 309 aa  99  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3693  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.04 
 
 		 309 aa  99  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.04 
 
 		 309 aa  99  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.396312  normal  0.215379 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1008  short chain dehydrogenase  31.55 
 
 		 308 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.388516  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1056  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  36.7 
 
 		 254 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1627  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  31.56 
 
 		 271 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2524  short chain dehydrogenase  31.55 
 
 		 308 aa  98.2  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1295  short chain dehydrogenase  34.92 
 
 		 271 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.55 
 
 		 308 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0827865  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3969  short chain dehydrogenase  34.92 
 
 		 269 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 		 275 aa  97.8  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.433019  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1269  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.55 
 
 		 308 aa  98.2  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 		 254 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1346  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.55 
 
 		 308 aa  98.2  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 		 253 aa  98.2  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00078495  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1745  short chain dehydrogenase  35.45 
 
 		 269 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.41 
 
 		 254 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1337  short chain dehydrogenase  34.92 
 
 		 269 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950533 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0528  short chain dehydrogenase  32.9 
 
 		 287 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.07 
 
 		 312 aa  97.4  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169146  normal  0.55969 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0540  short chain dehydrogenase  32.9 
 
 		 287 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0506548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0518  short chain dehydrogenase  32.9 
 
 		 287 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.693984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2194  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.97 
 
 		 280 aa  97.1  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0155651  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.93 
 
 		 245 aa  96.7  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  29.82 
 
 		 236 aa  95.9  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2307  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.83 
 
 		 247 aa  95.9  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 		 254 aa  95.9  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  38.2 
 
 		 276 aa  95.5  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2257  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.64 
 
 		 275 aa  95.5  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.116431  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5530  short chain dehydrogenase  35.71 
 
 		 262 aa  95.1  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3706  short chain dehydrogenase  35.71 
 
 		 262 aa  95.1  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 		 254 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0533  short chain dehydrogenase  36.41 
 
 		 257 aa  95.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3066  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.86 
 
 		 273 aa  94.7  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.172953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0690  short chain dehydrogenase  30.98 
 
 		 292 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965776 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.14 
 
 		 279 aa  95.1  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2203  short chain dehydrogenase  31.86 
 
 		 273 aa  95.1  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000419362  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.18 
 
 		 295 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13074  short chain dehydrogenase  32.6 
 
 		 287 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.486367 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4933  short chain dehydrogenase  35.44 
 
 		 262 aa  94  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.545921 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.46 
 
 		 238 aa  94.4  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.86 
 
 		 272 aa  94.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315563  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3792  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.43 
 
 		 290 aa  94  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1451  short chain dehydrogenase  35.08 
 
 		 277 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.69 
 
 		 245 aa  94.4  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6377  short chain dehydrogenase  35.08 
 
 		 277 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2186  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.02 
 
 		 241 aa  94.4  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.65 
 
 		 248 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.846295 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>