More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1388 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1388  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 256 aa  517  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0443  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.67 
 
 		 256 aa  328  4e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0262  short chain dehydrogenase  48.47 
 
 		 265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0271  short chain dehydrogenase  48.47 
 
 		 265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0281  short chain dehydrogenase  48.47 
 
 		 265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.2907  normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0407  short chain dehydrogenase  45.17 
 
 		 263 aa  204  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.26 
 
 		 254 aa  204  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0267  short chain dehydrogenase  41.92 
 
 		 263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368085 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0320  short chain dehydrogenase  41.47 
 
 		 267 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.130238  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4322  short chain dehydrogenase  41.63 
 
 		 269 aa  176  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1820  short chain dehydrogenase  40.84 
 
 		 267 aa  171  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.187339 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1117  short chain dehydrogenase  41.22 
 
 		 266 aa  165  6.9999999999999995e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0417  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 		 262 aa  161  8.000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.32 
 
 		 256 aa  149  5e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0731  short chain dehydrogenase  43.06 
 
 		 274 aa  149  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.240935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1892  short chain dehydrogenase  41.58 
 
 		 253 aa  142  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0109425  normal  0.804466 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37360  short chain dehydrogenase  37.77 
 
 		 252 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000340641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11910  short chain dehydrogenase  36.55 
 
 		 277 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2738  short chain dehydrogenase  34.8 
 
 		 282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2782  short chain dehydrogenase  34.8 
 
 		 282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2768  short chain dehydrogenase  41.62 
 
 		 282 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682688  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.32 
 
 		 295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 		 267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848764  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3792  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.89 
 
 		 290 aa  109  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1745  short chain dehydrogenase  35.14 
 
 		 269 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0736  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1295  short chain dehydrogenase  32.29 
 
 		 271 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3969  short chain dehydrogenase  34.05 
 
 		 269 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1627  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  33.69 
 
 		 271 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.91 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0160173  normal  0.32816 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  31.65 
 
 		 295 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3753  short chain dehydrogenase  33.69 
 
 		 294 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11893  short chain dehydrogenase  32.56 
 
 		 286 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.361469 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.41 
 
 		 269 aa  99  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0533  short chain dehydrogenase  36.36 
 
 		 257 aa  99  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1244  short chain dehydrogenase  33.69 
 
 		 270 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.542872  normal  0.404553 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4881  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4106  short chain dehydrogenase  30.18 
 
 		 295 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.779242  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1337  short chain dehydrogenase  32.62 
 
 		 269 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950533 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 		 280 aa  97.1  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.434492  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3561  short chain dehydrogenase  38.71 
 
 		 276 aa  97.8  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3360  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.18 
 
 		 296 aa  96.3  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0880635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1462  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.11 
 
 		 266 aa  96.3  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2306  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.45 
 
 		 273 aa  95.9  6e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000218098  normal  0.0212741 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1510  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.33 
 
 		 258 aa  95.5  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.623129  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.06 
 
 		 245 aa  95.5  8e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1012  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 251 aa  94.7  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198691  normal  0.370278 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2306  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.59 
 
 		 286 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.930868  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.74 
 
 		 296 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 		 251 aa  94.7  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.27 
 
 		 250 aa  94.4  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0527344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.78 
 
 		 250 aa  93.6  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 		 253 aa  93.6  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161371  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 276 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171067  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 276 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.97 
 
 		 240 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0400117  normal  0.51074 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3975  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 276 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.41 
 
 		 266 aa  93.6  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0101  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.41 
 
 		 272 aa  92.8  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2242  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.86 
 
 		 243 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.218659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.69 
 
 		 264 aa  93.2  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21640  short chain dehydrogenase  33.69 
 
 		 270 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3796  putative short-chain dehydrogenase  29.88 
 
 		 295 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4933  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 262 aa  92.8  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.545921 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.97 
 
 		 240 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0217  short chain dehydrogenase  31.37 
 
 		 286 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.743608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.63 
 
 		 256 aa  92.8  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.97 
 
 		 240 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1844  short chain dehydrogenase  33.69 
 
 		 270 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 		 257 aa  92  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3706  short chain dehydrogenase  33.86 
 
 		 262 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0524  short chain dehydrogenase  34.9 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.38 
 
 		 272 aa  91.3  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 		 264 aa  91.3  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5530  short chain dehydrogenase  33.86 
 
 		 262 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.6 
 
 		 286 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  32.41 
 
 		 255 aa  90.9  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3804  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 		 253 aa  90.9  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3817  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 		 252 aa  90.9  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2226  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 		 261 aa  90.9  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121072  hitchhiker  0.00000459382 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0690  short chain dehydrogenase  32.11 
 
 		 292 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965776 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4559  short chain dehydrogenase  32.8 
 
 		 262 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.65 
 
 		 281 aa  90.9  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299534  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3720  short chain dehydrogenase  32.8 
 
 		 262 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0906259  normal  0.2081 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3804  short chain dehydrogenase  32.8 
 
 		 262 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.101152 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 		 270 aa  90.1  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2513  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1056  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  33.33 
 
 		 254 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 		 251 aa  90.5  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  28.5 
 
 		 236 aa  90.5  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 		 248 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.767749  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.53 
 
 		 276 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.05 
 
 		 275 aa  90.5  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0498761  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0698  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  32.73 
 
 		 259 aa  90.1  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00117968  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0246  short chain dehydrogenase  33.51 
 
 		 265 aa  89.7  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0283  short chain dehydrogenase  33.51 
 
 		 259 aa  89.7  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.879782  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.94 
 
 		 246 aa  89.7  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3364  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.16 
 
 		 239 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  hitchhiker  0.00000000000000894376 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2511  short chain dehydrogenase  33.51 
 
 		 267 aa  89.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2649  short chain dehydrogenase  33.51 
 
 		 259 aa  89.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>