More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6846 on replicon NC_008545
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008545  Bcen2424_6846  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 289 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1201  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  96.19 
 
 		 289 aa  560  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6452  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.45 
 
 		 275 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.09 
 
 		 275 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38260  short-chain alcohol dehydrogenase  43.82 
 
 		 305 aa  190  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3164  short chain dehydrogenase  42.92 
 
 		 291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3152  short chain dehydrogenase  42.92 
 
 		 294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0242299  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3214  short chain dehydrogenase  42.92 
 
 		 294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.592331  normal  0.549818 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0088  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 315 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152071 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12160  short chain dehydrogenase  41.1 
 
 		 293 aa  158  8e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.223019  normal  0.712287 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.13 
 
 		 309 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3953  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.42 
 
 		 292 aa  143  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5417  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.65 
 
 		 306 aa  139  7e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1700  short chain dehydrogenase  35.98 
 
 		 301 aa  135  5e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354354  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3477  short chain dehydrogenase  41.1 
 
 		 292 aa  135  9e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.382288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.12 
 
 		 306 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3050  short chain dehydrogenase  46.07 
 
 		 295 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0325921  normal  0.678519 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3121  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.42 
 
 		 284 aa  125  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5212  short chain dehydrogenase  35.56 
 
 		 348 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5592  short chain dehydrogenase  35.56 
 
 		 348 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.23191 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5300  short chain dehydrogenase  35.56 
 
 		 348 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.18 
 
 		 301 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.207826 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 		 253 aa  110  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0267314 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.72 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.434492  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4481  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  29.1 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.643643  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.68 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000963224  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.81 
 
 		 257 aa  106  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108701 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1244  short chain dehydrogenase  36.41 
 
 		 270 aa  106  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.542872  normal  0.404553 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5037  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.85 
 
 		 238 aa  106  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12680  short chain dehydrogenase  30.53 
 
 		 278 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.35 
 
 		 245 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 		 263 aa  105  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2637  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.97 
 
 		 249 aa  105  8e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3818  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  31.77 
 
 		 245 aa  105  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0470155 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0249  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.23 
 
 		 258 aa  105  9e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0279472  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1745  short chain dehydrogenase  33.68 
 
 		 269 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3735  short chain dehydrogenase  30.04 
 
 		 281 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4667  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.91 
 
 		 234 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3095  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.45 
 
 		 246 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.025547 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0950  short chain dehydrogenase  34.45 
 
 		 256 aa  104  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.477872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3420  short chain dehydrogenase  34.45 
 
 		 256 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0769277  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3287  short chain dehydrogenase  34.45 
 
 		 256 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.04 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.644121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1757  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.06 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1738  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.06 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1804  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.06 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.390803 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1295  short chain dehydrogenase  33.82 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3969  short chain dehydrogenase  33.68 
 
 		 269 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1337  short chain dehydrogenase  33.5 
 
 		 269 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950533 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 		 253 aa  102  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2681  short chain dehydrogenase  32.65 
 
 		 263 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2811  short chain dehydrogenase  32.65 
 
 		 263 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2590  short chain dehydrogenase  32.65 
 
 		 263 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2639  short chain dehydrogenase  32.65 
 
 		 263 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2705  short chain dehydrogenase  32.65 
 
 		 263 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.856225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.74 
 
 		 253 aa  102  8e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0213931 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.51 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.269971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.43 
 
 		 285 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3753  short chain dehydrogenase  34.9 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.6 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0572934  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.17 
 
 		 267 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.958829  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2737  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.09 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1975  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.54 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.636697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1844  short chain dehydrogenase  35.87 
 
 		 270 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1051  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.51 
 
 		 245 aa  100  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305162  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0895  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.83 
 
 		 245 aa  100  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0373369 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.1 
 
 		 236 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.68 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1627  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  34.38 
 
 		 271 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1215  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.29 
 
 		 245 aa  99.8  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.765065 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6404  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.03 
 
 		 246 aa  99.8  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4106  short chain dehydrogenase  33.88 
 
 		 295 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.779242  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 		 267 aa  99.8  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848764  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 245 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.880926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.91 
 
 		 266 aa  99.4  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.871012  hitchhiker  0.000000000383418 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33 
 
 		 246 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.874316 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5218  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.63 
 
 		 236 aa  99.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.901767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1494  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 		 239 aa  99.4  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128809  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.67 
 
 		 254 aa  99.4  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 		 244 aa  99  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 		 244 aa  99  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365065 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1995  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.64 
 
 		 239 aa  99  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.591310000000001e-44 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1964  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.64 
 
 		 239 aa  99  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130885  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2065  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.64 
 
 		 239 aa  99  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000861938  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 		 238 aa  99  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3364  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.64 
 
 		 239 aa  99  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  hitchhiker  0.00000000000000894376 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.65 
 
 		 248 aa  99  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.172179  normal  0.840489 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2044  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.64 
 
 		 242 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1819  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.64 
 
 		 242 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1793  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.64 
 
 		 242 aa  98.6  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.512815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1775  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.64 
 
 		 242 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1958  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.64 
 
 		 242 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.37 
 
 		 252 aa  98.2  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1462  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 		 266 aa  98.2  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.46 
 
 		 250 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.109628  normal  0.14985 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21640  short chain dehydrogenase  34.78 
 
 		 270 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>