More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0262 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0262  short chain dehydrogenase  100 
 
 
265 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0271  short chain dehydrogenase  100 
 
 
265 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0281  short chain dehydrogenase  100 
 
 
265 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.2907  normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0407  short chain dehydrogenase  70.88 
 
 
263 aa  372  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0267  short chain dehydrogenase  68.2 
 
 
263 aa  362  4e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.368085 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1388  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.47 
 
 
256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0320  short chain dehydrogenase  45.77 
 
 
267 aa  226  3e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.130238  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0417  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.18 
 
 
262 aa  206  4e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0443  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.96 
 
 
256 aa  206  4e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1892  short chain dehydrogenase  41.92 
 
 
253 aa  178  9e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0109425  normal  0.804466 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37360  short chain dehydrogenase  42.39 
 
 
252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000340641  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4322  short chain dehydrogenase  39.31 
 
 
269 aa  168  7e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1820  short chain dehydrogenase  40.15 
 
 
267 aa  167  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.187339 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.78 
 
 
254 aa  167  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
256 aa  167  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0731  short chain dehydrogenase  42.25 
 
 
274 aa  146  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.240935  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1117  short chain dehydrogenase  36.12 
 
 
266 aa  140  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2768  short chain dehydrogenase  41.18 
 
 
282 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682688  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2738  short chain dehydrogenase  41.18 
 
 
282 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2782  short chain dehydrogenase  41.18 
 
 
282 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11910  short chain dehydrogenase  40 
 
 
277 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1995  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.16 
 
 
239 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.591310000000001e-44 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2065  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.16 
 
 
239 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000861938  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1964  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.16 
 
 
239 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130885  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3364  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.16 
 
 
239 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  hitchhiker  0.00000000000000894376 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2044  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.16 
 
 
242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1819  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.16 
 
 
242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1793  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.16 
 
 
242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.512815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1775  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.16 
 
 
242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1958  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.16 
 
 
242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1826  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.7 
 
 
239 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1494  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.7 
 
 
239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128809  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.8 
 
 
273 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000963224  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.13 
 
 
246 aa  108  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1462  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.88 
 
 
266 aa  106  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.6 
 
 
246 aa  106  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.08 
 
 
280 aa  106  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.434492  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 
281 aa  105  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.255746 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3753  short chain dehydrogenase  30.94 
 
 
294 aa  105  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 
275 aa  105  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0498761  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.51 
 
 
251 aa  105  9e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2986  short chain dehydrogenase  32.32 
 
 
441 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.889744  normal  0.40482 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
244 aa  104  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 
252 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.27 
 
 
295 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5037  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.22 
 
 
238 aa  103  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6766  putative short-chain dehydrogenase  31.23 
 
 
279 aa  102  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1295  short chain dehydrogenase  31.7 
 
 
271 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657463  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2427  short chain dehydrogenase  31.56 
 
 
442 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.15313  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3969  short chain dehydrogenase  30.32 
 
 
269 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1337  short chain dehydrogenase  30.59 
 
 
269 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.950533 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0149  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.77 
 
 
326 aa  102  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1244  short chain dehydrogenase  31.22 
 
 
270 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.542872  normal  0.404553 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.69 
 
 
250 aa  101  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.991261  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.03 
 
 
246 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3907  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.77 
 
 
246 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.267776 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.03 
 
 
246 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 
273 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00031135 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 
260 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4106  short chain dehydrogenase  31.56 
 
 
295 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.779242  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0250  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.19 
 
 
240 aa  100  2e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.183431  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.84 
 
 
281 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6830  oxidoreductase  33.51 
 
 
265 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1745  short chain dehydrogenase  29.86 
 
 
269 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.64 
 
 
286 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3972  short chain dehydrogenase  34.41 
 
 
441 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 
245 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.67 
 
 
245 aa  99.4  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3804  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.04 
 
 
253 aa  99.8  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.9 
 
 
245 aa  99.8  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2306  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.18 
 
 
286 aa  99.4  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.930868  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1627  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  31.86 
 
 
271 aa  99  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.73 
 
 
286 aa  99  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4692  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 
274 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.169711  normal  0.0760952 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
246 aa  98.2  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0163129  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1698  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 
298 aa  98.2  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1603  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.32 
 
 
277 aa  98.6  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2604  short chain dehydrogenase  34.41 
 
 
441 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.85 
 
 
300 aa  98.2  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.680577 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0588  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 
247 aa  97.4  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.622721  normal  0.233653 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0355  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
263 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000760103 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 
275 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0241632 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33 
 
 
277 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.92 
 
 
255 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0755029  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.38 
 
 
248 aa  97.4  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.69 
 
 
263 aa  97.1  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.325129 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 
300 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.514987 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3057  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.18 
 
 
246 aa  96.7  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.030998  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3772  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.09 
 
 
246 aa  97.1  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00117266  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  28.16 
 
 
295 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.18 
 
 
265 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.893825  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21640  short chain dehydrogenase  31.53 
 
 
270 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 
267 aa  96.7  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.18 
 
 
265 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.407118 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0283  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.18 
 
 
265 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4697  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 
300 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 
300 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 
238 aa  95.9  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6118  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 
275 aa  95.9  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  0.200034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>