More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3650 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 256 aa  535  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1892  short chain dehydrogenase  51.57 
 
 		 253 aa  253  3e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0109425  normal  0.804466 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37360  short chain dehydrogenase  43.33 
 
 		 252 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000340641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0320  short chain dehydrogenase  40.7 
 
 		 267 aa  191  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.130238  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0267  short chain dehydrogenase  41.2 
 
 		 263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368085 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0407  short chain dehydrogenase  41.76 
 
 		 263 aa  177  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0271  short chain dehydrogenase  38.46 
 
 		 265 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0281  short chain dehydrogenase  38.46 
 
 		 265 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.2907  normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0262  short chain dehydrogenase  38.46 
 
 		 265 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.77 
 
 		 254 aa  163  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4322  short chain dehydrogenase  43.23 
 
 		 269 aa  157  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0443  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2768  short chain dehydrogenase  42.41 
 
 		 282 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682688  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2738  short chain dehydrogenase  42.41 
 
 		 282 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2782  short chain dehydrogenase  42.41 
 
 		 282 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0417  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1820  short chain dehydrogenase  36.82 
 
 		 267 aa  149  3e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.187339 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1388  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.32 
 
 		 256 aa  149  5e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1117  short chain dehydrogenase  40.41 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11910  short chain dehydrogenase  36.16 
 
 		 277 aa  142  6e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0731  short chain dehydrogenase  40.96 
 
 		 274 aa  139  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.240935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0528  short chain dehydrogenase  31.91 
 
 		 287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0540  short chain dehydrogenase  31.91 
 
 		 287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0506548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0518  short chain dehydrogenase  31.91 
 
 		 287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.693984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1905  short chain dehydrogenase  36.18 
 
 		 280 aa  119  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0945301  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0736  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.15 
 
 		 272 aa  120  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2582  short chain dehydrogenase  35.32 
 
 		 291 aa  119  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0166341  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0217  short chain dehydrogenase  32.89 
 
 		 286 aa  119  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.743608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0690  short chain dehydrogenase  31.13 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965776 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2778  short chain dehydrogenase  33.83 
 
 		 281 aa  116  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2783  short chain dehydrogenase  33.83 
 
 		 291 aa  116  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0502462 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5810  short chain dehydrogenase  35.29 
 
 		 278 aa  116  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2506  short chain dehydrogenase  34.83 
 
 		 291 aa  116  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2590  short chain dehydrogenase  33.83 
 
 		 291 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2541  short chain dehydrogenase  34.83 
 
 		 291 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000142979  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2507  short chain dehydrogenase  33.83 
 
 		 291 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2827  short chain dehydrogenase  34.48 
 
 		 291 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2806  short chain dehydrogenase  34.5 
 
 		 291 aa  113  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.928497  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.59 
 
 		 266 aa  112  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.665507 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2787  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 291 aa  112  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0101  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.47 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.31 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100219 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.5 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 		 251 aa  110  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 		 300 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 		 267 aa  109  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3972  short chain dehydrogenase  31.54 
 
 		 441 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.66 
 
 		 267 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848764  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.66 
 
 		 266 aa  108  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2986  short chain dehydrogenase  32.57 
 
 		 441 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.889744  normal  0.40482 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3107  short-chain alcohol-related dehydrogenase  34.2 
 
 		 272 aa  107  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1244  short chain dehydrogenase  32.5 
 
 		 270 aa  107  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.542872  normal  0.404553 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1494  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.93 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128809  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6867  short chain dehydrogenase  31.25 
 
 		 333 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3561  short chain dehydrogenase  33.78 
 
 		 276 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.43 
 
 		 285 aa  106  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.300574 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0256  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.38 
 
 		 239 aa  106  4e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 		 327 aa  106  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2604  short chain dehydrogenase  32.58 
 
 		 441 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  33.68 
 
 		 295 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8214  short chain dehydrogenase  39.43 
 
 		 248 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 		 256 aa  106  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5897  short chain dehydrogenase  31.23 
 
 		 328 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1462  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.34 
 
 		 266 aa  106  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10768  putative oxidoreductase  30.41 
 
 		 304 aa  105  6e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.465871  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 		 282 aa  105  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.556145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.57 
 
 		 306 aa  105  7e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1352  oxidoreductase  32.99 
 
 		 275 aa  105  9e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.904457  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2427  short chain dehydrogenase  30 
 
 		 442 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.15313  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1337  short chain dehydrogenase  32.17 
 
 		 269 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950533 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3209  short chain dehydrogenase  34.76 
 
 		 268 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.821388  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2044  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.48 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4067  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  33.69 
 
 		 298 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.122191  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1819  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.48 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1793  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.48 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.512815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1775  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.48 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1298  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  33.83 
 
 		 249 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145366  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1958  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.48 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1964  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.48 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130885  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1826  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.48 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2065  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.48 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000861938  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5037  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.59 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6416  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.16 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3364  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.48 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  hitchhiker  0.00000000000000894376 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1995  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.48 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.591310000000001e-44 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2203  short chain dehydrogenase  33.76 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000419362  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000406118  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1627  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  32 
 
 		 271 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3796  putative short-chain dehydrogenase  33.68 
 
 		 295 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 317 aa  102  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 		 265 aa  102  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7095  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.53 
 
 		 252 aa  102  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0040  short chain dehydrogenase  31.55 
 
 		 283 aa  102  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1733  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 286 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 		 275 aa  102  7e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1561  short chain dehydrogenase  34.87 
 
 		 516 aa  102  7e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.636243  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 		 280 aa  102  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>