More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3770 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 254 aa  502  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0320  short chain dehydrogenase  48.64 
 
 		 267 aa  218  6e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.130238  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1388  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.26 
 
 		 256 aa  215  5e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0443  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.85 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0267  short chain dehydrogenase  45.22 
 
 		 263 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368085 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1892  short chain dehydrogenase  47.69 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0109425  normal  0.804466 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0407  short chain dehydrogenase  46.01 
 
 		 263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0271  short chain dehydrogenase  40.15 
 
 		 265 aa  175  5e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0262  short chain dehydrogenase  40.15 
 
 		 265 aa  175  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0281  short chain dehydrogenase  40.15 
 
 		 265 aa  175  5e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.2907  normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.77 
 
 		 256 aa  172  5e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37360  short chain dehydrogenase  43.53 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000340641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4322  short chain dehydrogenase  41.43 
 
 		 269 aa  162  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0417  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 		 262 aa  156  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2768  short chain dehydrogenase  47.54 
 
 		 282 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682688  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2738  short chain dehydrogenase  47.54 
 
 		 282 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2782  short chain dehydrogenase  47.54 
 
 		 282 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1820  short chain dehydrogenase  43.11 
 
 		 267 aa  145  6e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.187339 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1117  short chain dehydrogenase  42.47 
 
 		 266 aa  142  5e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11910  short chain dehydrogenase  36.86 
 
 		 277 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0731  short chain dehydrogenase  38.32 
 
 		 274 aa  126  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.240935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 		 267 aa  122  8e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848764  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.79 
 
 		 280 aa  116  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.434492  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.08 
 
 		 295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1244  short chain dehydrogenase  36.56 
 
 		 270 aa  112  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.542872  normal  0.404553 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1295  short chain dehydrogenase  37.23 
 
 		 271 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1337  short chain dehydrogenase  37.97 
 
 		 269 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950533 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1745  short chain dehydrogenase  37.23 
 
 		 269 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3969  short chain dehydrogenase  37.23 
 
 		 269 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1627  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  34.41 
 
 		 271 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21640  short chain dehydrogenase  36.56 
 
 		 270 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3792  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.73 
 
 		 290 aa  107  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3753  short chain dehydrogenase  33.05 
 
 		 294 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.75 
 
 		 280 aa  106  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000963224  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1844  short chain dehydrogenase  36.56 
 
 		 270 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1494  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.24 
 
 		 239 aa  105  7e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128809  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 		 251 aa  105  7e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2044  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.73 
 
 		 242 aa  105  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1964  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.73 
 
 		 239 aa  105  9e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130885  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1819  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.73 
 
 		 242 aa  105  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1793  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.73 
 
 		 242 aa  105  9e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.512815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1775  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.73 
 
 		 242 aa  105  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2065  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.73 
 
 		 239 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000861938  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1958  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.73 
 
 		 242 aa  105  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1995  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.73 
 
 		 239 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.591310000000001e-44 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3364  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.73 
 
 		 239 aa  105  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  hitchhiker  0.00000000000000894376 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3706  short chain dehydrogenase  38.92 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5530  short chain dehydrogenase  38.92 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1826  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.22 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1201  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 		 289 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0690  short chain dehydrogenase  36.53 
 
 		 292 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965776 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2203  short chain dehydrogenase  33.76 
 
 		 273 aa  103  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000419362  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4106  short chain dehydrogenase  33.87 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.779242  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.25 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.84 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1255  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.63 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.97 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4933  short chain dehydrogenase  40.32 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.545921 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2292  short chain dehydrogenase  39.46 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.295109 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6846  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.24 
 
 		 289 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0217  short chain dehydrogenase  35.75 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.743608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.92 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3720  short chain dehydrogenase  39.46 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0906259  normal  0.2081 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2226  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.41 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121072  hitchhiker  0.00000459382 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 		 245 aa  100  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4559  short chain dehydrogenase  39.46 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3804  short chain dehydrogenase  39.46 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.101152 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.67 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1462  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 		 266 aa  99.8  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6322  putative short-chain dehydrogenase  35.2 
 
 		 252 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.86 
 
 		 257 aa  99.4  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2906  sorbitol dehydrogenase  36.52 
 
 		 255 aa  99.4  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.205438 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72840  putative short-chain dehydrogenase  35.2 
 
 		 252 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3781  sorbitol dehydrogenase  36.87 
 
 		 257 aa  99  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.360615  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.91 
 
 		 272 aa  98.6  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3953  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 		 292 aa  97.8  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0620  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.07 
 
 		 250 aa  97.8  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.890979 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1193  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.84 
 
 		 252 aa  97.1  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 252 aa  97.4  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100065 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.52 
 
 		 251 aa  97.4  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4881  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 		 263 aa  96.7  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0664  cylG protein  31.94 
 
 		 240 aa  97.1  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 245 aa  96.7  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1055  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 		 258 aa  96.7  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0528  short chain dehydrogenase  33.92 
 
 		 287 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0518  short chain dehydrogenase  33.92 
 
 		 287 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.693984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4841  sorbitol dehydrogenase  34.64 
 
 		 256 aa  96.7  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0540  short chain dehydrogenase  33.92 
 
 		 287 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0506548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.63 
 
 		 266 aa  96.3  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0838  acetoin reductase  37.63 
 
 		 259 aa  96.3  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.37801  normal  0.387931 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.54 
 
 		 248 aa  96.3  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 		 327 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.52 
 
 		 247 aa  95.9  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.807678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 		 256 aa  96.3  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0964408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000395  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  36.67 
 
 		 252 aa  95.9  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.36672  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.89 
 
 		 268 aa  95.9  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.89 
 
 		 257 aa  95.5  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000680094  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1018  short chain dehydrogenase  37.56 
 
 		 298 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.176999  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2898  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 		 274 aa  95.9  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.40522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.54 
 
 		 249 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.519285 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>