More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1201 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1201  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 289 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6846  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  96.19 
 
 		 289 aa  560  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6452  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.82 
 
 		 275 aa  314  9e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.45 
 
 		 275 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38260  short-chain alcohol dehydrogenase  44.22 
 
 		 305 aa  196  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0088  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 315 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152071 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3164  short chain dehydrogenase  43.35 
 
 		 291 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3152  short chain dehydrogenase  43.35 
 
 		 294 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0242299  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3214  short chain dehydrogenase  43.35 
 
 		 294 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.592331  normal  0.549818 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12160  short chain dehydrogenase  41.53 
 
 		 293 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.223019  normal  0.712287 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3953  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.83 
 
 		 292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.62 
 
 		 309 aa  146  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1700  short chain dehydrogenase  36.3 
 
 		 301 aa  143  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354354  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5417  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.6 
 
 		 306 aa  142  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3477  short chain dehydrogenase  41.95 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.382288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.5 
 
 		 306 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3050  short chain dehydrogenase  47.12 
 
 		 295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0325921  normal  0.678519 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3121  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.17 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5592  short chain dehydrogenase  35.56 
 
 		 348 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.23191 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5212  short chain dehydrogenase  35.56 
 
 		 348 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5300  short chain dehydrogenase  35.56 
 
 		 348 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.82 
 
 		 301 aa  118  9e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.4 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0267314 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 		 262 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.207826 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 		 285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2637  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.93 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1244  short chain dehydrogenase  36.96 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.542872  normal  0.404553 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.48 
 
 		 244 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.48 
 
 		 244 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365065 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.68 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000963224  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12680  short chain dehydrogenase  30.92 
 
 		 278 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5037  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.36 
 
 		 238 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 		 236 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4667  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.91 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0950  short chain dehydrogenase  34.93 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.477872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3095  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.27 
 
 		 246 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.025547 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3420  short chain dehydrogenase  34.93 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0769277  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.42 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3287  short chain dehydrogenase  34.93 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.34 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.04 
 
 		 238 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.644121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.81 
 
 		 257 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108701 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.07 
 
 		 261 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.84 
 
 		 230 aa  106  5e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0112  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.09 
 
 		 244 aa  106  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1757  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.06 
 
 		 264 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1738  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.06 
 
 		 264 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.68 
 
 		 280 aa  105  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.434492  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1804  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.06 
 
 		 264 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.390803 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1295  short chain dehydrogenase  33.82 
 
 		 271 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657463  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1745  short chain dehydrogenase  33.68 
 
 		 269 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3735  short chain dehydrogenase  30.04 
 
 		 281 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4481  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  28.28 
 
 		 265 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.643643  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3969  short chain dehydrogenase  33.68 
 
 		 269 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.93 
 
 		 245 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1337  short chain dehydrogenase  34.41 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950533 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.071685 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.63 
 
 		 253 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0213931 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3818  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  31.77 
 
 		 245 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0470155 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1975  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.01 
 
 		 252 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.636697  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1627  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  34.41 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 		 242 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.88898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5072  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 		 285 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.443386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21640  short chain dehydrogenase  35.33 
 
 		 270 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.74 
 
 		 268 aa  103  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0572934  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0249  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.97 
 
 		 258 aa  102  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0279472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.82 
 
 		 245 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.880926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.24 
 
 		 269 aa  102  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 		 247 aa  102  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.269971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.5 
 
 		 246 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.874316 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1494  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 		 239 aa  102  7e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128809  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1844  short chain dehydrogenase  35.33 
 
 		 270 aa  102  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3753  short chain dehydrogenase  35.29 
 
 		 294 aa  102  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1286  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.58 
 
 		 285 aa  102  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0358069  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848764  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.43 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.102966  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2737  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.09 
 
 		 245 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.27 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2848  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.8 
 
 		 246 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.37 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000108862  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3826  short chain dehydrogenase  31.11 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.273342  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6404  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.03 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2705  short chain dehydrogenase  31.44 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.856225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.13 
 
 		 257 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2681  short chain dehydrogenase  31.44 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.56 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0991034  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1051  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.51 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305162  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2590  short chain dehydrogenase  31.44 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.58 
 
 		 252 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2811  short chain dehydrogenase  31.44 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2639  short chain dehydrogenase  31.44 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1462  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.18 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3907  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.6 
 
 		 246 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.267776 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2995  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 		 191 aa  99.8  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1019  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 		 284 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.945266 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.99 
 
 		 262 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.526951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0991  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 		 284 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1009  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 		 284 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.65 
 
 		 248 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.172179  normal  0.840489 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>