More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2768 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_2768  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 282 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682688  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2738  short chain dehydrogenase  98.15 
 
 		 282 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2782  short chain dehydrogenase  98.15 
 
 		 282 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11910  short chain dehydrogenase  76.38 
 
 		 277 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0731  short chain dehydrogenase  51.12 
 
 		 274 aa  247  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.240935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1820  short chain dehydrogenase  42.86 
 
 		 267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.187339 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1892  short chain dehydrogenase  46.15 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0109425  normal  0.804466 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0267  short chain dehydrogenase  41.15 
 
 		 263 aa  161  9e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368085 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4322  short chain dehydrogenase  37.77 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.41 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1117  short chain dehydrogenase  37.83 
 
 		 266 aa  155  7e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0407  short chain dehydrogenase  44.04 
 
 		 263 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37360  short chain dehydrogenase  39.27 
 
 		 252 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000340641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0262  short chain dehydrogenase  41.58 
 
 		 265 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0271  short chain dehydrogenase  41.58 
 
 		 265 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0281  short chain dehydrogenase  41.58 
 
 		 265 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.2907  normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.29 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0320  short chain dehydrogenase  35.66 
 
 		 267 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.130238  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0443  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.36 
 
 		 256 aa  137  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3972  short chain dehydrogenase  38.16 
 
 		 441 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1388  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.14 
 
 		 256 aa  126  5e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8214  short chain dehydrogenase  40.22 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2986  short chain dehydrogenase  34.6 
 
 		 441 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.889744  normal  0.40482 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2604  short chain dehydrogenase  37.2 
 
 		 441 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2427  short chain dehydrogenase  37.44 
 
 		 442 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.15313  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.42 
 
 		 327 aa  116  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1244  short chain dehydrogenase  33.85 
 
 		 270 aa  112  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.542872  normal  0.404553 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 		 275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.433019  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.98 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0417  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1844  short chain dehydrogenase  34.85 
 
 		 270 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 		 252 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4222  putative Levodione reductase  38.66 
 
 		 257 aa  106  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0149  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.85 
 
 		 326 aa  106  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.41 
 
 		 265 aa  106  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37 
 
 		 275 aa  105  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286455  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21640  short chain dehydrogenase  34.44 
 
 		 270 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 272 aa  105  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.743458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 		 271 aa  104  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3645  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.7 
 
 		 268 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1745  short chain dehydrogenase  34.9 
 
 		 269 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.96 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.46 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.843425  normal  0.851299 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.16 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.434492  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5897  short chain dehydrogenase  33.5 
 
 		 328 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.64 
 
 		 276 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1295  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 		 271 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3969  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 		 269 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.97 
 
 		 267 aa  102  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.82 
 
 		 336 aa  102  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.945072  normal  0.131603 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.67 
 
 		 268 aa  102  9e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1627  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  34.05 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1337  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950533 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.17 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0498761  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4835  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.49 
 
 		 273 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000227026 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.96 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6867  short chain dehydrogenase  31.36 
 
 		 333 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  36.32 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.91 
 
 		 336 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.44 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0827865  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1346  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.94 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2524  short chain dehydrogenase  35.94 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1269  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.94 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.56 
 
 		 336 aa  100  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1008  short chain dehydrogenase  35.94 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.388516  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.58 
 
 		 259 aa  100  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.17 
 
 		 257 aa  99.8  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 		 281 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255746 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3753  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 294 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0313  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.08 
 
 		 239 aa  99.4  6e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00087118  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.15 
 
 		 268 aa  99.4  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.710903  normal  0.301955 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.83 
 
 		 242 aa  99.4  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.967418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  34.8 
 
 		 295 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.31 
 
 		 272 aa  98.6  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 		 332 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.12 
 
 		 251 aa  98.6  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00700482  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.56 
 
 		 295 aa  98.6  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.42 
 
 		 306 aa  98.2  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6830  oxidoreductase  34.05 
 
 		 265 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.57 
 
 		 263 aa  98.6  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.325129 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.5 
 
 		 248 aa  98.2  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4320  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.07 
 
 		 266 aa  98.6  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146439  normal  0.0308076 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.26 
 
 		 296 aa  98.2  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1462  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.57 
 
 		 266 aa  98.2  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.05 
 
 		 280 aa  98.2  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000963224  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.61 
 
 		 328 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 		 281 aa  97.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243534  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3772  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 		 246 aa  97.4  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00117266  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.26 
 
 		 280 aa  97.8  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0560563  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1144  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.26 
 
 		 307 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151567  normal  0.117156 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00620  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  35.56 
 
 		 260 aa  97.1  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.297652  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.96 
 
 		 247 aa  97.1  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6964  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.15 
 
 		 259 aa  96.7  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.175664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.17 
 
 		 300 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514987 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.79 
 
 		 309 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.13 
 
 		 257 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.79 
 
 		 309 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.396312  normal  0.215379 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3693  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.79 
 
 		 309 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>