More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6452 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6452  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 275 aa  564  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  96.36 
 
 		 275 aa  517  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1201  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.82 
 
 		 289 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6846  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.45 
 
 		 289 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38260  short-chain alcohol dehydrogenase  40.32 
 
 		 305 aa  192  5e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3164  short chain dehydrogenase  39.42 
 
 		 291 aa  156  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3152  short chain dehydrogenase  39.42 
 
 		 294 aa  156  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0242299  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3214  short chain dehydrogenase  39.42 
 
 		 294 aa  156  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.592331  normal  0.549818 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0088  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 		 315 aa  155  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152071 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12160  short chain dehydrogenase  37.6 
 
 		 293 aa  155  9e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.223019  normal  0.712287 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3953  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5417  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.23 
 
 		 306 aa  148  8e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3050  short chain dehydrogenase  36.6 
 
 		 295 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0325921  normal  0.678519 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3477  short chain dehydrogenase  36.6 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.382288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5212  short chain dehydrogenase  34.04 
 
 		 348 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5592  short chain dehydrogenase  34.04 
 
 		 348 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.23191 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5300  short chain dehydrogenase  34.04 
 
 		 348 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.96 
 
 		 306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1700  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 		 301 aa  132  6e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354354  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3121  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.48 
 
 		 284 aa  123  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 		 268 aa  115  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.79 
 
 		 230 aa  108  7.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.52 
 
 		 280 aa  108  9.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.434492  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 		 262 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.526951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2203  short chain dehydrogenase  31.62 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000419362  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5037  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.91 
 
 		 238 aa  107  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 		 267 aa  106  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848764  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0943  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.84 
 
 		 293 aa  106  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3845  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.38 
 
 		 272 aa  106  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0640347  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.59 
 
 		 258 aa  105  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1337  short chain dehydrogenase  31 
 
 		 269 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950533 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.21 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3319  d-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  30.46 
 
 		 256 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0697406  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 		 263 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5072  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.04 
 
 		 285 aa  104  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.443386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.93 
 
 		 269 aa  104  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.85 
 
 		 280 aa  103  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000963224  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1286  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.55 
 
 		 285 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0358069  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.43 
 
 		 264 aa  102  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3108  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.04 
 
 		 255 aa  102  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0809433  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.53 
 
 		 266 aa  102  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3826  short chain dehydrogenase  31.11 
 
 		 234 aa  102  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.273342  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3753  short chain dehydrogenase  31.86 
 
 		 294 aa  102  7e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1051  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.14 
 
 		 245 aa  102  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305162  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2210  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.16 
 
 		 248 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0672798  normal  0.155074 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1244  short chain dehydrogenase  31 
 
 		 270 aa  102  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.542872  normal  0.404553 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1295  short chain dehydrogenase  30.3 
 
 		 271 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12680  short chain dehydrogenase  28.63 
 
 		 278 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.5 
 
 		 253 aa  102  8e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0267314 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 		 261 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1264  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 		 260 aa  102  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1215  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  31.12 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.765065 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.05 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.63 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000302146 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0895  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.16 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0373369 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0991  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.51 
 
 		 284 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3969  short chain dehydrogenase  30.26 
 
 		 269 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1019  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.51 
 
 		 284 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.945266 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1009  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.51 
 
 		 284 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10701  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.93 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1745  short chain dehydrogenase  29.74 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3818  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  28.06 
 
 		 245 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0470155 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1464  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305305  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.2 
 
 		 251 aa  99.8  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.31 
 
 		 285 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0413  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.55 
 
 		 274 aa  99.4  5e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.642509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.96 
 
 		 248 aa  99.4  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.46 
 
 		 262 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.99 
 
 		 267 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.958829  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2590  short chain dehydrogenase  30.15 
 
 		 236 aa  99.4  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0268  ribitol dehydrogenase  30.71 
 
 		 242 aa  99  8e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.245269  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3871  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.05 
 
 		 249 aa  99  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43434  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.69 
 
 		 244 aa  99  8e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.271894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0554  ribitol 2-dehydrogenase  29.46 
 
 		 241 aa  99  8e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.43 
 
 		 274 aa  99  8e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.102966  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1627  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  31.53 
 
 		 271 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 		 267 aa  98.6  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1407  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.29 
 
 		 256 aa  98.6  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 		 248 aa  98.6  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 		 261 aa  98.2  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.745234  normal  0.0404538 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0571  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.08 
 
 		 245 aa  98.6  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.653945  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2753  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 260 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.53957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4257  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.61 
 
 		 262 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.12 
 
 		 265 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4649  short chain dehydrogenase  31.91 
 
 		 261 aa  98.2  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.21279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.79 
 
 		 247 aa  97.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000108862  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1573  short chain dehydrogenase  30.77 
 
 		 257 aa  97.8  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0631529  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3724  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.47 
 
 		 247 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0494  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  28.21 
 
 		 260 aa  97.8  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0088  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  27.23 
 
 		 259 aa  97.8  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.791092  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.47 
 
 		 247 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4500  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  29.95 
 
 		 258 aa  97.4  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0782266 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.37 
 
 		 339 aa  97.8  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3784  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.47 
 
 		 247 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.513657  normal  0.265032 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4933  short chain dehydrogenase  34.03 
 
 		 262 aa  96.7  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.545921 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>